5'-O-[(2-cyano-1-pheylethoxy)carbonyl]-N⁴-{[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]carbonyl}-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)cytidine 3'-(hydrogen butanedioate) | 195881-31-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物
• 英文名称: 5'-O-[(2-cyano-1-pheylethoxy)carbonyl]-N⁴-{[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]carbonyl}-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)cytidine 3'-(hydrogen butanedioate)
• 英文别名: 4-[(2R,3R,4R,5R)-2-[(2-cyano-1-phenylethoxy)carbonyloxymethyl]-4-(4-methoxyoxan-4-yl)oxy-5-[4-[2-(4-nitrophenyl)ethoxycarbonylamino]-2-oxopyrimidin-1-yl]oxolan-3-yl]oxy-4-oxobutanoic acid
• CAS: 195881-31-3
• 化学式: C₃₈H₄₁N₅O₁₆
• 分子量: 823.767
• InChiKey: VIVFVYPYUHNVMN-GVFKKJEISA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.1
• 重原子数：
  59
• 可旋转键数：
  21
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.45
• 拓扑面积：
  277
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  17

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5'-O-[(2-cyano-1-pheylethoxy)carbonyl]-N⁴-{[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]carbonyl}-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)cytidine 3'-(hydrogen butanedioate) 、 5'-O-[(2-cyano-1-phenylethoxy)carbonyl]-N⁴-{[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]carbonyl}-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)cytidine 3'-2-(4-nitrophenyl)ethyl diisopropylphosphoramidite 生成
  参考文献：
  名称：

  核苷酸。LXXIII部分†

  摘要：

  （2-氰基-1-苯基乙氧基）羰基（2c1peoc）基团被开发为通过亚磷酰胺固相合成寡核糖核苷酸的5'-OH功能的新的碱不稳定保护基。通过HPLC研究确定其通过0.1M DBU（1,8-二氮杂双环[5.4.0] undec-7-ene）进行的β消除过程的半衰期为7-14 s。酸不稳定的四氢-4-甲氧基-2 H可保护2'-OH功能-吡喃-4-基（thmp）基团，而2-（4-硝基苯基）乙基（npe）和2-（4-硝基苯基）乙氧羰基（npeoc）基团用于保护碱基和磷酸盐部分。描述了单体构件的合成，亚磷酰胺和核苷官能化的载体，以及通过这种方法的寡核糖核苷酸的积累。

  DOI：

  10.1002/hlca.200390206
• 作为产物：
  描述：

  3-羟基-3-苯基丙腈正离子 在 吡啶 、 N-甲基咪唑 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 11.0h， 生成 5'-O-[(2-cyano-1-pheylethoxy)carbonyl]-N⁴-{[2-(4-nitrophenyl)ethoxy]carbonyl}-2'-O-(tetrahydro-4-methoxy-2H-pyran-4-yl)cytidine 3'-(hydrogen butanedioate)
  参考文献：
  名称：

  The (2-Cyano-1-phenyl)ethoxycarbonyl (CPEOC) Group-A New Protecting Group for Oligoribonucleotide Synthesis

  摘要：

  The (2-cyano-1-phenyl)ethoxycarbonyl (cpeoc) group was developed as a new base-labile protecting group for the 5'-OH function in solid-phase synthesis of oligoribonucleotide by the phosphoramidite approach using the 4-methoxytetrahydropyran-4-yl (mthp) group for 2'-protection. The syntheses of the monomeric building blocks and the first oligoribonucleotides obtained by this approach are described.

  DOI：

  10.1080/07328319708002955