作者:Neeraj N. Patwardhan、Laura R. Ganser、Gary J. Kapral、Christopher S. Eubanks、Janghyun Lee、Bharathwaj Sathyamoorthy、Hashim M. Al-Hashimi、Amanda E. Hargrove
DOI:10.1039/c6md00729e
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dimethylamiloride from a weak TAR ligand to one of the tightest binding selective TAR ligands reported to date through a novel combination of synthetic methods and analytical techniques. We expect these methods to allow for rapid library expansion and tuning of the amiloride scaffold for a range of RNA targets and for SOFAST NMR to allow unprecedented evaluation of small molecule:RNA interactions.
RNA靶向支架的多样化为寻找治疗相关RNA(例如HIV-1 TAR)的选择性配体提供了广阔的前景。我们在此报告了阿米洛利作为一种新型的RNA结合支架,以及合成的C(5)-和C(6)-多样化途径的合成途径的建立。在C(5)-和C(6)位置的迭代修饰产生衍生物24,在肽置换试验中,其活性比母体二甲基阿米洛利提高了100倍。使用2D SOFAST- [ 1 H- 13C] HMQC NMR方法,可以轻松快速地评估所有文库成员的结合模式。化学信息学分析揭示了选择性配体和非选择性配体之间的明显差异。在这项研究中,我们通过合成方法和分析技术的新颖结合,将二甲基阿米洛利从弱的TAR配体演化为迄今为止报道的结合最紧密的选择性TAR配体之一。我们希望这些方法能够快速扩增文库并调整阿米洛利支架的RNA靶标范围,并对SOFAST NMR进行前所未有的小分子与RNA相互作用的评估。