N-benzyloxycarbonyl-4R-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-O-(2-naphthyl)methyl-β-L-arabinofuranosyl]oxy-L-proline benzyl ester | 1451369-69-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-benzyloxycarbonyl-4R-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-O-(2-naphthyl)methyl-β-L-arabinofuranosyl]oxy-L-proline benzyl ester
• 英文别名: dibenzyl (2S,4R)-4-[[(6aS,8S,9R,9aS)-9-(naphthalen-2-ylmethoxy)-2,2,4,4-tetra(propan-2-yl)-6a,8,9,9a-tetrahydro-6H-furo[3,2-f][1,3,5,2,4]trioxadisilocin-8-yl]oxy]pyrrolidine-1,2-dicarboxylate
• CAS: 1451369-69-9
• 化学式: C₄₈H₆₃NO₁₀Si₂
• 分子量: 870.2
• InChiKey: OXNXFDFMOUAXRF-FFGXOIOFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  9.95
• 重原子数：
  61
• 可旋转键数：
  16
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.5
• 拓扑面积：
  111
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  10

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-methylphenyl 3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-1-thio-α-L-arabinofuranoside 、 N-benzyloxycarbonyl-4R-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-O-(2-naphthyl)methyl-β-L-arabinofuranosyl]oxy-L-proline benzyl ester 在 2,3-二氯-5,6-二氰基-1,4-苯醌 作用下， 以 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  延伸蛋白的高度糖基化亲水基团的合成

  摘要：

  Extensin是植物细胞外基质蛋白的结构基序，具有独特的高度糖基化，亲水性和重复性Ser 1 Hyp 4五肽单元，已被提议包括脯氨酸残基的翻译后羟基化和随后的寡L-阿拉伯糖基化羟基脯氨酸的合成以及丝氨酸残基的半乳糖基化。本文报道了一种高度糖基化的基序之一Ser（Galp 1）-Hyp（Araf 4）-Hyp（Araf 4）-Hyp（Araf 3）-Hyp（Araf 1）的立体选择性合成）。通过将2-（萘基）甲醚介导的分子内糖苷配基传递应用于Ser（Galp 1）和Hyp（Araf n）片段的立体选择性构建以及Fmoc固相，完成了合成肽合成为主链五肽。

  DOI：

  10.1002/anie.201404904
• 作为产物：
  描述：

  N-benzyloxycarbonyl-4R-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-β-L-arabinofuranosyl]oxy-L-proline benzyl ester 、 2-溴甲基萘 在 四丁基碘化铵 、 sodium hydride 作用下， 以 N,N-dimethyl-d₆-formamide 为溶剂， 反应 6.0h， 以82%的产率得到N-benzyloxycarbonyl-4R-[3,5-O-(tetraisopropyldisiloxane-1,3-diyl)-2-O-(2-naphthyl)methyl-β-L-arabinofuranosyl]oxy-L-proline benzyl ester
  参考文献：
  名称：

  延伸蛋白的高度糖基化亲水基团的合成

  摘要：

  Extensin是植物细胞外基质蛋白的结构基序，具有独特的高度糖基化，亲水性和重复性Ser 1 Hyp 4五肽单元，已被提议包括脯氨酸残基的翻译后羟基化和随后的寡L-阿拉伯糖基化羟基脯氨酸的合成以及丝氨酸残基的半乳糖基化。本文报道了一种高度糖基化的基序之一Ser（Galp 1）-Hyp（Araf 4）-Hyp（Araf 4）-Hyp（Araf 3）-Hyp（Araf 1）的立体选择性合成）。通过将2-（萘基）甲醚介导的分子内糖苷配基传递应用于Ser（Galp 1）和Hyp（Araf n）片段的立体选择性构建以及Fmoc固相，完成了合成肽合成为主链五肽。

  DOI：

  10.1002/anie.201404904

文献信息

• Stereoselective synthesis of Arabidopsis CLAVATA3 (CLV3) glycopeptide, unique protein post-translational modifications of secreted peptide hormone in plant
  作者：Sophon Kaeothip、Akihiro Ishiwata、Yukishige Ito

  DOI：10.1039/c3ob41212a

  日期：——

  The unique hydroxylproline (Hyp)-linked O-glycan modification is a common process in hydroxyproline-rich glycoproteins (HRGPs). The modification occurs through post-translational hydroxylation at 4-position of proline residues some of which are followed by O-glycosylation at the resulting Hyp which is also found in some secreted peptide hormones such as CLAVATA3 (CLV3) of Arabidopsis thaliana plants. An active mature CLV3 is a tridecapeptide linked to β-L-Araf-(1→2)-β-L-Araf-(1→2)-β-L-Araf at a Hyp residue in the center of the peptide sequence such as Arg-Thr-Val-Hyp-Ser-Gly-Hyp(L-Arafn)-Asp-Pro-Leu-His-His-His (n = 3). We report here the synthesis of the secreted and modified CLV3 glycopeptide with all glycoforms (Araf0–3CLV3) of A. thaliana plants. A highly stereoselective β-arabinofuranosylation of Hyp derivatives as the key step of the synthesis of CLV3 glycopeptide was achieved by NAP ether-mediated IAD, which was effectively applied to the synthesis of oligoarabinosylated hydroxylproline [Hyp(L-Araf1–3)] derivatives. Fmoc-solid phase peptide synthesis was carried out using COMU as the coupling reagent for the introduction of [Hyp(L-Araf0–3)] derivatives as well as further elongation to the CLV3 glycopeptides.

  独特的羟脯氨酸(Hyp)连接的O-糖基化修饰是羟脯氨酸富集糖蛋白(HRGPs)中的常见过程。这种修饰通过在脯氨酸残基的4位进行翻译后羟基化发生，其中一些随后在生成的Hyp上发生O-糖基化，这在一些分泌的肽类激素中也存在，例如拟南芥植物中的CLAVATA3 (CLV3)。成熟的活性CLV3是一个十三肽，与β-L-Araf-(1→2)-β-L-Araf-(1→2)-β-L-Araf在肽序列中心的Hyp残基连接，例如Arg-Thr-Val-Hyp-Ser-Gly-Hyp(L-Arafn)-Asp-Pro-Leu-His-His-His (n = 3)。我们在这里报告了合成所有糖型(Araf0–3CLV3)的拟南芥植物分泌和修饰的CLV3糖肽。通过NAP醚介导的IAD实现了对Hyp衍生物的高度立体选择性β-阿拉伯呋喃糖基化，这是合成CLV3糖肽的关键步骤，并有效地应用于合成寡阿拉伯糖基化羟脯氨酸[Hyp(L-Araf1–3)]衍生物。使用COMU作为偶联试剂，通过Fmoc固相肽合成引入了[Hyp(L-Araf0–3)]衍生物，并进一步延伸至CLV3糖肽。