Fmoc-Ala-Phe-OtBu | 149204-98-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Fmoc-Ala-Phe-OtBu
• 英文别名: Fmoc-L-Ala-L-Phe-O^tBu；FmocAlaPheO^tBu；FmocAFO^tBu
• CAS: 149204-98-8
• 化学式: C₃₁H₃₄N₂O₅
• 分子量: 514.621
• InChiKey: PLIWVUJEYAQXHQ-DCFHFQCYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.98
• 重原子数：
  38.0
• 可旋转键数：
  8.0
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  93.73
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  5.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Fmoc-Ala-Phe-OtBu 在 1-羟基苯并三唑 、 1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺 、 二乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 34.66h， 生成 tert-butyl (6S,7R,10S,13S,16S)-16-benzyl-6-((Z)-6-ethoxy-6-oxohex-2-en-1-yl)-10-isopropyl-2,2,7,13-tetramethyl-4,8,11,14-tetraoxo-3-oxa-5,9,12,15-tetraazaheptadecan-17-oate
  参考文献：
  名称：

  Molecular Insights into Azumamide E Histone Deacetylases Inhibitory Activity

  摘要：

  Azumamide E, a cyclotetrapeptide isolated from the sponge Mycale izuensis, is the most powerful carboxylic acid containing natural histone deacetylase (HDAC) inhibitor known to date. In this paper, we describe design and synthesis of two stereochemical variants of the natural product. These compounds have allowed us to clarify the influence of side chain topology on the HDAC-inhibitory activity. The present contribution also reveals the identity of the recognition pattern between azumamides and the histone deacetylase-like protein (HDLP) model receptor and reports the azumamide E unprecedented isoform selectivity on histone deacetylases class subtypes. From the present studies, a plausible model for the interaction of azumamides with the receptor binding pocket is derived, providing a framework for the rational design of new cyclotetrapeptide-based HDAC inhibitors as antitumor agents.

  DOI：

  10.1021/ja0686256
• 作为产物：
  描述：

  Fmoc-L-丙氨酸 、 L-苯丙氨酸叔丁酯盐酸盐 在 1,2,2,3,4,4六甲基膦1-氧化物 、 苯硅烷 、 C₄₈H₄₀F₁₂N₆O₂Se₂ 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙腈 为溶剂， 以57%的产率得到Fmoc-Ala-Phe-OtBu
  参考文献：
  名称：

  用于肽键形成的双组分氧化还原有机催化剂

  摘要：

  肽是基本的治疗方式，其序列特异性合成可以自动化。然而，现代肽合成仍然不经济，需要过量的偶联剂和受保护的氨基酸才能有效地形成酰胺键。我们最近描述了一种可以对 Fmoc 氨基酸起作用的有机催化剂的合理设计——自动肽合成中的标准单体 ( J. Am. Chem. Soc. 2019 , 141, 15977)。催化循环以羧酸转化为硒代酯为中心，硒代酯被胺偶联的氢键支架激活。硒代酯原位生成由二硒化物催化剂和化学计量的磷化氢制成。尽管先前的系统在固相上催化寡肽合成，但它有两个重要的要求限制了它作为偶联剂的替代品的用途——它依赖于化学计量的磷化氢，并且需要分子筛作为脱水剂。在这里，我们通过一种优化的方法解决了这些限制，该方法只需要催化量的磷化氢，不需要脱水剂。新方法利用双组分有机还原剂/有机氧化剂循环策略来催化酰胺键的形成。

  DOI：

  10.1021/jacs.1c12798

文献信息

• Allenone-Mediated Racemization/Epimerization-Free Peptide Bond Formation and Its Application in Peptide Synthesis
  作者：Zhengning Wang、Xuewei Wang、Penghui Wang、Junfeng Zhao

  DOI：10.1021/jacs.1c04614

  日期：2021.7.14

  peptide synthesis (SPPS). The robustness of the allenone-mediated peptide bond formation was showcased incisively by the synthesis of carfilzomib, which involved a rare racemization-/epimerization-free N to C peptide elongation strategy. Furthermore, the successful synthesis of the model difficult peptide ACP (65–74) on a solid support suggested that this method was compatible with SPPS. This method combines

  Allenone 首次被鉴定为一种高效的肽偶联剂。肽键以α-羰基乙烯基酯为关键中间体形成，其形成和随后的氨解以无外消旋/差向异构化的方式自发进行。丙二烯酮偶联试剂不仅对简单酰胺和二肽的合成有效，而且还适用于肽片段缩合和固相肽合成 (SPPS)。卡非佐米的合成充分展示了丙二烯酮介导的肽键形成的稳健性，该合成涉及一种罕见的无消旋化/差向异构化的 N 到 C 肽延伸策略。此外，在固体支持物上成功合成模型困难肽 ACP (65-74) 表明该方法与 SPPS 兼容。该方法结合了传统活性酯和偶联剂的优点，同时克服了两种策略的缺点。因此，这种丙二烯酮介导的肽键形成策略代表了肽合成的颠覆性创新。
• Water-removable ynamide coupling reagent for racemization-free syntheses of peptides, amides, and esters
  作者：Tao Liu、Xue Zhang、Zejun Peng、Junfeng Zhao

  DOI：10.1039/d1gc03498g

  日期：——

  A novel ynamide coupling reagent, the by-product of which can be removed by water, was reported. It promotes the direct coupling between carboxylic acids and amines, alcohols or thiols to provide amides, peptides, esters and thioesters, respectively. No detectable racemization was observed for all the coupling reactions of carboxylic acids containing an α-chiral center. Importantly, a simple acidic

  报道了一种新型 ynamide 偶联剂，其副产物可以通过水去除。它促进羧酸与胺、醇或硫醇之间的直接偶联，分别提供酰胺、肽、酯和硫酯。对于含有α-手性中心的羧酸的所有偶联反应，均未观察到可检测的外消旋化。重要的是，简单的酸性水溶液后处理很容易去除副产物，无需使用柱色谱即可获得产率良好至极好的纯偶联产物，从而使该方法更加环保、用户友好且更具成本效益。卡非佐米的外消旋化/无差向异构化合成进一步证明了可去除水的 ynamide 偶联试剂的稳健性，
• Rational Design of an Organocatalyst for Peptide Bond Formation
  作者：Handoko、Sakilam Satishkumar、Nihar R. Panigrahi、Paramjit S. Arora

  DOI：10.1021/jacs.9b07742

  日期：2019.10.9

  important impact by reducing the significant waste generated during peptide synthesis. We describe the rational design of a biomimetic catalyst that can efficiently couple amino acids featuring standard protecting groups. The catalyst design combines lessons learned from enzymes, peptide biosynthesis, and organocatalysts. Under optimized conditions, 5 mol% catalyst efficiently couples Fmoc amino acids

  酰胺键普遍存在于肽、蛋白质、药物和聚合物中。酰胺键的形成是一个相对简单的过程：由于有效偶联剂的可用性，可以相对容易地合成酰胺键。然而，对于不需要过量试剂的方法存在实质性需求。缩合氨基酸的催化剂可以通过减少肽合成过程中产生的大量废物产生重要影响。我们描述了一种仿生催化剂的合理设计，该催化剂可以有效地偶联具有标准保护基团的氨基酸。催化剂设计结合了从酶、肽生物合成和有机催化剂中吸取的经验教训。在优化条件下，5 mol% 的催化剂可以有效地偶联 Fmoc 氨基酸，而不会发生显着的外消旋化。显着地，我们证明该催化剂可用于在固相上合成寡肽。这个结果很重要，因为它说明了催化剂在具有大量酰胺键的基材上发挥作用的潜力，这可能会抑制氢键催化剂。
• 一种水溶性炔酰胺缩合剂及其制备方法和应用
  申请人：江西师范大学

  公开号：CN112341423A

  公开（公告）日：2021-02-09

  本发明公开了一种水溶性炔酰胺缩合剂及其在酰胺、多肽、酯和硫酯类化合物合成中的应用方法。该类炔酰胺缩合剂具有较好的性能，能够高效方便地促成酰胺键与酯键的形成，羧酸的α‑手性中心在反应过程中不会发生消旋，羧酸的活化和后续的酰胺化反应都可以自发进行，无需额外的添加剂和催化剂。酰胺化和酯化反应结束后，反应副产物和过量的炔酰胺缩合剂通过弱酸性水溶液处理即可转化为能够溶于水的物质，然后经过萃取和/或重结晶即可获得高纯度的产物。整个流程操作简单，具有纯化方便、应用范围广、经济环保的特点，符合现代化学中绿色化学的方向，具有广阔的应用前景。
• One-pot Deprotection and Coupling of Peptides by the Fmoc Strategy
  作者：Masaaki Ueki、Naohiko Nishigaki、Hiroko Aoki、Takeshi Tsurusaki、Tsuyoshi Katoh

  DOI：10.1246/cl.1993.721

  日期：1993.4

  9-Fluorenylmethyloxycarbonyl (Fmoc) group can be quickly removed with tetrabutylammonium fluoride hydrate (TBAF·xH2O) in the presence of a large excess of phenylmethanethiol or 1-octanethiol. Subsequent oxidation of the thiol with bis(1-methyl-1H-tetrazol-5-yl) disulfide simultaneously inactivated the TBAF and enabled one-pot peptide bond elongation by the Fmoc strategy.

  在大量过量的苯基甲硫醇或1-辛硫醇存在下，可以用四丁基氟化铵水合物(TBAF·xH2O)快速除去9-芴基甲氧基羰基(Fmoc)基团。随后用双(1-甲基-1H-四唑-5-基)二硫化物氧化硫醇，同时使 TBAF 失活，并通过 Fmoc 策略实现一锅肽键伸长。