3-(benzyloxymethyl)-1-[2,3,5-tri-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribo-pentofuranosyl]uracil | 1332758-04-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3-(benzyloxymethyl)-1-[2,3,5-tri-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribo-pentofuranosyl]uracil
• 英文别名: 2',3',5'-tris(O-tert-butyldimethylsilyl)-3-(benzyloxymethyl)uridine；1-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]-3-(phenylmethoxymethyl)pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 1332758-04-9
• 化学式: C₃₅H₆₂N₂O₇Si₃
• 分子量: 707.143
• InChiKey: PMMOTJVFLKYXPR-PMFUCWTESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7.88
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  15
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.71
• 拓扑面积：
  86.8
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(benzyloxymethyl)-1-[2,3,5-tri-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribo-pentofuranosyl]uracil 在 1,4-环己二烯 、 palladium 10% on activated carbon 、 (-)-1,2-bis-((2R,5R)-2,5-dimethylphospholano)benzene-(cyclooctadiene)rhodium(I) tetrafluoroborate 、 氢气 、 双(三甲基硅烷基)氨基钾 、 钯 、 正丁胺 、 三氟乙酸 、 2-碘酰基苯甲酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 水 、 甲苯 、 乙腈 为溶剂， -78.0~80.0 ℃ 、100.0 kPa 条件下， 反应 252.5h， 生成 tert-butyl (2R)-3-[(2R,3R,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]-2-[3-[[(2S)-4-methyl-2-(phenylmethoxycarbonylamino)pentanoyl]amino]propylamino]propanoate
  参考文献：
  名称：

  尿嘧啶核苷氨基酸的立体选择性合成

  摘要：

  构想并合成了5'-脱氧尿苷和甘氨酸的新型杂合结构。此类核苷氨基酸（NAA）代表穆来霉素核苷抗生素核心结构的简化类似物，使其成为结构与活性关系（SAR）研究的有用合成构件。已开发的合成路线的关键步骤是将二脱氢氨基酸前体高效且高度非对映选择性地不对称氢化成受保护的NAA。预期通过该途径合成未保护的穆雷霉素衍生物将需要在尿嘧啶碱基的N-3处具有合适的中间保护基。在最初尝试使用PMB-和BOM-N-3保护后，这两个步骤都导致了脱保护步骤的问题，然后构想出N-3无保护基团的路线。尽管尿嘧啶-3-NH具有明显的酸性，但该途径与涉及N-3保护的初始策略一样有效，立体选择性也相同。所获得的NAA构件被用于合成截短的5'-脱氧村霉素类似物。

  DOI：

  10.1021/jo201935w
• 作为产物：
  描述：

  苄基氯甲基醚 、 2',3',5'-tris-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 、 mineral oil 为溶剂， 反应 5.0h， 以87%的产率得到3-(benzyloxymethyl)-1-[2,3,5-tri-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-ribo-pentofuranosyl]uracil
  参考文献：
  名称：

  尿嘧啶核苷氨基酸的立体选择性合成

  摘要：

  构想并合成了5'-脱氧尿苷和甘氨酸的新型杂合结构。此类核苷氨基酸（NAA）代表穆来霉素核苷抗生素核心结构的简化类似物，使其成为结构与活性关系（SAR）研究的有用合成构件。已开发的合成路线的关键步骤是将二脱氢氨基酸前体高效且高度非对映选择性地不对称氢化成受保护的NAA。预期通过该途径合成未保护的穆雷霉素衍生物将需要在尿嘧啶碱基的N-3处具有合适的中间保护基。在最初尝试使用PMB-和BOM-N-3保护后，这两个步骤都导致了脱保护步骤的问题，然后构想出N-3无保护基团的路线。尽管尿嘧啶-3-NH具有明显的酸性，但该途径与涉及N-3保护的初始策略一样有效，立体选择性也相同。所获得的NAA构件被用于合成截短的5'-脱氧村霉素类似物。

  DOI：

  10.1021/jo201935w

文献信息

• Total Synthesis of Pacidamycin D by Cu(I)-Catalyzed Oxy Enamide Formation
  作者：Kazuya Okamoto、Masahiro Sakagami、Fei Feng、Hiroko Togame、Hiroshi Takemoto、Satoshi Ichikawa、Akira Matsuda

  DOI：10.1021/ol202124b

  日期：2011.10.7

  The first total synthesis of pacidamycin D, which is expected to be a good candidate as an antibacterial agent against P. aeruginosa, is described. The key elements of our approach feature an efficient and stereocontrolled construction of the Z-oxyvinyl iodide and copper-catalyzed cross-coupling with the tetrapeptide carboxamide.