1-tert-butoxycarbonylmethyl-O4-(o-nitrophenyl)thymine | 272788-86-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 1-tert-butoxycarbonylmethyl-O4-(o-nitrophenyl)thymine
• 英文别名: 1-tert-butoxycarbonylmethyl-O⁴-(o-nitrophenyl)thymine
• CAS: 272788-86-0
• 化学式: C₁₇H₁₉N₃O₆
• 分子量: 361.354
• InChiKey: IYVFXLRVNZXUMP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.59
• 重原子数：
  26.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.35
• 拓扑面积：
  113.56
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  8.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-tert-butoxycarbonylmethyl-O4-(o-nitrophenyl)thymine 在 吡啶 、 氨 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 112.67h， 生成 N⁴-benzoyl-1-carboxymethyl-5-methylcytosine
  参考文献：
  名称：

  携带5-溴尿嘧啶和5-甲基胞嘧啶的DNA-PNA嵌合体的合成和杂交特性。

  摘要：

  描述了5-溴尿嘧啶和5-甲基胞嘧啶肽核酸（PNA）单体的制备。这些PNA单体用于制备几种DNA-PNA嵌合体，并描述了它们的杂交特性。DNA-PNA嵌合体中5-甲基胞嘧啶取代胞嘧啶可增加双链体稳定性，而5-溴尿嘧啶取代胸腺嘧啶则可保持双链体稳定性。而且，研究了DNA-PNA嵌合体与双链DNA的结合以形成三重螺旋。与DNA相反，DNA-PNA嵌合体中5-甲基胞嘧啶和5-溴尿嘧啶的存在使三重螺旋不稳定。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(99)00308-9
• 作为产物：
  描述：

  胸腺嘧啶 在 4-二甲氨基吡啶 、 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯 、 三乙胺 、 2,4,6-三甲基苯甲酰氯 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 1-tert-butoxycarbonylmethyl-O4-(o-nitrophenyl)thymine
  参考文献：
  名称：

  携带5-溴尿嘧啶和5-甲基胞嘧啶的DNA-PNA嵌合体的合成和杂交特性。

  摘要：

  描述了5-溴尿嘧啶和5-甲基胞嘧啶肽核酸（PNA）单体的制备。这些PNA单体用于制备几种DNA-PNA嵌合体，并描述了它们的杂交特性。DNA-PNA嵌合体中5-甲基胞嘧啶取代胞嘧啶可增加双链体稳定性，而5-溴尿嘧啶取代胸腺嘧啶则可保持双链体稳定性。而且，研究了DNA-PNA嵌合体与双链DNA的结合以形成三重螺旋。与DNA相反，DNA-PNA嵌合体中5-甲基胞嘧啶和5-溴尿嘧啶的存在使三重螺旋不稳定。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(99)00308-9