Tri-O-acetyl-α-D-arabinopyranosylamin | 53784-63-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Tri-O-acetyl-α-D-arabinopyranosylamin
• 英文别名: [(3R,4R,5S,6S)-4,5-diacetyloxy-6-aminooxan-3-yl] acetate
• CAS: 53784-63-7
• 化学式: C₁₁H₁₇NO₇
• 分子量: 275.258
• InChiKey: GITCHZVOIYKCQI-ZNSHCXBVSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.1
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  114
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Tri-O-acetyl-α-D-arabinopyranosylamin 在 sodium azide 、 palladium on activated charcoal 、 氢气 作用下， 以 二氯甲烷 、 水 、 丙酮 为溶剂， 反应 48.0h， 生成 1-N-(2,3,4-tri-O-acetyl-α-D-arabinopyranosyl)-N''-(n-octyl)thioureidoacetamide
  参考文献：
  名称：

  硫脲和脲连接的糖脂作为低分子量水凝胶剂的合成与表征†

  摘要：

  通过使糖基氨基乙酰胺与烷基异硫氰酸酯和异氰酸酯反应，已经合成了具有硫脲和脲连接基的新型糖脂作为低分子量胶凝剂。研究了连接基团对其自组装性能的影响。对获得的新糖脂在各种溶剂中的胶凝研究表明，它们是良好的水凝剂。与硫脲连接的糖脂相比，尿素连接的糖脂显示出更好的水凝胶化能力。还研究了糖首基和烷基链长对糖脂自组装的影响。超分子水凝胶的原纤维结构已经通过扫描电子显微镜（SEM）表征。由尿素连接的糖脂形成的水凝胶的热性质已通过差示扫描量热法（DSC）和VT-NMR进行了研究。已经通过小角度（SAXS）和单晶X射线衍射方法研究了分子堆积。

  DOI：

  10.1039/c3ra42041h
• 作为产物：
  描述：

  2,3,4-Tri-O-acetyl-α-D-arabinopyranosyl azide 在 palladium on activated charcoal 、 氢气 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 Tri-O-acetyl-α-D-arabinopyranosylamin
  参考文献：
  名称：

  硫脲和脲连接的糖脂作为低分子量水凝胶剂的合成与表征†

  摘要：

  通过使糖基氨基乙酰胺与烷基异硫氰酸酯和异氰酸酯反应，已经合成了具有硫脲和脲连接基的新型糖脂作为低分子量胶凝剂。研究了连接基团对其自组装性能的影响。对获得的新糖脂在各种溶剂中的胶凝研究表明，它们是良好的水凝剂。与硫脲连接的糖脂相比，尿素连接的糖脂显示出更好的水凝胶化能力。还研究了糖首基和烷基链长对糖脂自组装的影响。超分子水凝胶的原纤维结构已经通过扫描电子显微镜（SEM）表征。由尿素连接的糖脂形成的水凝胶的热性质已通过差示扫描量热法（DSC）和VT-NMR进行了研究。已经通过小角度（SAXS）和单晶X射线衍射方法研究了分子堆积。

  DOI：

  10.1039/c3ra42041h

文献信息

• Synthesis and X-ray crystallographic investigation of N-(α-d-arabinopyranosyl)alkanamides as N-glycoprotein linkage region analogs
  作者：Amrita Srivastava、Babu Varghese、Duraikkannu Loganathan

  DOI：10.1016/j.carres.2013.07.014

  日期：2013.10

  N-Glycoprotein linkage region constituents namely 2-deoxy-2-acetamido-beta-D-glucopyranose (GlcNAc) and asparagine (Asn) are conserved among all eukaryotes. Earlier crystallographic studies on the linkage region conformation revealed that among all the models and analogs of the N-glycoprotein linkage region, Xyl beta NHAc showed maximum deviation in the phi(N) value as compared to the value reported for the model compound, GlcNAc beta NHAc. In order to understand the effect of another pentopyranose, viz., arabinose, on the N-glycosidic torsion angles and molecular assembly, three arabinopyranosyl alkanamides were synthesized and their X-ray crystal structures elucidated. A comparative analysis of the N-glycosidic torsion, phi(N) of the three analogs revealed the greater rotational freedom around the C1-N1 bond as compared to the GlcNAc derivatives. Molecular assembly of propionamido and chloroacetamido derivatives is characterized by the presence of anti-parallel bilayers of the molecules. This unique molecular assembly is hitherto unknown in all other models and analogs of N-glycoprotein linkage region. This study reveals that N-glycosidic torsions are influenced by the glycan as well as molecular packing. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.