2N-(N,N-dimethylaminomethylidene)-9-formyl-1N-(pivaloyloxy)methyl-9-deazaguanine | 913614-56-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吡咯并嘧啶类
• 英文名称: 2N-(N,N-dimethylaminomethylidene)-9-formyl-1N-(pivaloyloxy)methyl-9-deazaguanine
• 英文别名: [2-(dimethylaminomethylideneamino)-7-formyl-4-oxo-5H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-3-yl]methyl 2,2-dimethylpropanoate
• CAS: 913614-56-9
• 化学式: C₁₆H₂₁N₅O₄
• 分子量: 347.374
• InChiKey: CZCWUYCIFPCERF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  107
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2N-(N,N-dimethylaminomethylidene)-9-formyl-1N-(pivaloyloxy)methyl-9-deazaguanine 、 三羟甲基氨基甲烷 在 sodium cyanoborohydride 、 乙酰氯 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以49%的产率得到{7-[(1,3-dihydroxypropan-2-ylamino)methyl]-2-[(dimethylamino)methyleneamino]-4-oxo-4,5-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-3-yl}methyl 2,2-dimethylpropanoate
  参考文献：
  名称：

  第三代免疫球蛋白：人嘌呤核苷磷酸化酶无环免疫球蛋白抑制剂的合成和生物活性

  摘要：

  ImmH ( 1 ) 和 DADMe-ImmH ( 2 ) 是人类嘌呤核苷磷酸化酶 (PNP) 的强效抑制剂，由我们开发，目前正在进行临床试验，用于治疗多种 T 细胞相关疾病。化合物1和2被用作设计和合成一系列无环免疫球蛋白类似物 ( 8 - 38 ) 的模板，以识别1和2 的简化替代品。SerMe-ImmG ( 8 ) 和 DATMe-ImmG ( 9 ) 相对于 PNP 显示出最低的抑制常数，分别为 2.1 和 3.4 pM。假设8和9使他们能够在 PNP 的活性位点内采用类似于1和2 的构象，并且两个羟基的定位对于皮摩尔活性至关重要。SerMe-ImmH ( 10 , K d = 5.2 pM) 被证明在小鼠体内可口服，在血液 PNP 上的生物停留时间很长。

  DOI：

  10.1021/jm801421q
• 作为产物：
  描述：

  一氧化碳 、 2-{[(dimethylamino)methylidene]amino}-3,5-dihydro-7-iodo-3-[(pivaloyloxy)methyl]-4H-pyrrolo[3,2-d]pyrimidin-4-one 在 tris-(dibenzylideneacetone)dipalladium(0) 、 三正丁基氢锡 、 三苯基膦 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 2.0h， 以81%的产率得到2N-(N,N-dimethylaminomethylidene)-9-formyl-1N-(pivaloyloxy)methyl-9-deazaguanine
  参考文献：
  名称：

  Trimeric purine nucleoside phosphorylase: Exploring postulated one-third-of-the-sites binding in the transition state

  摘要：

  Transition-state analogue inhibitors, immucillins, were reported to bind to trimeric purine nucleoside phosphorylase (PNP) with the stoichiometry of one molecule per enzyme trimer [ Miles, R. W.; Tyler, P. C.; Furneaux, R. H.; Bagdassarian, C. K.; Schramm, V. L. Biochem. 1998, 37, 8615]. In attempts to observe and better understand the nature of this phenomenon we have conducted calorimetric titrations of the recombinant calf PNP complexed with immucillin H. However, by striking contrast to the earlier reports, we have not observed negative cooperativity and we got the stoichiometry of three immucillin molecules per enzyme trimer. Similar results were obtained from fluorimetric titrations, and for other inhibitors bearing features of the transition state. However, we observed apparent cooperativity between enzyme subunits and apparent lower stoichiometry when we used the recombinant enzyme not fully purified from hypoxanthine, which is moped from Escherichia coli cells. Results presented here prove that one-third-of-the-sites binding does not occur for trimeric PNP, and give the highly probable explanation why previous experiments were interpreted in terms of this phenomenon. (C) 2012 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2012.08.045