合成了三种新的
菲啶肽衍
生物(19、22 和 23),以探索它们作为 DNA 和 RNA 分光光度探针的潜力。紫外/可见光和圆二色性 (CD) 光谱、质谱和计算分析证实所有三种化合物都存在分子内相互作用。计算分析表明,化合物在弯曲构象和开放构象之间交替,突出了后者对成功的多核苷酸识别的关键影响。与含有两个甘
氨酸的化合物 (19) 相比,在两种区域异构体 (22, 23) 中用赖
氨酸取代一个甘
氨酸可产生更强的与 DNA 和 RNA 的结合相互作用,从而强调了赖
氨酸的重要性。赖
氨酸更接近
菲啶环(23)的区域异构体表现出与非交替AT和A
TT多核苷酸的双重选择性荧光响应,并诱导从AT双链体形成三链体。与 AT 和 A
TT 多核苷酸相互作用获得的最佳结合常数 (K) 值为 2.5 × 107 M−1。此外,除了区分不同类型的 ds-DNA 和 ds-RNA 之外,同一化合物还可以通过不同的诱导 CD 信号识别富含