5-((1H-indol-3-yl)methylene)-1-methyl-2-thioxodihydropyrimidine-4,6(1H,5H)-dione | 352341-45-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 5-((1H-indol-3-yl)methylene)-1-methyl-2-thioxodihydropyrimidine-4,6(1H,5H)-dione
• 英文别名: N-methyl-5-(3-indolydene)-2-thiobarbituric acid；5-(1H-indol-3-ylmethylidene)-1-methyl-2-sulfanylidene-1,3-diazinane-4,6-dione
• CAS: 352341-45-8
• 化学式: C₁₄H₁₁N₃O₂S
• 分子量: 285.326
• InChiKey: JAEFLVKCBWNJSP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.42
• 重原子数：
  20.0
• 可旋转键数：
  1.0
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.07
• 拓扑面积：
  65.2
• 氢给体数：
  2.0
• 氢受体数：
  3.0

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  3-吲哚甲醛 、 1-methyl-2-thioxodihydropyrimidine-4,6(1H,5H)-dione 以 乙醇 、 水 为溶剂， 以52.1%的产率得到5-((1H-indol-3-yl)methylene)-1-methyl-2-thioxodihydropyrimidine-4,6(1H,5H)-dione
  参考文献：
  名称：

  作为有效的p300 / CBP抑制剂的硫代巴比妥衍生物的发现和生物学评估

  摘要：

  组蛋白乙酰转移酶（HATs）通过优先使组蛋白上赖氨酸残基的ε-氨基乙酰化来缓解转录抑制。HAT的失调与几种疾病（尤其是癌症）的病因密切相关，因此突出了开发针对该潜在治疗靶点的小分子抑制剂的最重要意义。在本研究中，通过虚拟筛选和迭代优化，我们将DCH36_06鉴定为真正有效的p300 / CBP抑制剂。DCH36_06介导的p300 / CBP抑制导致白血病细胞中H3K18的低乙酰化。p300 / CBP活性的抑制可阻止几种白血病细胞系中的细胞增殖。此外，DCH36_06在G1期阻止了细胞周期，并通过激活capase3诱导了细胞凋亡，caspase9和PARP阐明了其抗增殖活性的分子机制。在转录组分析中，DCH36_06改变了下游基因表达，并通过实时PCR验证了凋亡通路相关基因。重要的是，DCH36_06阻断了小鼠白血病异种移植物的生长，从而支持了其潜在的抗癌作用。体内使用为p300 / C

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2018.07.048

文献信息

• Inhibitors of the NAD⁺-Dependent Protein Desuccinylase and Demalonylase Sirt5
  作者：Benjamin Maurer、Tobias Rumpf、Michael Scharfe、Diana A. Stolfa、Martin L. Schmitt、Wenjuan He、Eric Verdin、Wolfgang Sippl、Manfred Jung

  DOI：10.1021/ml3002709

  日期：2012.12.13

  NAD(+)-dependent histone deacetylases (sirtuins) play important roles in epigenetic regulation but also through nonhistone substrates for other key cellular events and have been linked to the pathogenesis of cancer, neuro-degeneration, and metabolic diseases. The subtype Sirt5 has been shown recently to act as a desuccinylating and demalonylating enzyme. We have established an assay for biochemical testing of Sirt5 using a small labeled succinylated lysine derivative. We present a comparative study on the profiling of several established sirtuin inhibitors on Sirt1-3 as well as Sirt5 and also present initial results on a screening for new compounds that block Sirt5. Thiobarbiturates were identified as new Sirt5 inhibitors in the low micromolar range, which are selective over Sirt3 that can be found in the same cell compartment as Sirt5.