sorbyl pentinoate | 1154411-41-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: sorbyl pentinoate
• 英文别名: pent-4-ynoic acid hexa-2,4-dienyl ester
• CAS: 1154411-41-2
• 化学式: C₁₁H₁₄O₂
• 分子量: 178.231
• InChiKey: OUZFLHKKGRCPJO-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  259.1±23.0 °C(Predicted)
• 密度：
  0.965±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.08
• 重原子数：
  13.0
• 可旋转键数：
  5.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  26.3
• 氢给体数：
  0.0
• 氢受体数：
  2.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  sorbyl pentinoate 、 碘苷 在 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 三乙胺 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 22.0h， 以39%的产率得到hexa-2,4-dien-1-yl 5-(1-((2R,4S,5R)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)tetrahydrofuran-2-yl)-2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)pent-4-ynoate
  参考文献：
  名称：

  修饰的脱氧尿苷三磷酸的合成和酶促掺入†

  摘要：

  我们描述了 2'-脱氧尿苷-5'-三磷酸 衍生产品，在其位置5处带有变化的长度，体积和柔韧性的连接子 嘧啶根据。具有末端官能团的核苷酸类似物由于其在DNA链的功能标记中的应用潜力而受到关注。在核苷酸类似物的合成过程中，对吉川磷酸化方法的方法进行了优化，从而产生了一种减少副产物量并与连接至碱基的不稳定官能团兼容的方法。使用两种不同的DNA聚合酶系统地研究了接头组成对酶促掺入DNA的影响。的Deep Vent ř外切-从B-聚合酶家族接受最核苷酸类似物作为底物，而Taq酶从A家族稍低精通。两种聚合酶均难以整合5-（3-氨基-丙-1-炔基）-2'-脱氧尿苷三磷酸。聚合酶活性位点的分子模型用于合理化为什么不将该核苷酸作为底物接受的原因。

  DOI：

  10.1039/b906956a