5,5-dimethyl-2-oxohexanoic acid | 107872-85-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 酮酸及其衍生物
• 英文名称: 5,5-dimethyl-2-oxohexanoic acid
• 英文别名: Ncap-OH；Ncap；2-oxo-5,5-dimethylhexanoic acid
• CAS: 107872-85-5
• 化学式: C₈H₁₄O₃
• mdl: MFCD20639673
• 分子量: 158.197
• InChiKey: XOBCNMHHIDUDSZ-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  222.8±9.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.038±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.7
• 重原子数：
  11
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.75
• 拓扑面积：
  54.4
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-amino-pent-4-ynoic acid tert-butyl ester 、 5,5-dimethyl-2-oxohexanoic acid 在 N-乙基吗啉 、 1-羟基苯并三唑 、 N,N'-二异丙基碳二亚胺 作用下， 以 四氢呋喃 为溶剂， 反应 14.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  聚乙酰胺模拟物的双重化学修饰：具有强细胞毒性的离子通道形成48-mer肽的合理设计和合成

  摘要：

  Polytheonamide B（1）是一种天然肽，对P388小鼠白血病细胞表现出强大的细胞毒性（IC 50 = 0.098 n m）。已知线性48-mer 1在与脂质双层结合时会形成单价阳离子通道。我们之前开发了1的完全合成路线，然后实现了结构简化的1的类似物的设计和合成，即dansylated polytheonamide mimic 2。尽管发现合成上更容易接近的2模仿了1的通道功能，但其细胞毒性却降低了120倍。本文中，七种类似物的化学制备和生物学评价报告了3 – 9（共2）。化合物3 - 9在它们的N末端和/或残基44的侧链进行了修改2，以改变它们的物理化学性质。的全合成3 - 9是由固相和溶液相化学的组合以统一的方式来完成的。对疏水性，单通道电流，离子交换活性和3 – 9的细胞毒性的系统评价表明，它们的疏水性与离子交换的总强度相关，并确定其细胞毒性潜能。因此，最疏水的类似物9具有最低的IC

  DOI：

  10.1002/chem.201504632
• 作为产物：
  描述：

  ethyl 2-oxo-5,5-dimethylhexanoate 在 水 、 lithium hydroxide 作用下， 以100%的产率得到5,5-dimethyl-2-oxohexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Total synthesis of the large non-ribosomal peptide polytheonamide B

  摘要：

  聚糖酰胺 B 是目前已知的最大的非核糖体肽，具有非凡的细胞毒性（EC50 = 68 pg mlâ1, 小鼠白血病 P388 细胞）。它的 48 个氨基酸残基包括多种非蛋白原性 d 和 l 氨基酸，这些氨基酸的绝对立体化学结构依次交替。这些结构特征促使形成稳定的δ-strand 型结构，从而形成长度超过 30 Ã 的整体管状结构。在生物环境中，这种折叠结构被认为可以通过一个孔隙在脂质双分子层中运输阳离子，从而起到离子通道的作用。在此，我们首次报告了聚神酰胺 B 的化学结构。我们的合成依赖于四个关键阶段的结合：非蛋白源氨基酸的合成、聚草酰胺 B 四个片段的固相组装、银介导的片段连接以及最后的全局脱保护。现在可用的合成材料将有助于研究其构象特性、通道功能和细胞毒性之间的关系。聚神酰胺 B 是一种大型非核糖体多肽，具有极高的生物活性。本文描述的合成包括首次制备几种非蛋白源氨基酸和大型非天然肽的一般偶联策略。该合成是了解和利用该化合物及类似化合物生物活性的关键一步。

  DOI：

  10.1038/nchem.554

文献信息

• Solid-Phase Total Synthesis and Dual Mechanism of Action of the Channel-Forming 48-mer Peptide Polytheonamide B
  作者：Atsushi Hayata、Hiroaki Itoh、Masayuki Inoue

  DOI：10.1021/jacs.8b06755

  日期：2018.8.22

  unusual residues significantly heightened the synthetic challenges, impeding the solid-phase peptide synthesis (SPPS) of 1. In this study, we first addressed the synthesis problem by extensive optimization of various factors of the SPPS. Adaptation of a new protective group strategy allowed for elongation of a 37-mer peptide on resin, to which an N-terminal 11-mer fragment was condensed. Removal of the

  Polytheonamide B (1) 由于其极其复杂的结构、体外通道形成能力和极强的细胞毒性，是一种独特的肽天然产物。1 的 48 聚体序列包含交替的 d,l-氨基酸，并拥有一系列空间庞大的 β-四取代和氢键形成残基。据信，这些不寻常的结构特征驱动 1 折叠成 4.5 nm 长的管，在质膜上形成跨膜离子通道，并发挥细胞毒性。然而，尽管其潜在的生物学应用，这些不寻常的残基的多次取代显着增加了合成挑战，阻碍了 1 的固相肽合成 (SPPS)。在这项研究中，我们首先通过广泛优化各种因素来解决合成问题。 SPPS。新的保护组策略的适应允许树脂上的 37 聚体肽延长，N 端 11 聚体片段缩合到树脂上。去除 18 个保护基团和树脂以优异的总产率产生了 1 个（4.5%，从 17 个步骤开始 76 个步骤）。SPPS 协议在操作上很简单，并且被证明很容易适应荧光 48 聚体探针 2 的全合成。合成
• Structural Permutation of Potent Cytotoxin, Polytheonamide B: Discovery of Cytotoxic Peptide with Altered Activity
  作者：Hiroaki Itoh、Masayuki Inoue

  DOI：10.1021/ml300264c

  日期：2013.1.10

  Polytheonamide B (1) is an ion-channel forming natural peptide with a d,l-alternating 48 amino acid sequence, which is an exceedingly potent cytotoxin. We recently designed and synthesized a simplified dansylated polytheonamide mimic 2, in which six amino acid residues were modified from 1, and demonstrated that 2 emulated the functions of 1. Here we report a comprehensive structure–activity relationship

  Polytheonamide B ( 1 ) 是一种形成离子通道的天然肽，具有d , l -交替的 48 个氨基酸序列，是一种非常有效的细胞毒素。我们最近设计并合成了一种简化的丹磺酰化聚乙烯酰胺模拟物2，其中 6 个氨基酸残基由1修饰而成，并证明2模拟了1的功能。在这里，我们报告了2子结构的综合构效关系研究。开发了一种统一的合成策略，用于高度自动化合成 13 个 27 至 39 个氨基酸残基的肽序列，以及人工 37-mer 肽6被发现对 P388 小鼠白血病细胞的毒性明显高于其他 12 种化合物 (IC 50 = 3.7 nM)。6使用脂质体和 P388 细胞的离子交换活性实验均证明6不具有离子通道活性，强烈表明6通过与1和2不同的作用模式发挥其有效的细胞毒性。
• Functional Analysis of Synthetic Substructures of Polytheonamide B: A Transmembrane Channel-Forming Peptide
  作者：Shigeru Matsuoka、Naoki Shinohara、Tomoaki Takahashi、Maiko Iida、Masayuki Inoue

  DOI：10.1002/anie.201101533

  日期：2011.5.16

  Longer is better: Polytheonamide B, the largest nonribosomal linear peptide identified to date, is a transmembrane channel‐forming peptide. Nine of its substructures have now been chemically synthesized. The membrane‐disrupting and ion‐channel‐forming sequences as well as the cytotoxicity‐enhancing sequence have been identified.

  越长越好： Polytheonamide B是迄今为止鉴定出的最大的非核糖体线性肽，是一种跨膜通道形成肽。现在已经化学合成了其9个亚结构。已经确定了破坏膜和形成离子通道的序列以及增强细胞毒性的序列。
• The effect of sulfur stereochemistry of l-β,β-dimethylmethionine S-oxide on the physicochemical properties of truncated polytheonamides
  作者：Shigeru Matsuoka、Yuki Mizoguchi、Hiroaki Itoh、Ken Okura、Naoki Shinohara、Masayuki Inoue

  DOI：10.1016/j.tetlet.2010.06.126

  日期：2010.9

  l-β,β-Dimethylmethionine S-oxide is a unique amino acid found in polytheonamides. Four designed hexapeptides containing the sulfide, (SR)-sulfoxide, (SS)-sulfoxide, and sulfone derivatives of l-dimethylmethionine were synthesized and functionally analyzed. Our results indicate that the sulfoxide stereochemistry of the peptides controls their overall physicochemical properties.

  1 -β，β-二甲基甲硫氨酸S-氧化物是一种在聚乙酰胺中发现的独特氨基酸。合成了四个设计的六肽，它们含有硫化物，（S R）-亚砜，（S S）-亚砜和1-二甲基甲硫氨酸的砜衍生物，并对其功能进行了分析。我们的结果表明，肽的亚砜立体化学控制着它们的整体物理化学特性。
• METHOD FOR PREPARING OPTICALLY ACTIVE AMINO ACID USING COSUBSTRATE SHUTTLING OF TRANSAMINASE
  申请人：INDUSTRY-ACADEMIC COOPERATION FOUNDATION, YONSEI UNIVERSITY

  公开号：US20150284750A1

  公开（公告）日：2015-10-08

  The present disclosure relates to a method for preparing an optically active amino acid using cosubstrate shuttling of transaminase. The method includes coupling a reaction of converting a keto acid to an amino acid by α-transaminase and a reaction of transferring an amino group of an amine substrate by ω-transaminase (TA) using an amino acid cosubstrate. The present disclosure allows production of various optically active amino acids with high purity and high efficiency by solving the low equilibrium constant problem of transaminase and is applicable to production of various optically active amino acids in industrial scale. Since the present disclosure allows easy production of various unnatural amino acids having high reactivity and stability, which are used as pharmaceutical precursors, it can be usefully employed in preparation of pharmaceuticals, food additives and various animal feeds.

  本公开涉及使用共基底穿梭转氨酶的方法制备光学活性氨基酸。该方法包括使用氨基酸共基底耦合α-转氨酶将酮酸转化为氨基酸的反应和使用ω-转氨酶（TA）转移胺基底物的胺基的反应。本公开解决了转氨酶低平衡常数问题，可高效高纯度地生产各种光学活性氨基酸，并适用于工业规模生产。由于本公开允许轻松生产具有高反应性和稳定性的各种非天然氨基酸，这些氨基酸可用作制药前体，因此可以在制备药物、食品添加剂和各种动物饲料方面得到有用的应用。