了解附着在
间苯二酚 [4]
芳烃腔壁上的部分之间的距离分布和动力学,可在膨胀的风筝和收缩的花瓶形式之间切换,可能使这种分子系统能够用于研究基本的距离依赖性相互作用。为了实现这一目标,对存在于花瓶和风筝形式中的供体/受体
硼二
吡咯甲烯 (BODIPY)
染料标记的空腔进行了联合实验和分子动力学 (MD) 模拟研究。从 MD 模拟计算的各向异性衰减与实验荧光各向异性数据之间的直接比较显示出极好的一致性,表明模拟提供了系统动力学的准确表示。BODIPY
染料之间的距离分布是通过比较时间分辨 Förster 共振能量转移实验和 MD 模拟来确定的。基于 MD 轨迹模拟的荧光强度衰减曲线与实验数据吻合良好,表明模拟提供了该分子系统中距离分布和动力学的准确图片,并为理解扩展分子的行为提供了重要工具。系统和设计未来的应用程序。