HCl*H₂N-Lys(N₃)-OMe | 1359970-01-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: HCl*H₂N-Lys(N₃)-OMe
• 英文别名: (S)-methyl 2-amino-6-azidohexanoate hydrochloride
• CAS: 1359970-01-6
• 化学式: C₇H₁₄N₄O₂*ClH
• 分子量: 222.675
• InChiKey: WFDAYRXELAFYKD-RGMNGODLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.39
• 重原子数：
  14.0
• 可旋转键数：
  6.0
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.86
• 拓扑面积：
  101.08
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  4.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  HCl*H₂N-Lys(N₃)-OMe 在 copper(l) iodide 、 三甲基氯硅烷 、 ethylene dichloride hydrochloride 、 1-羟基苯并三唑 、 三乙胺 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 39.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  一种面向多样性的合成策略，能够实现大环肽模拟支架的组合类型变异†

  摘要：

  大环肽模拟物与广泛的生物活性有关。然而，尽管具有这些潜在有价值的特性，但大环肽模拟结构类别通常被认为在药物发现中探索不足。这归因于缺乏生产具有高水平结构和形状多样性的大环肽模拟物集合的通用方法。特别是，目前的大环肽模拟库缺乏支架多样性；事实上，多种分子支架的有效构建对合成化学家提出了巨大的普遍挑战。这里我们描述一个新的，大环肽模拟物的多样性导向合成（DOS）的先进策略，能够实现分子支架（核心大环结构）的组合变化。这种 DOS 策略的普遍性和稳健性通过逐步有效地合成结构多样的 200 多种大环肽模拟化合物库来证明，每种化合物都基于不同的分子支架，并从现成的构建块中分离出来，并以毫克的数量分离。据我们所知，这代表了合成衍生的大环肽模拟物文库中前所未有的支架多样性水平。化学信息学分析表明，库化合物进入的化学空间区域与最畅销的品牌药物和大环天然产品所涉及的区域不同，说明我们的 DOS 方法对当前药

  DOI：

  10.1039/c5ob00371g
• 作为产物：
  描述：

  methyl 6-azido-2-(boc-amino)hexanoate 在 三甲基氯硅烷 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 反应 3.0h， 以1.24 g的产率得到HCl*H₂N-Lys(N₃)-OMe
  参考文献：
  名称：

  一种面向多样性的合成策略，能够实现大环肽模拟支架的组合类型变异†

  摘要：

  大环肽模拟物与广泛的生物活性有关。然而，尽管具有这些潜在有价值的特性，但大环肽模拟结构类别通常被认为在药物发现中探索不足。这归因于缺乏生产具有高水平结构和形状多样性的大环肽模拟物集合的通用方法。特别是，目前的大环肽模拟库缺乏支架多样性；事实上，多种分子支架的有效构建对合成化学家提出了巨大的普遍挑战。这里我们描述一个新的，大环肽模拟物的多样性导向合成（DOS）的先进策略，能够实现分子支架（核心大环结构）的组合变化。这种 DOS 策略的普遍性和稳健性通过逐步有效地合成结构多样的 200 多种大环肽模拟化合物库来证明，每种化合物都基于不同的分子支架，并从现成的构建块中分离出来，并以毫克的数量分离。据我们所知，这代表了合成衍生的大环肽模拟物文库中前所未有的支架多样性水平。化学信息学分析表明，库化合物进入的化学空间区域与最畅销的品牌药物和大环天然产品所涉及的区域不同，说明我们的 DOS 方法对当前药

  DOI：

  10.1039/c5ob00371g

文献信息

• An <i>in situ</i> combinatorial methodology to synthesize and screen chemical probes
  作者：Antonie J. van der Zouwen、Jonas Lohse、Lianne H. E. Wieske、Katharina F. Hohmann、Ramon van der Vlag、Martin D. Witte

  DOI：10.1039/c8cc06991c

  日期：——

  Chemical probes that label proteins of interest in the context of complex biological samples are useful research tools. The reactive group that forms the covalent bond with the target protein has a large effect on the selectivity and selecting the appropriate group determines the success of a probe. We here report the development of a combinatorial methodology based on imine chemistry that enables

  在复杂的生物样品中标记目标蛋白的化学探针是有用的研究工具。与目标蛋白形成共价键的反应基团对选择性有很大影响，选择合适的基团将决定探针的成功。我们在此报告了基于亚胺化学的组合方法学的发展，该方法能够直接进行原位合成并筛选不同的反应基团，从而简化了探针的鉴定。使用我们的方法，我们发现了针对BirA和氯霉素乙酰转移酶（与抗菌活性和抗性有关的两种蛋白质）的化学探针。
• New cylindrical peptide assemblies defined by extended parallel β-sheets
  作者：Ashok D. Pehere、Christopher J. Sumby、Andrew D. Abell

  DOI：10.1039/c2ob26637g

  日期：——

  A new approach to non-covalent peptide-based nanotubular or rod-like structures is presented, whereby the monomeric units are preorganised into a β-strand geometry that templates the formation of an extended and unusual parallel β-sheet rod-like structure. The conformational constraint is introduced by Huisgen cycloaddition to give a triazole-based macrocycle, with the resulting self-assembled structures stabilized by a well-defined series of intermolecular hydrogen bonds.

  本文介绍了一种构建非共价键肽基纳米管或棒状结构的新方法，其中单体单元预先组织成β-发夹几何形状，模板化形成一种扩展且不寻常的平行β-折叠棒状结构。通过胡伊斯滕环加成反应引入构象约束，得到基于三唑的大环，其自组装结构通过一系列明确的分子间氢键得到稳定。
• [EN] COMPOUNDS AND METHODS FOR TREATING CANCER, VIRAL INFECTIONS, AND ALLERGIC CONDITIONS<br/>[FR] COMPOSÉS ET MÉTHODES DE TRAITEMENT DU CANCER, D'INFECTIONS VIRALES ET D'AFFECTIONS ALLERGIQUES
  申请人：JANETKA JAMES

  公开号：WO2020264187A1

  公开（公告）日：2020-12-30

  The present invention generally relates to compounds that are useful for inhibiting one or more trypsin-like S1 serine proteases, HGFA, matriptase, hepsin, KLK5 and/or TMPRSS2 as well as cysteine proteases including trypsin-like cysteine proteases (e.g. Cathepsin B). The present invention also relates to various methods of using the inhibitor compounds to treat or prevent viral infections, including those caused by coronaviruses and influenza, conditions associated with KLK5, various malignancies, pre-malignant conditions, and cancer.

  本发明通常涉及一种用于抑制一个或多个类似胰蛋白酶的S1丝氨酸蛋白酶，HGFA、matriptase、hepsin、KLK5和/或TMPRSS2以及胱氨酸蛋白酶包括类似胰蛋白酶的胱氨酸蛋白酶（例如Cathepsin B）的化合物。本发明还涉及使用这些抑制剂化合物治疗或预防病毒感染的各种方法，包括由冠状病毒和流感病毒引起的感染，与KLK5相关的疾病、各种恶性肿瘤、癌前病变和癌症。
• Mechanism-Based Macrocyclic Inhibitors of Serine Proteases
  作者：Vishnu C. Damalanka、Victoria Banas、Paolo De Bona、Maithri M. Kashipathy、Kevin Battaile、Scott Lovell、James W. Janetka

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.3c02388

  日期：2024.3.28

  Protease inhibitor drug discovery is challenged by the lack of cellular and oral permeability, selectivity, metabolic stability, and rapid clearance of peptides. Here, we describe the rational design, synthesis, and evaluation of peptidomimetic side-chain-cyclized macrocycles which we converted into covalent serine protease inhibitors with the addition of an electrophilic ketone warhead. We have identified

  蛋白酶抑制剂药物的发现面临缺乏细胞和口腔通透性、选择性、代谢稳定性和肽快速清除的挑战。在这里，我们描述了拟肽侧链环化大环的合理设计、合成和评估，我们将其转化为共价丝氨酸蛋白酶抑制剂，并添加了亲电酮弹头。我们已经确定了 TMPRSS2、马曲他酶、肝蛋白酶和 HGFA 的有效和选择性抑制剂，并证明了它们改进的蛋白酶选择性、代谢稳定性和药代动力学 （PK） 特性。我们获得了苯醚环化三肽 VD4162 （8b） 与 matriptase 结合的 X 射线晶体结构，揭示了意想不到的结合构象。环联苯醚 VD5123 （11） 在半衰期为 4.5 小时且化合物暴露超过 24 小时的小鼠中表现出最佳的 PK 特性。这些新的环状三肽支架可用作易于修饰的模板，为克服线性无环肽在蛋白酶抑制剂药物发现中出现的障碍提供了一种新策略。
• New β-Strand Templates Constrained by Huisgen Cycloaddition
  作者：Ashok D. Pehere、Andrew D. Abell

  DOI：10.1021/ol3002199

  日期：2012.3.2

  New peptidic templates constrained into a beta-strand geometry by linking acetylene and azide containing P-1 and P-3 residues of a tripeptide by Huisgen cycloaddition are presented. The conformations of the macrocycles are defined by NMR studies and those that best define a beta-strand are shown to be potent inhibitors of the protease calpain. The beta-strand templates presented and defined here are prepared under optimized conditions that should be suitable for targeting a range of proteases and other applications requiring such a geometry.