N'-Cyanoethylpseudouridin | 967-23-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 核苷和核苷酸类似物
• 英文名称: N'-Cyanoethylpseudouridin
• 英文别名: Monocyanoethylpseudouridin；3-[5-[(2S,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2,4-dioxopyrimidin-1-yl]propanenitrile
• CAS: 967-23-7
• 化学式: C₁₂H₁₅N₃O₆
• 分子量: 297.268
• InChiKey: XJMIAOIZERCFKI-KYXWUPHJSA-N

物化性质

• 密度：
  1.554±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.9
• 重原子数：
  21
• 可旋转键数：
  4
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.58
• 拓扑面积：
  143
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  7

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  丙烯腈 、 假尿苷 在 乙酸–三乙胺 作用下， 以 乙醇 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 N'-Cyanoethylpseudouridin
  参考文献：
  名称：

  化学标记和使用丙烯酰胺基荧光素亲和捕获肌苷的RNA。

  摘要：

  腺苷到肌苷（A到I）RNA编辑是一种广泛且保守的转录后修饰，在细胞功能和行为方面产生了显着变化。准确地识别，检测和量化转录组中的这些位点对于提高我们对编辑动态，其更广泛的生物学作用以及与疾病的联系的理解是必要的。结合亲和力富集的化学修饰碱基的化学标记已使几种形式的RNA编辑的表征得以改善。但是，目前没有可用于下拉肌苷的方法。为了满足这一需求，我们探索了丙烯酰胺作为标记基序的方法，并在此报告了一种与肌苷反应并能够富集肌苷的RNA转录物的丙烯酰胺荧光素试剂。此方法可提高肌苷检测和鉴定的灵敏度，从而实现A-to-I编辑的更全面的转录组范围分析。丙烯酰胺衍生化也具有很高的普遍性，为使用各种探针和亲和柄标记肌苷提供了潜力。

  DOI：

  10.1021/acs.bioconjchem.8b00541

文献信息

• [EN] NON-NATURAL RIBONUCLEOTIDES, AND METHODS OF USE THEREOF<br/>[FR] RIBONUCLÉOTIDES NON NATURELS, ET PROCÉDÉS POUR LES UTILISER
  申请人：ALNYLAM PHARMACEUTICALS INC

  公开号：WO2009120878A3

  公开（公告）日：2009-11-19