有效的拟肽应具有结构刚性和适当的相互作用模式,从而导致与目标受体位点的潜在空间和电子匹配。这种小
生物活性分子的合理设计可以推动
化学合成和分子建模朝着药物
化学更快的方向发展。通过NMR和IR光谱研究了Nt-丁氧基羰基-甘
氨酸-(E / Z)-脱氢苯丙
氨酸N',N'-二甲基酰胺(Boc-Gly-(E / Z)-DeltaPhe-NMe2)的构象性质。实验结果得到DFT(B3LYP,M06-2X)和MP2理论
水平的大量计算的支持,并且在真空和溶液中确定了所研究二肽的两种异构体的β转变趋势。理论数据和实验IR结果用作基于NMR的肽详细溶液构象测定的附加信息。获得的结果表明,C-末端酰胺基团的N-甲基化极大地改变了所研究的脱氢肽的构象性质。理论构象分析表明,在真空和极性环境下,N-甲基化的Z异构体(Boc-Gly-(Z)-DeltaPhe-NMe2)都倾向于采用β-转角构象。相反,N-甲基化的E异构