(+)-naseseazine B

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: (+)-naseseazine B
• 英文别名: 12-[3-[(1,4-dioxo-2,3,6,7,8,8a-hexahydropyrrolo[1,2-a]pyrazin-3-yl)methyl]-1H-indol-6-yl]-2,8,19-triazapentacyclo[10.7.0.02,10.04,8.013,18]nonadeca-13,15,17-triene-3,9-dione
• 化学式: C₃₂H₃₂N₆O₄
• 分子量: 564.644
• InChiKey: SUNBJXDNKYSACE-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.7
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  9.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  118
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (3S,8aS)-3-(1H-吲哚-3-基甲基)-2,3,6,7,8,8a-六氢吡咯并[2,1-f]吡嗪-1,4-二酮 在 spinach ferredoxin reductase 、 recombinant diketopiperazine dimerase NzeB from Streptomyces sp. NRRL F-5053 、 还原型辅酶II(NADPH)四钠盐 、 spinach ferredoxin 作用下， 以 二甲基亚砜 、 甘油 为溶剂， 生成 (-)-naseseazine C 、 (+)-naseseazine B
  参考文献：
  名称：

  三价铁-超氧化物中间体引发 P450 催化的环状二肽二聚化

  摘要：

  细胞色素 P450 (CYP) AspB 参与二酮哌嗪 (DKP) aspergilazine A 的生物合成。色氨酸连接的二聚体 DKP 生物碱是一大类天然产物，存在于许多物种中，并表现出广泛且通常有效的生物活性。所提出的 AspB 形成 CN 键的机制以及相关 CYP 形成类似 CC 键的机制已引发使用 Ferr1-中间体作为氧化剂来促进底物二聚化。在这里，稳态和瞬态动力学方法的并行应用揭示了一种非常不同的机制，其中涉及铁超氧化物物质作为主要氧化剂来引发 DKP 组装。单周转动力学同位素效应和底物类似物表明了可能的性质和提取位点。对 CYP-超氧化物反应性的直接观察合理化了 AspB 的非典型结果，并揭示了血红素酶的新反应流形。

  DOI：

  10.1021/jacs.3c04542

文献信息

• A Ferric-Superoxide Intermediate Initiates P450-Catalyzed Cyclic Dipeptide Dimerization
  作者：Hannah E. Gering、Xiaojun Li、Haoyu Tang、Paul D. Swartz、Wei-Chen Chang、Thomas M. Makris

  DOI：10.1021/jacs.3c04542

  日期：2023.9.6

  a ferric-superoxide species as a primary oxidant to initiate DKP-assembly. Single turnover kinetic isotope effects and a substrate analog suggest the probable nature and site for abstraction. The direct observation of CYP-superoxide reactivity rationalizes the atypical outcome of AspB and reveals a new reaction manifold in heme enzymes.

  细胞色素 P450 (CYP) AspB 参与二酮哌嗪 (DKP) aspergilazine A 的生物合成。色氨酸连接的二聚体 DKP 生物碱是一大类天然产物，存在于许多物种中，并表现出广泛且通常有效的生物活性。所提出的 AspB 形成 CN 键的机制以及相关 CYP 形成类似 CC 键的机制已引发使用 Ferr1-中间体作为氧化剂来促进底物二聚化。在这里，稳态和瞬态动力学方法的并行应用揭示了一种非常不同的机制，其中涉及铁超氧化物物质作为主要氧化剂来引发 DKP 组装。单周转动力学同位素效应和底物类似物表明了可能的性质和提取位点。对 CYP-超氧化物反应性的直接观察合理化了 AspB 的非典型结果，并揭示了血红素酶的新反应流形。