将 SN38 衍生物的代谢物与模拟拓扑 I 抑制剂靶标的带切口 DNA 十聚体模型结合的 NMR 研究
摘要:
在这篇文章中,我们展示了 7-乙基-9-羟甲基-10-羟基喜树碱 ( 1 )(SN38 的一种衍生物)与模拟拓扑异构酶 I 抑制剂野生型 DNA 靶点的模型带切口 DNA十聚体相互作用的基于 NMR 的结果。喜树碱家族。标题化合物1可以被认为是带有烷基氨基取代基的喜树碱衍生物代谢途径中 I 相的主要代谢物。因此,其药效学特性是令人感兴趣的。由 DOSY(扩散有序光谱)确定,化合物1与模型带切口的 DNA 十聚体形成相当稳定的分子复合物,亲和常数 K a 3.02 mM -1. NOESY 实验的分析揭示了两种相互作用组分上的分子间交叉峰和相互引起的位移,从而得出客体分子1在缺口内堆积氮碱基的结论。对切口内四种可能包含1 的内含物的 MD(分子动力学)分析允许建立复合物的详细几何形状。建议两种构象作为最能代表与实验 NOESY 结果一致的分子建模结果的构象。两种结构的芳香核都将氮碱基堆叠在面向具有环
[EN] DERIVATIVES OF CAMPTOTHECIN, A METHOD OF PRODUCING THEM AND THEIR USE<br/>[FR] DÉRIVÉS DE CAMPTOTHÉCINE, LEUR PROCÉDÉ DE PRODUCTION ET LEUR UTILISATION
申请人:INST CHEMII ORGANICZNEJ POLSKIEJ AKADEMII NAUK
公开号:WO2014064654A1
公开(公告)日:2014-05-01
The subject of the present invention are water-soluble derivatives of camptothecin, their synthesis and use. These compounds exhibit preferable biological properties for use in anti-neoplasm therapy.
9-Aminomethyl derivatives of 7-ethyl-10-hydroxycamptothecin were synthesized. Interaction with a natural DNA octamer was checked using 1H NMR, PFGSE NMR and MALDI-TOF experiments, which proved covalent binding. Compounds were tested against human cancer cell lines in vitro. All compounds show high activity comparable to SN38. The obtained products are well soluble in water.
合成了7-乙基-10-羟基喜树碱的9-氨基甲基衍生物。使用1 H NMR,PFGSE NMR和MALDI-TOF实验检查与天然DNA八聚体的相互作用,这证明了共价结合。化合物在体外针对人癌细胞系进行了测试。所有化合物均具有与SN38相当的高活性。所得产物很好地溶于水。
A NMR study of binding the metabolite of SN38 derivatives to a model nicked DNA decamer mimicking target of Topo I inhibitors
7-ethyl-9-hydroxymethyl-10-hydroxycamptothecin (1), a derivative of SN38, with a model nicked DNA decamer mimicking the wild type DNA target of Topoisomerase I inhibitors from the camptothecin family. The title compound 1 can be considered a main metabolite of phase I in the metabolic pathway of camptothecin derivatives bearing the alkylamino substituent. Therefore, its pharmacodynamic properties are of interest
在这篇文章中,我们展示了 7-乙基-9-羟甲基-10-羟基喜树碱 ( 1 )(SN38 的一种衍生物)与模拟拓扑异构酶 I 抑制剂野生型 DNA 靶点的模型带切口 DNA十聚体相互作用的基于 NMR 的结果。喜树碱家族。标题化合物1可以被认为是带有烷基氨基取代基的喜树碱衍生物代谢途径中 I 相的主要代谢物。因此,其药效学特性是令人感兴趣的。由 DOSY(扩散有序光谱)确定,化合物1与模型带切口的 DNA 十聚体形成相当稳定的分子复合物,亲和常数 K a 3.02 mM -1. NOESY 实验的分析揭示了两种相互作用组分上的分子间交叉峰和相互引起的位移,从而得出客体分子1在缺口内堆积氮碱基的结论。对切口内四种可能包含1 的内含物的 MD(分子动力学)分析允许建立复合物的详细几何形状。建议两种构象作为最能代表与实验 NOESY 结果一致的分子建模结果的构象。两种结构的芳香核都将氮碱基堆叠在面向具有环