3-deazaguanosine (c3G) on RNA properties. We found that these nucleosides can decrease thermodynamic stability of base pairing to a significant extent. The effects are much more pronounced for 3-deazapurine nucleosides compared to their constitutional isomers of 7-deazapurine nucleosides (c7G, c7A). We furthermore investigated base pair opening dynamics by solution NMR spectroscopy and revealed significantly
脱氮
嘌呤核苷,如
3-脱氮腺苷 (c3A),对于功能性 RNA 的原子诱变研究至关重要。它们是我们目前对
核糖体肽键形成和最近发现的小核酶(如 twister 和 pistol RNA)中
磷酸二酯切割的机制理解的关键。在这里,我们提出了一项关于 c3A 和迄今为止研究不足的 3-脱氮
鸟苷 (c3G) 对 RNA 特性影响的全面研究。我们发现这些核苷可以显着降低碱基对的热力学稳定性。与它们的 7-脱氮
嘌呤核苷 (c7G, c7A) 的构成异构体相比,3-脱氮
嘌呤核苷的影响要明显得多。我们进一步通过溶液 NMR 波谱研究了碱基对开放动力学,并揭示了显着增强的亚
氨基质子交换率。此外,我们解析了 c3A 修饰的 RNA 的 X 射线结构,并可视化了小沟的
水合模式。重要的是,与
嘌呤 N3 原子氢键并始终在天然双螺旋中观察到的特征
水分子在 3-脱氮
嘌呤修饰的对应物中缺乏。因此,NMR 和 X 射线晶体学