5-[4-(2,4-Diamino-pyrimidin-5-ylmethyl)-2,6-dimethoxy-phenoxy]-pentanoic acid methyl ester | 94236-26-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 5-[4-(2,4-Diamino-pyrimidin-5-ylmethyl)-2,6-dimethoxy-phenoxy]-pentanoic acid methyl ester
• 英文别名: methyl 5-[4-[(2,4-diaminopyrimidin-5-yl)methyl]-2,6-dimethoxyphenoxy]pentanoate
• CAS: 94236-26-7
• 化学式: C₁₉H₂₆N₄O₅
• 分子量: 390.439
• InChiKey: RNAWAVORHZUABK-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 沸点：
  603.2±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.228±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.5
• 重原子数：
  28
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  132
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  5-[4-(2,4-Diamino-pyrimidin-5-ylmethyl)-2,6-dimethoxy-phenoxy]-pentanoic acid methyl ester 在 盐酸 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 为溶剂， 以75%的产率得到5-[4-[(2,4-Diaminopyrimidin-5-yl)methyl]-2,6-dimethoxyphenoxy]pentanoic acid;hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  二氢叶酸还原酶抑制剂的基于受体的设计：在一系列羧基取代的甲氧苄啶类似物中，通过晶体学确定的酶结合与酶亲和力的比较。

  摘要：

  通过使用大肠杆菌二氢叶酸还原酶（DHFR）的分子模型，设计了甲氧苄氨嘧啶（TMP）的类似物，该类似物并入了各种3'-羧基烷氧基部分，以便获得带正电荷的活性位点残基的离子相互作用。这些化合物中的某些已显示出对该酶的极高亲和力。例如，发现3'-（羧基戊基）氧基类似物对大肠杆菌DHFR的抑制作用是TMP的55倍（Ki = 0.024 nM，而TMP为1.32 nM）。大肠杆菌DHFR与TMP的二元复合物的X射线晶体学研究和该含酸系列化合物的两个成员定义了这些抑制剂的结合并显示了后两个抑制剂的羧基与Arg-57离子结合。

  DOI：

  10.1021/jm00381a008
• 作为产物：
  描述：

  甲氧苄啶 在 potassium tert-butylate 、 氢溴酸 作用下， 以 水 、 二甲基亚砜 为溶剂， 反应 2.83h， 生成 5-[4-(2,4-Diamino-pyrimidin-5-ylmethyl)-2,6-dimethoxy-phenoxy]-pentanoic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  选择 DNA 编码的文库到活细胞内和活细胞上的蛋白质靶标

  摘要：

  我们报告了针对细胞质内和活细胞表面的蛋白质靶标的 DNA 编码小分子文库的选择。该方法依赖于通过亲和标记产生 DNA 与蛋白质靶标的共价连接。这种交联事件能够通过重组蛋白上的标签进行后续的共纯化。为了访问细胞内的目标，循环细胞穿透肽被附加到 DNA 编码的文库中，以便跨细胞膜传递。由于这种方法评估了 DEL 与活细胞中靶标的结合，因此它提供了一种针对无法表达和纯化为活性的挑战性靶标的 DEL 选择策略。

  DOI：

  10.1021/jacs.9b08085

文献信息

• MEANS AND METHODS FOR BIOLUMINESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER (BRET) ANALYSIS IN A BIOLOGICAL SAMPLE
  申请人：ECOLE POLYTECHNIQUE FÉDÉRALE DE LAUSANNE (EPFL)

  公开号：US20160146794A1

  公开（公告）日：2016-05-26

  The invention relates to the field of in vitro detection methods using luminescence. Provided is a sensor molecule for detecting an analyte of interest in a sample using bioluminescence resonance energy transfer (BRET), the sensor molecule comprising a proteinaceous moiety tethered to a synthetic regulatory molecule. Also provided is an analytical device comprising a sensor and methods using the sensor molecule.

  本发明涉及使用发光的体外检测方法领域。提供了一种传感器分子，用于使用生物发光共振能量转移（BRET）检测样品中感兴趣的分析物，该传感器分子包括连接到合成调节分子的蛋白质部分。还提供了包括传感器的分析设备和使用传感器分子的方法。