(S)-allyl 2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-6-aminohexanoate | 161580-12-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 芴
• 英文名称: (S)-allyl 2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-6-aminohexanoate
• 英文别名: N-α-Fmoc-L-Lys allyl ester；Fmoc-Lys-OAll；(S)-Fmoc-Lys-O-allyl；Fmoc-L-Lys-O-allyl；Fmoc-L-Lys-OAll；Fmoc-Lys-Oallyl；prop-2-enyl (2S)-6-amino-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)hexanoate
• CAS: 161580-12-7
• 化学式: C₂₄H₂₈N₂O₄
• 分子量: 408.497
• InChiKey: KHXOBMIHCYCHQB-QFIPXVFZSA-N

物化性质

• 沸点：
  597.1±50.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.169±0.06 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.8
• 重原子数：
  30
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.33
• 拓扑面积：
  90.6
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (S)-allyl 2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-6-aminohexanoate 在 四(三苯基膦)钯 5,5-二甲基-1,3-环己二酮 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲苯 为溶剂， 生成 (2S)-6-[(1S,2S,6R,7R)-3,5-dioxo-4-azatricyclo[5.2.1.02,6]dec-8-en-4-yl]-2-(9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonylamino)hexanoic acid
  参考文献：
  名称：

  Effects of β-sheet breaker peptide polymers on scrapie-infected mouse neuroblastoma cells and their affinities to prion protein fragment PrP(81–145)

  摘要：

  研究人员对Soto的“β-片层破坏肽”及其聚合物对ScN2a细胞中PrPSc形成的影响进行了研究。表面等离子共振研究表明，PrP（81-145）与“β-片层破坏肽”之间的直接结合并不具有特异性，可能不会在抑制PrPSc形成方面发挥主要作用。

  DOI：

  10.1039/b306682g
• 作为产物：
  描述：

  N-alpha-芴甲氧羰基-N-epsilon-叔丁氧羰基-L-赖氨酸 在 4-二甲氨基吡啶 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 、 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 生成 (S)-allyl 2-(((9H-fluoren-9-yl)methoxy)carbonylamino)-6-aminohexanoate
  参考文献：
  名称：

  通过氮丙啶醛二聚体驱动的三组分耦合固相平行合成功能化的中大型环状拟肽

  摘要：

  描述了使用氮丙啶醛二聚体驱动的三组分偶联的大环肽的首次固相平行合成。该方法支持合成9至18元含氮丙啶的大环，然后通过氮丙啶环的亲核开环将其官能化。这构成了快速并行合成大环肽的可靠方法。

  DOI：

  10.1002/chem.201500068

文献信息

• Systemic Antibacterial Activity of Novel Synthetic Cyclic Peptides
  作者：Véronique Dartois、Jorge Sanchez-Quesada、Edelmira Cabezas、Ellen Chi、Chad Dubbelde、Carrie Dunn、Juan Granja、Colleen Gritzen、Dana Weinberger、M. Reza Ghadiri、Thomas R. Parr

  DOI：10.1128/aac.49.8.3302-3310.2005

  日期：2005.8

  Cyclic peptides with an even number of alternatingd,l-α-amino acid residues are known to self-assemble into organic nanotubes. Such peptides previously have been shown to be stable upon protease treatment, membrane active, and bactericidal and to exert antimicrobial activity againstStaphylococcus aureusand other gram-positive bacteria. The present report describes the in vitro and in vivo pharmacology of selected members of this cyclic peptide family. The intravenous (i.v.) efficacy of six compounds with MICs of less than 12 μg/ml was tested in peritonitis and neutropenic-mouse thigh infection models. Four of the six peptides were efficacious in vivo, with 50% effective doses in the peritonitis model ranging between 4.0 and 6.7 mg/kg against methicillin-sensitiveS. aureus(MSSA). In the thigh infection model, the four peptides reduced the bacterial load 2.1 to 3.0 log units following administration of an 8-mg/kg i.v. dose. Activity against methicillin-resistantS. aureuswas similar to MSSA. The murine pharmacokinetic profile of each compound was determined following i.v. bolus injection. Interestingly, those compounds with poor efficacy in vivo displayed a significantly lower maximum concentration of the drug in serum and a higher volume of distribution at steady state than compounds with good therapeutic properties.S. aureuswas unable to easily develop spontaneous resistance upon prolonged exposure to the peptides at sublethal concentrations, in agreement with the proposed interaction with multiple components of the bacterial membrane canopy. Although additional structure-activity relationship studies are required to improve the therapeutic window of this class of antimicrobial peptides, our results suggest that these amphipathic cyclicd,l-α-peptides have potential for systemic administration and treatment of otherwise antibiotic-resistant infections.

  摘要已知具有偶数个交替的 d,l-α-氨基酸残基的环肽可以自组装成有机纳米管。以前的研究表明，这种肽在蛋白酶处理后具有稳定性、膜活性和杀菌性，并对金黄色葡萄球菌和其他革兰氏阳性细菌具有抗菌活性。本报告介绍了该环肽家族部分成员的体外和体内药理学。在腹膜炎和嗜中性粒细胞小鼠大腿感染模型中，对 MIC 小于 12 μg/ml 的六种化合物进行了静脉注射药效测试。在腹膜炎模型中，六种肽中的四种对甲氧西林敏感金黄色葡萄球菌（MSSA）的50%有效剂量为4.0至6.7毫克/千克。在大腿感染模型中，静脉注射 8 毫克/千克的剂量后，四种肽能使细菌量减少 2.1 至 3.0 log 单位。对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌的活性与 MSSA 相似。在静脉注射后，测定了每种化合物的小鼠药代动力学特征。有趣的是，与疗效好的化合物相比，体内疗效差的化合物在血清中的最大药物浓度明显较低，稳态分布容积也较高。金黄色葡萄球菌在长期接触亚致死浓度的肽后不易产生自发抗药性，这与所提出的与细菌膜顶盖的多种成分相互作用是一致的。虽然还需要进行更多的结构-活性关系研究来改善这类抗菌肽的治疗窗口，但我们的研究结果表明，这些两性环d,l-α-肽具有全身给药和治疗抗生素耐药性感染的潜力。
• Synthesis of the Rheb and K-Ras4B GTPases
  作者：Yong-Xiang Chen、Sebastian Koch、Katharina Uhlenbrock、Katrin Weise、Debapratim Das、Lothar Gremer、Luc Brunsveld、Alfred Wittinghofer、Roland Winter、Gemma Triola、Herbert Waldmann

  DOI：10.1002/anie.201001884

  日期：2010.8.16

  Now available! Farnesylated and carboxymethylated Rheb (see picture) and K‐Ras4B GTPases were synthesized in useful amounts by a combination of expressed protein ligation and solid‐phase lipopeptide synthesis. The functionality of the proteins was proven by biochemical, biophysical, and cell‐based investigations.

  现在可用！法尼基化和羧甲基化的Rheb（见图）和K‐Ras4B GTPases通过表达的蛋白质连接和固相脂肽合成相结合，以有用的量合成。蛋白质的功能已通过生化，生物物理和基于细胞的研究证明。
• Functionalization of Tripodal Scaffold Molecules on Solid Support
  作者：Cristian Guarise、Giovanni Zaupa、Leonard J. Prins、Paolo Scrimin

  DOI：10.1002/ejoc.200800259

  日期：2008.7

  A versatile synthetic approach is described for the functionalization of tripodal scaffold molecules on solid support. Intrinsic problems related to the attachment of tripodal scaffolds to a resin (for example mono- vs. polyadducts and intramolecular cyclizations) are studied and solutions are provided. The synthetic approach relies on the use of specific protecting groups in the critical steps of

  描述了一种用于在固体支持物上对三足支架分子进行功能化的通用合成方法。研究了与将三脚架支架连接到树脂（例如单加合物与多加合物和分子内环化）相关的内在问题并提供了解决方案。合成方法依赖于在合成的关键步骤中使用特定的保护基团。然而，重要的是，支架分子上的保护基团从未使用过，这显着促进了支架变异，例如在组合研究中。(© Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA, 69451 Weinheim, Germany, 2008)
• A New Highly Versatile Handle for Chemistry on a Solid Support: The Pipecolic Linker
  作者：Nicolas Masurier、Paweł Zajdel、Pascal Verdié、Maciej Pawłowski、Muriel Amblard、Jean Martinez、Gilles Subra

  DOI：10.1002/chem.201201452

  日期：2012.9.10

  The versatility of the pipecolic linker (Pip‐linker) is illustrated by the synthesis of modified amino acids, C‐terminal‐modified pseudopeptides, and cyclic peptides, through side‐chain anchoring of a lysine residue (see figure). Introduction of the first residue was easily accomplished and the Pip‐linker revealed to be robust enough to support various chemical modifications.

  通过赖氨酸残基的侧链锚定，修饰氨基酸，C末端修饰的伪肽和环状肽的合成说明了管状连接子（Pip-linker）的多功能性。第一个残基的引入很容易完成，并且Pip-linker具有足够的鲁棒性以支持各种化学修饰。
• Thiazolidine-Masked α-Oxo Aldehyde Functionality for Peptide and Protein Modification
  作者：Xiaobao Bi、Kalyan Kumar Pasunooti、Julien Lescar、Chuan-Fa Liu

  DOI：10.1021/acs.bioconjchem.6b00667

  日期：2017.2.15

  protein modifications for various applications in biomedical research during the past decades. The generation of α-oxo aldehyde via sodium periodate oxidation is usually limited to the N-terminus of a target protein. Internal-site functionalization of proteins with the α-oxo aldehyde handle has not been achieved yet. Herein we report a novel method for site-specific peptide and protein modification using

  在过去的几十年中，基于α-氧代醛的生物共轭化学已在肽和蛋白质修饰中得到了广泛的探索，可用于生物医学研究中的各种应用。通过高碘酸钠氧化产生的α-氧代醛通常限于N靶蛋白的末端。尚未实现具有α-氧代醛手柄的蛋白质的内部位点功能化。本文中，我们报告了一种使用合成或遗传并入噻唑烷保护的α-氧代醛修饰位点特异性肽和蛋白质的新方法。首次在温和条件下通过银离子介导的噻唑烷水解实现了醛的有效脱掩。使用模型肽和重组蛋白来证明该新方法的实用性，这些方法通过肟与氧胺官能化的肽标记试剂的连接进行了位点修饰。所以，