Oxime Side-Chain Cross-Links in an α-Helical Coiled-Coil Protein: Structure, Thermodynamics, and Folding-Templated Synthesis of Bicyclic Species
作者:Conor M. Haney、W. Seth Horne
DOI:10.1002/chem.201300506
日期:2013.8.19
method to control peptide folding, particularly when α‐helical secondary structure is the target. Here, we examine the application of oxime bridges, formed by the chemoselective reaction between aminooxy and aldehyde side chains, for the stabilization of a helical peptide involved in a protein–protein complex. A series of sequence variants of the dimeric coiled coil GCN4‐p1 bearing oxime bridges at
共价侧链交联是控制肽折叠的一种通用方法,尤其是当以α螺旋二级结构为目标时。在这里,我们研究了由氨氧基和醛侧链之间的化学选择性反应形成的肟桥对稳定参与蛋白质-蛋白质复合物的螺旋肽的作用。制备了一系列二聚体卷曲螺旋GCN4-p1在肟暴露位置带有肟桥的序列变体,并对其进行了生物学上的表征。在折叠后的蛋白质复合物中,在pH 7时,触发的侧链醛基团的原位暴露和随后的环化反应迅速而干净地进行。一系列不同的肟桥之间的折叠热力学比较表明,交叉链始终稳定在盘绕的线圈上,稳定程度对大环的确切大小和结构敏感。X射线晶体学分析对具有最佳交联位置的螺旋形线圈及其线性前驱体的第二种结构进行了研究,结果表明该桥是如何容纳在α螺旋中的。通过同时在原位同时形成两个键来制备双环低聚物,证明了潜在地利用触发的肟形成来捕获和稳定结合状态下的特定肽折叠构象。