(2R,3R,4R,5R)-2-(4-amino-6-bromo-5-cyano-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-((benzoyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate | 151707-53-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 吡咯并嘧啶核苷和核苷酸
• 英文名称: (2R,3R,4R,5R)-2-(4-amino-6-bromo-5-cyano-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-((benzoyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate
• 英文别名: 4-amino-6-bromo-5-cyano-7-(2,3,5-tri-O-benzoyl-β-D-ribofuranosyl)pyrrolo<2,3-d>pyrimidine；4-amino-6-bromo-5-cyano-7-(2,3,5-tri-O-benzoyl-β-D-ribofuranosyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine；[(2R,3R,4R,5R)-5-(4-amino-6-bromo-5-cyanopyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3,4-dibenzoyloxyoxolan-2-yl]methyl benzoate
• CAS: 151707-53-8
• 化学式: C₃₃H₂₄BrN₅O₇
• 分子量: 682.487
• InChiKey: ZAWGKZQDLITTKU-NYBSAPDNSA-N

物化性质

• 沸点：
  859.5±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.56±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.5
• 重原子数：
  46
• 可旋转键数：
  11
• 环数：
  6.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.15
• 拓扑面积：
  169
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  (2R,3R,4R,5R)-2-(4-amino-6-bromo-5-cyano-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-((benzoyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate 在 氨 、 羟胺 、 sodium hydroxide 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 4-amino-9-(β-D-ribofuranosyl)pyrrolo<2,3-d:5,4-d'>dipyrimidin-5-one-7-thione
  参考文献：
  名称：

  Janus 型核苷作为潜在 HCV NS5B 聚合酶抑制剂的合成和评价

  摘要：

  报道了新核糖和 2'-β- C-甲基核糖 Janus 型核苷 J-AA、J-AG 和 J-AU 的合成以及它们阻断 HCV 和 HIV 复制的能力。还在 Huh7、人淋巴细胞、CEM 和 Vero 细胞中评估了它们的毒性。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2013.03.077
• 作为产物：
  描述：

  2-氨基-5-溴-1H-吡咯-3,4-二甲腈 在 三甲基氯硅烷 、 六甲基二硅氮烷 作用下， 以 乙二醇乙醚 为溶剂， 反应 45.0h， 生成 (2R,3R,4R,5R)-2-(4-amino-6-bromo-5-cyano-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-5-((benzoyloxy)methyl)tetrahydrofuran-3,4-diyl dibenzoate
  参考文献：
  名称：

  新型的组蛋白甲基转移酶DOT1L的小分子抑制剂，具有腈作为重卤素原子的非传统替代物。

  摘要：

  公开了许多新的核苷衍生物作为DOT1L活性的抑制剂。SARs证实，可以通过在5位（5、6、12）掺入极性基团和小的杂环或通过使用其他含氮碱基（18）来实现DOT1L抑制。根据这些结果，CN-SAH（19）被确定为DOT1L活性的有效和选择性抑制剂，其中结晶晶体显示极性5腈基结合在DOT1L的疏水口袋中。此外，我们表明极性腈基可以用作重卤素原子的非传统替代物。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2016.07.041

文献信息

• Total Synthesis of the Naturally Occurring Antibiotic Toyocamycin Using New and Improved Synthetic Procedures
  作者：Anthony R. Porcari、Leroy B. Townsend

  DOI：10.1080/15257779908043063

  日期：1999.2

  Starting with commercially available tetracyanoethylene, we describe a more efficient and higher yielding synthesis of toyocamycin with regards to convenience, overall yield, and total reaction time than those syntheses previously reported.

  从可商购获得的四氰基乙烯开始，我们在便利性，总收率和总反应时间方面比以前报道的合成描述了更有效和更高收率的邻苯二酚。
• Exploiting Protein Conformational Change to Optimize Adenosine-Derived Inhibitors of HSP70
  作者：Matthew D. Cheeseman、Isaac M. Westwood、Olivier Barbeau、Martin Rowlands、Sarah Dobson、Alan M. Jones、Fiona Jeganathan、Rosemary Burke、Nadia Kadi、Paul Workman、Ian Collins、Rob L. M. van Montfort、Keith Jones

  DOI：10.1021/acs.jmedchem.5b02001

  日期：2016.5.26

  importance in oncology, this protein has become a popular target for drug discovery, efforts which have as yet brought little success. This study demonstrates that adenosine-derived HSP70 inhibitors potentially bind to the protein with a novel mechanism of action, the stabilization by desolvation of an intramolecular salt-bridge which induces a conformational change in the protein, leading to high affinity

  HSP70 是一种分子伴侣，是热休克反应的关键组成部分。由于其在肿瘤学中的重要性，这种蛋白质已成为药物发现的热门目标，但这些努力尚未取得成功。该研究表明，腺苷衍生的 HSP70 抑制剂可能以一种新的作用机制与蛋白质结合，通过分子内盐桥的去溶剂化来稳定化，从而诱导蛋白质的构象变化，从而产生高亲和力配体。我们还证明，通过这种机制的应用，可以以合理的方式优化腺苷衍生的 HSP70 抑制剂。
• Studies on the Glycosylation of Pyrrolo[2,3-<i>d</i>] Pyrimidines with 1-<i>O</i>-Acetyl-2,3,5-Tri-<i>O</i>-Benzoyl-β-D-Ribofuranose: The Formation of Regioisomers During Toyocamycin and 7-Deazainosine Syntheses
  作者：Peter Leonard、Sachin A. Ingale、Ping Ding、Xin Ming、Frank Seela

  DOI：10.1080/15257770903091953

  日期：2009.8.11

  Glycosylation of silylated 4-amino-6-bromo-5-cyano-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine (9) with 1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-benzoyl-β-d-ribofuranose (10) under “one-pot” glycosylation conditions (MeCN, TMSOTf) yielded the N-7 isomer 11 together with the N-1 compound 13 (ratio = 2:1). When the same conditions were applied to 4-hydroxy-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine (21) the N-3 isomer 22 was the only glycosylation product

  甲硅烷基化 4-amino-6-bromo-5-cyano-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidine (9) 与 1-O-acetyl-2,3,5-tri-O-benzoyl-β- 的糖基化d-呋喃核糖 (10) 在“一锅”糖基化条件（MeCN，TMSOTf）下产生 N-7 异构体 11 和 N-1 化合物 13（比例 = 2:1）。当将相同条件应用于 4-羟基-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶 (21) 时，N-3 异构体 22 是唯一以几乎定量产率形成的糖基化产物。
• Selectivity between N-1 and N-7 nucleosides: regioselective synthesis of BMK-Y101, a potent cdk7 and 9 inhibitor
  作者：Young-Jong Kim、Soon Ho Kwon、Il Hak Bae、B. Moon Kim

  DOI：10.1016/j.tetlet.2013.07.132

  日期：2013.10

  BMK-Y101 is a new pyrrolo[2,3-d]pyrimidine-based potent cdk7 and 9 inhibitor, which is characterized by an intriguing structural feature of N-1 nucleoside, departing from previously reported N-7 nucleoside Cdk inhibitor, xylocydine. Though N-1 nucleosides have appeared in the literature, they have often been considered as kinetic products and thus intermediates of N-7 glycosylation. In the course of the synthetic studies of xylocydine derivatives, we have developed a highly regioselective method to obtain the N-1 nucleoside. The origin of the selectivity is apparently based on the reactivity of the silylated nucleobase and the stability of the resulting N-1 nucleoside. The choice of BSA as a silylating agent was critical in securing the N-1 nucleoside, BMK-Y101. On the other hand, proper selection of reaction conditions promoting transglycosylation provides an efficient route to N-7 nucleosides. (C) 2013 Elsevier Ltd. All rights reserved.