1-((2R,4S,5S)-4-azido-5-((tert-butyldimethylsilyloxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 120625-01-6

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-((2R,4S,5S)-4-azido-5-((tert-butyldimethylsilyloxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: 3'-azido-5'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-2',3'-dideoxyuridine；1-[(2R,4S,5S)-4-azido-5-[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxymethyl]oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 120625-01-6
• 化学式: C₁₅H₂₅N₅O₄Si
• 分子量: 367.48
• InChiKey: WZKSWVAOZGWYCU-DMDPSCGWSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  2.52
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.73
• 拓扑面积：
  82.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-((2R,4S,5S)-4-azido-5-((tert-butyldimethylsilyloxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione 在 palladium on activated charcoal ammonium hydroxide 、 四丁基氟化铵 、 氢气 、 三乙胺 、 三氯氧磷 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 吡啶 、 乙醇 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 40.0h， 生成 N4-benzoyl-3'-aminotrityl-2',3'-dideoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  N3'-> P5'寡脱氧核糖核苷酸磷酸氨基甲酸酯：一种基于亚磷酰胺胺交换反应的新合成方法。

  摘要：

  展示了一种合成N3'-> P5'氨基磷酸亚氨基寡脱氧核苷酸的新方法。本文描述了亚磷酰胺交换反应中所用单体的合成以及与这种新的链组装方式有关的实验细节。亚磷酰胺交换法在每个循环中产生的偶联收率在92-95％的范围内，并且无需进行仪器修饰即可合成嵌合的氨基磷酸酯/磷酸二酯或氨基磷酸酯/硫代磷酸酯寡核苷酸。

  DOI：

  10.1021/jo970801t
• 作为产物：
  描述：

  4(R)-azido-5(S)-<<(tert-butyldimethylsilyl)oxy>methyl>-3,4-dihydro-5H-furan-2-one 在 吡啶 、 四氯化锡 、 二异丁基氢化铝 作用下， 以 正己烷 、 二氯甲烷 、 乙腈 为溶剂， 反应 35.0h， 生成 1-((2R,4S,5S)-4-azido-5-((tert-butyldimethylsilyloxy)methyl)tetrahydrofuran-2-yl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  立体选择性合成3-azido-2,3-dideoxy-D-ribose衍生物及其在合成抗HIV核苷中的用途† ‡

  摘要：

  描述了使用3-叠氮基-2,3-二脱氧-D-核糖衍生物7作为关键中间体合成3'-叠氮基核苷的详细说明。从D-甘露糖醇以制备规模分8步合成关键中间体7。叠氮化物基团与α，β-不饱和-γ-丁内酯4的迈克尔反应受5-O位置取代基的空间体积的影响。在5-O处大体积的叔丁基二苯基甲硅烷基取代几乎仅产生α-叠氮基加合物5b，而在5-O处的不取代产生α-和β-加合物的1：1混合物。叠氮乙酸酯7a缩合反应中α与β异构体的比例所用溶剂和路易斯酸催化剂对制备AZT和AZDU的嘧啶碱有很大影响。在12（AZDU，CS-87）的合成中，二氯乙烷和三氟甲磺酸三甲基硅烷基酯的组合产生了最佳结果，而在14（AZT）的情况下，各种条件产生的α，β端基异构体比率相似。叠氮基中间体7b也用于合成3'-叠氮基嘌呤样核苷16-27。糖基化也受到路易斯酸催化剂的影响。三氟化硼醚化物可制得所需的N 1-糖基化化合物，其中α-端基异构体

  DOI：

  10.1002/jhet.5570300543

文献信息

• One-pot synthesis of novel 2′-deoxyuridine derivatives containing α-aminophosphonate moieties
  作者：Zhi-Qiang Shang、Ru-Yu Chen、You Huang

  DOI：10.1002/hc.20288

  日期：2007.4

  A series of α-aminophosphonate derivatives of 2′-deoxyuridine (8a–k) have been prepared from 5′-O-tert-butyldimethylsilyl-3′-amino-2′, 3′-dideoxyuridine in good yields. The structures of all the products were confirmed by 1H NMR, 31P NMR, 31C NMR, and IR spectroscopy, and mass spectrometry and elemental analyses. © 2007 Wiley Periodicals, Inc. Heteroatom Chem 18:230–235, 2007; Published online in Wiley

  已经从 5'-O-叔丁基二甲基甲硅烷基-3'-氨基-2', 3'-双脱氧尿苷以良好的收率制备了一系列 2'-脱氧尿苷 (8a-k) 的 α-氨基膦酸酯衍生物。所有产物的结构均经1H NMR、31P NMR、31C NMR、IR光谱、质谱和元素分析确证。© 2007 Wiley Periodicals, Inc. 杂原子化学 18:230–235, 2007; 在线发表于 Wiley InterScience (www.interscience.wiley.com)。DOI 10.1002/hc.20288
• Synthesis and evaluation of 3′-azido-2′,3′-dideoxypurine nucleosides as inhibitors of human immunodeficiency virus
  作者：Hong-wang Zhang、Steven J. Coats、Lavanya Bondada、Franck Amblard、Mervi Detorio、Ghazia Asif、Emilie Fromentin、Sarah Solomon、Aleksandr Obikhod、Tony Whitaker、Nicolas Sluis-Cremer、John W. Mellors、Raymond F. Schinazi

  DOI：10.1016/j.bmcl.2009.11.031

  日期：2010.1

  Based on the promising drug resistance profile and potent anti-HIV activity of β-d-3′-azido-2′,3′-dideoxyguanosine, a series of purine modified nucleosides were synthesized by a chemical transglycosylation reaction and evaluated for their antiviral activity, cytotoxicity, and intracellular metabolism. Among the synthesized compounds, several show potent and selective anti-HIV activity in primary lymphocytes

  基于 β- d -3'-azido-2',3'-dideoxyguanosine具有良好的耐药性和强大的抗 HIV 活性，通过化学转糖基化反应合成了一系列嘌呤修饰的核苷，并评估了它们的抗病毒活性、细胞毒性和细胞内代谢。在合成的化合物中，有几种在原代淋巴细胞中显示出有效和选择性的抗 HIV 活性。
• Solid phase synthesis of oligonucleotide N3'-P5' phosphoramidates
  申请人：Lynx Therapeutics, Inc.

  公开号：US05824793A1

  公开（公告）日：1998-10-20

  The invention provides a method of synthesizing oligonucleotide N3'.fwdarw.P5' phosphoramidates using an amine-exchange reaction of phosphoramidites in which a deprotected 3'-amino group of a solid phase supported oligonucleotide chain is exhanged for the amino portion of a 5'-phosphoramidite of an incoming monomer which has a protected 3'-amino group. The resulting internucleotide phosphoramidite linkage is then oxidized to form a stable protected phosphoramidate linkage. The method of the invention greatly improves product yields and reduces reagent usage over currently available methods for synthesizing the above class of compound.

  本发明提供了一种合成寡核苷酸N3'.fwdarw.P5'磷酰胺酯的方法，使用磷酰胺酯的胺交换反应，在该反应中，固相支持的寡核苷酸链的去保护3'-氨基基团被交换为一个具有受保护的3'-氨基基团的进入单体的5'-磷酰胺酯的氨基部分。然后，将产生的核苷间磷酰胺酯酯键氧化，形成稳定的受保护磷酰胺酯酯键。本发明的方法大大提高了产物收率，并减少了目前可用于合成上述类化合物的方法中的试剂使用。
• Synthons for synthesis of oligonucleotide N3-P5 phosphoramidates
  申请人：Lynx Therapeutics, Inc.

  公开号：US05859233A1

  公开（公告）日：1999-01-12

  The invention provides a method of synthesizing oligonucleotide N3'.fwdarw.P5' phosphoramidates using an amine-exchange reaction of phosphoramidites in which a -deprotected 3'-amino group of a solid phase supported oligonucleotide chain is exhanged for the amino portion of a 5'-phosphoramidite of an incoming monomer which has a protected 3'-amino group. The resulting internucleotide phosphoramidite linkage is then oxidized to form a stable protected phosphoramidate linkage. The method of the invention greatly improves product yields and reduces reagent usage over currently available methods for synthesizing the above class of compound.

  本发明提供了一种合成寡核苷酸N3'.fwdarw.P5'磷酰胺酰胺的方法，使用磷酰胺酰胺的胺交换反应，在该反应中，固相支持的寡核苷酸链的去保护的3'-氨基基团被交换为一个具有保护的3'-氨基基团的进入单体的5'-磷酰胺酰胺的氨基部分。然后，将得到的核苷酸间磷酰胺酰胺键氧化形成稳定的保护磷酰胺酰胺键。本发明的方法大大提高了产物收率，并减少了合成上述类化合物的当前可用方法所需的试剂用量。
• 3'-AZIDO PURINE NUCLEOTIDE PRODRUGS FOR TREATMENT OF VIRAL INFECTIONS
  申请人：Schinazi, Ph.D. Raymond F.

  公开号：US20120135951A1

  公开（公告）日：2012-05-31

  The present invention is directed to compounds, compositions and methods for treating or preventing viral infections, in particular, HIV, and HBV, in human patients or other animal hosts. The compounds are 3′-azido-2′,3′-dideoxy purine monophosphates, and pharmaceutically acceptable, salts, prodrugs, and other derivatives thereof. In particular, the compounds show potent antiviral activity against HIV-1 and HBV.

  本发明涉及用于治疗或预防病毒感染的化合物、组合物和方法，特别是针对人类患者或其他动物宿主的HIV和HBV。该化合物是3'-氮杂基-2'，3'-二脱氧嘌呤单磷酸盐，以及其药学上可接受的盐、前药和其他衍生物。特别是，该化合物对HIV-1和HBV表现出强大的抗病毒活性。