我们描述了一种通过逐步
硫代乙酰化和酸裂解从未分离的蛋白质消化物中的肽的N末端生成多个小序列的方法。一系列N末端降解的肽之间的质量差异给出了确定长度的短序列。这样的短“序列标签”与亲本肽的质量一起可以用于识别数据库中的蛋白质。无需使用链
终止剂或等分试样即可生成序列阶梯,并且降解试剂是
水溶性的,因此可以对固定在C-18反相载体上的肽进行
化学反应,而不会由于用有机溶剂洗涤而造成任何肽损失就像在Edman类型排序中一样。整个过程可以自动化,我们介绍了一种用于并行分析多个样品的原型设备。我们证明了该
化学标记方法与Edman测序,肽质量指纹图谱和从HPLC分离由57种蛋白质组成的大肠杆菌
核糖体复合物获得的粗蛋白级分的MS / MS分析相比具有有效性。我们表明,
化学标记是在深入的MS / MS分析之前使用的可行的首过高通量鉴定方法。