3-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethylsulfanyl]-2-hydroxy-3-oxopropanoic acid | 264126-54-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 3-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethylsulfanyl]-2-hydroxy-3-oxopropanoic acid
• CAS: 264126-54-7
• 化学式: C₂₄H₃₈N₇O₂₀P₃S
• 分子量: 869.588
• InChiKey: LOZMZPIMDDLWRS-KOQRGSBKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6.5
• 重原子数：
  55
• 可旋转键数：
  22
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.62
• 拓扑面积：
  447
• 氢给体数：
  11
• 氢受体数：
  25

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  丙醇二酸 、 辅酶 A 在 malonyl-CoA synthetase from Rhizobium trifolii 、 5’-三磷酸腺苷 、 magnesium chloride 作用下， 反应 24.0h， 生成 3-[2-[3-[[(2R)-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanoyl]amino]propanoylamino]ethylsulfanyl]-2-hydroxy-3-oxopropanoic acid
  参考文献：
  名称：

  建立用于前体导向的聚酮化合物生物合成的工具包：探索酸性CoA利加斯的底物混杂

  摘要：

  聚酮化合物是化学上多样化且具有医学上重要意义的生物化学物质，它们是通过聚酮化合物合酶从酰基辅酶A前体生物合成的。聚酮化合物的组合生物合成的局限性之一是缺少工具包，该工具包描述了递送聚酮化合物生物合成所必需的新型酰基-CoA前体的方法。使用从各种植物和微生物中获得的5种酸性CoA连接酶，我们通过针对123种羧酸的文库筛选每种酸性CoA连接酶，生物合成了79种酰基CoA硫酯的初始文库。酰基-CoA硫酯库包括肉桂基-CoA，3-苯基丙酰基-CoA，苯甲酰基-CoA，苯乙酰基-CoA，丙二酰-CoA，饱和和不饱和脂族CoA硫酯和双环芳族CoA硫酯的衍生物。在我们对新型酰基辅酶A前体的生物合成路线的搜索中，我们发现了两种以前未报道过的丙二酰辅酶A衍生物（3-硫代苯丙氨酰辅酶A和苯基丙二酰辅酶A），无法通过规范的丙二酰辅酶A合成酶生产。该报告强调了确定常规底物池之外底物混杂的实用性和重要性，并描述了建

  DOI：

  10.1021/bi300425j

文献信息

• Bio-intermediates for use in the chemical synthesis of polyketides
  申请人：——

  公开号：US20040018598A1

  公开（公告）日：2004-01-29

  The present invention relates to compounds made by a subset of modules from one or more polyketide synthase (“PKS”) genes that are used as starting material in the chemical synthesis of novel molecules, particularly naturally occurring polyketides or derivatives thereof. The biologically derived intermediates (“bio-intermediates”) generally represent particularly difficult compounds to synthesize using traditional chemical approaches due to one or more stereocenters. In one aspect of the invention, an intermediate in the synthesis of epothilone is provided that feeds into the synthetic protocol of Danishefsky and co-workers. In another aspect of the invention, intermediates in the synthesis of discodermolide are provided that feed into the synthetic protocol of Smith and co-workers. By taking advantage of the inherent stereochemical specificity of biological processes, the syntheses of key intermediates and thus the overall syntheses of compounds like epothilone and discodermolide are greatly simplified.

  本发明涉及由一个或多个聚酮合酶合成酶（“PKS”）基因的子模块制备的化合物，这些化合物作为起始物质用于化学合成新颖分子，特别是天然存在的聚酮类化合物或其衍生物。生物衍生的中间体（“生物中间体”）通常代表着尤其难以使用传统化学方法合成的化合物，因为其中一个或多个立体中心。在本发明的一个方面，提供了用于累积素合成的中间体，该中间体进入Danishefsky及其同事的合成方案。在本发明的另一个方面，提供了用于二十碳二烯酮合成的中间体，这些中间体进入Smith及其同事的合成方案。通过利用生物过程固有的立体化学特异性，关键中间体的合成以及诸如累积素和二十碳二烯酮等化合物的整体合成大大简化了。
• Methods to mediate polyketide synthase module effectiveness
  申请人：——

  公开号：US20030068676A1

  公开（公告）日：2003-04-10

  Linking sequences which modulate cross-talk between modules of Type I polyketide synthases have been identified. Thus, arbitrarily chosen modules can be mixed and matched by supplying the appropriate linkers to obtain desired polyketide synthases and new polyketides. The modules are provided suitable linkers so that the polyketide chain is passed from one module to the other in the correct sequence. Synthetic peptides which mimic linkers can be used to inhibit the synthesis of polyketides. Kinetic channeling, both intrapolypeptide and interpolypeptide, of diketide intermediates in a Type I polyketide synthase can occur.

  已经确定了可调节 I 型聚酮酸酯合成酶模块之间相互联系的连接序列。因此，可以通过提供适当的连接体来混合和匹配任意选择的模块，从而获得所需的多酮苷合成酶和新的多酮苷。为模块提供适当的连接体，使多酮链以正确的顺序从一个模块传递到另一个模块。模仿连接体的合成肽可用于抑制多酮的合成。I 型多酮苷合成酶中的二酮苷中间体可能会出现多肽内和多肽间的动力学通道。
• Maytansines and maytansine conjugates
  申请人：——

  公开号：US20030109682A1

  公开（公告）日：2003-06-12

  Cytotoxin-targeting molecule conjugates comprising cytotoxin and an antibody, growth factor, or polysaccharide together with a pH-sensitive or redox potential-sensitive linker. Novel ansamitocins and recombinant genes and organisms that produce them. The use of the described conjugates in the treatment of cancer and other hyperproliferation diseases.

  细胞毒素-靶向分子共轭物，包括细胞毒素和抗体、生长因子或多糖，以及 pH 敏感或氧化还原电位敏感的连接体。新型ansamitocins和重组基因以及产生它们的生物体。所述共轭物在治疗癌症和其他过度增殖疾病中的应用。
• METHODS TO MEDIATE POLYKETIDE SYNTHASE MODULE EFFECTIVENESS
  申请人：THE BOARD OF TRUSTEES OFTHE LELAND STANFORD JUNIOR UNIVERSITY

  公开号：EP1153124A2

  公开（公告）日：2001-11-14
• BIO-INTERMEDIATES FOR USE IN THE CHEMICAL SYNTHESIS OF POLYKETIDES
  申请人：Kosan Biosciences, Inc.

  公开号：EP1307579A2

  公开（公告）日：2003-05-07