1'-(2',3'-di-O-tert-butyldimethylsilyl-β-D-arabinofuranosyl)-4-N-acetylcytosine | 310409-10-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1'-(2',3'-di-O-tert-butyldimethylsilyl-β-D-arabinofuranosyl)-4-N-acetylcytosine
• 英文别名: N-[1-[(2R,3S,4R,5R)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]acetamide
• CAS: 310409-10-0
• 化学式: C₂₃H₄₃N₃O₆Si₂
• 分子量: 513.782
• InChiKey: LJTLAERDCHDNTQ-RSPOEFSDSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.87
• 重原子数：
  34
• 可旋转键数：
  9
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1'-(2',3'-di-O-tert-butyldimethylsilyl-β-D-arabinofuranosyl)-4-N-acetylcytosine 在 吡啶 、 chromium(VI) oxide 、 乙酸酐 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.12h， 生成 N-[1-[(2R,3S,4R,5S)-3,4-bis[[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy]-5-formyloxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-4-yl]acetamide
  参考文献：
  名称：

  尿苷，胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷的膦酸酯衍生物的合成。

  摘要：

  尿苷，胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷（ara-C）的乙烯基膦酸酯衍生物是通过将适当保护的核苷氧化成5'醛并与[（二乙氧基膦基）亚甲基]三苯基磷烷进行Wittig缩合反应制得的。用AD-mix试剂将这些乙烯基膦酸酯二羟基化，生成新的5'，6'-二羟基-6'-膦酸酯。在膦酸酯和各种保护基水解后，测试了六种膦酸作为核苷酸单磷酸激酶底物的能力以及对K562细胞的毒性。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(00)00183-8
• 作为产物：
  描述：

  阿糖胞苷 在 吡啶 、 咪唑 、 三氟乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 甲醇 为溶剂， 生成 1'-(2',3'-di-O-tert-butyldimethylsilyl-β-D-arabinofuranosyl)-4-N-acetylcytosine
  参考文献：
  名称：

  胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷的5'-羟基-5'-膦酸酯衍生物的立体选择性合成。

  摘要：

  胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷（ara-C）的（R）-和（S）-5'-羟基5'-膦酸酯衍生物均通过亚磷酸酯加成或路易斯酸介导的适当保护的5'-核苷醛进行氢膦酰化而制得。亚磷酸酯被添加到作为2'，3'-丙酮化物保护的胞嘧啶醛中，主要生成5'R异构体，而亚磷酸酯添加到相应的2'，3'-bis TBS衍生物则有利于5'S立体化学。相反，亚磷酸酯加到由ara-C衍生的2'，3'-双TBS保护的醛中仅得到5'R加合物。但是，相同的ara-C醛的TiCl（4）介导的氢膦酰化作用以2：1的比例有利于5'S立体异构体。一旦所有四个非对映异构体都存在，这些化合物的立体化学可根据其光谱数据或从其O-甲基扁桃酸酯衍生物获得。在膦酸酯和各种保护基水解后，测试了四种α-羟基膦酸作为核苷单磷酸激酶底物的能力以及对K562细胞的毒性。

  DOI：

  10.1021/jo020483k

文献信息

• α-Phosphono Lactone Analogues of Cytidine and Cytosine Arabinoside Diphosphates:  Synthesis via Ring Closing Metathesis
  作者：Xuemei Chen、David F. Wiemer

  DOI：10.1021/jo0300136

  日期：2003.8.1

  cytidine aldehydes, and gave some stereoselectivity in additions to an aldehyde derivative of ara-C. The resulting homoallylic alcohols were used as substrates in attempted Knovenagel and Horner-Wadsworth-Emmons condensations, but elimination was found to predominate over lactone formation under the conditions employed. The desired alpha-phosphono lactones could be prepared through a reaction sequence that

  核苷胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷的α-膦酸内酯衍生物已由相应的核苷醛制备。发现与这些醛的烯丙基化反应的立体化学结果取决于对2'-和3'-羟基的保护基的选择以及在某种程度上取决于所使用的路易斯酸催化剂的性质。最终，发现条件有利于来自不同胞嘧啶醛的5'R或5'S非对映异构体，并且除了ara-C的醛衍生物之外还提供了一些立体选择性。在尝试的Knovenagel和Horner-Wadsworth-Emmons缩合尝试中，所得的均丙醇被用作底物，但发现在所采用的条件下，消除作用比内酯的形成更为重要。
• Synthesis of 5‘-Amino-5‘-phosphonate Analogues of Pyrimidine Nucleoside Monophosphates
  作者：Xuemei Chen、David F. Wiemer

  DOI：10.1021/jo030050x

  日期：2003.8.1

  diastereoselective, with the cytidine and uridine derivatives favoring the 5'S stereochemistry and the ara-C derivative favoring the 5'R isomer. The stereochemistry of one cytidine derivative was established by single-crystal diffraction analysis, and detailed comparisons of the (13)C NMR data allowed assignments of the other amino phosphonates.

  胞苷，胞嘧啶阿拉伯糖苷（ara-C）和尿苷的5'-氨基-5'-膦酰基衍生物已通过相应的核苷醛制备。在衍生自核苷醛和对甲氧基苄胺的亚胺中添加亚磷酸酯是有效的，使用该胺可将产物裂解为母体氨基膦酸。亚磷酸酯的添加被证明是非对映选择性的，胞苷和尿苷衍生物有利于5'S立体化学，而ara-C衍生物有利于5'R异构体。通过单晶衍射分析确定了一种胞苷衍生物的立体化学，对（13）C NMR数据进行的详细比较允许对其他氨基膦酸酯进行赋值。
• Phosphonate Analogues of Cytosine Arabinoside Monophosphate
  作者：Xuemei Chen、Kang-Yeoun Jung、David F. Wiemer、Andrew J. Wiemer、Raymond J. Hohl

  DOI：10.1080/10426500212248

  日期：2002.6.1

  Phosphonate derivatives of cytidine and cytosine arabinoside have been prepared from the corresponding nucleoside aldehydes and tested for their ability to serve as substrates for nucleotide monophosphate kinase and for their toxicity to K562 leukemia cells.
• Prodrugs of Ara-CMP and Ara-AMP with a<i>S</i>-Acyl-2-thioethyl (SATE) Biolabile Phosphate Protecting Group: Synthesis and Biological Evaluation
  作者：R. Bazzanini、S. Manfredini、E. Durini、B. Gröschel、J. Cinatl、J. Balzarini、E. De Clercq、J-L. Imbach、C. Périgaud、G. Gosselin

  DOI：10.1080/15257779908041616

  日期：1999.4

  The bis(S-pivaloyl-2-thioethyl) phosphotriesters of Ara-C and Ara-A were synthesized as potential bioreversible mononucleotide prodrugs. Some N- and O-acylated derivatives were also prepared with the aim to modify the lipophilicity of the title pronucleotides. Compounds were tested far their antitumor/antiviral activity against a variety of tumor cells and viruses.
• Stereoselective Synthesis of the 5‘-Hydroxy-5‘-phosphonate Derivatives of Cytidine and Cytosine Arabinoside
  作者：Xuemei Chen、Andrew J. Wiemer、Raymond J. Hohl、David F. Wiemer

  DOI：10.1021/jo020483k

  日期：2002.12.1

  Both the (R)- and (S)-5'-hydroxy 5'-phosphonate derivatives of cytidine and cytosine arabinoside (ara-C) have been prepared via phosphite addition or a Lewis acid mediated hydrophosphonylation of appropriately protected 5'-nucleoside aldehydes. Phosphite addition to a cytosine aldehyde protected as the 2',3'-acetonide gave predominately the 5'R isomer, while phosphite addition to the corresponding

  胞苷和胞嘧啶阿拉伯糖苷（ara-C）的（R）-和（S）-5'-羟基5'-膦酸酯衍生物均通过亚磷酸酯加成或路易斯酸介导的适当保护的5'-核苷醛进行氢膦酰化而制得。亚磷酸酯被添加到作为2'，3'-丙酮化物保护的胞嘧啶醛中，主要生成5'R异构体，而亚磷酸酯添加到相应的2'，3'-bis TBS衍生物则有利于5'S立体化学。相反，亚磷酸酯加到由ara-C衍生的2'，3'-双TBS保护的醛中仅得到5'R加合物。但是，相同的ara-C醛的TiCl（4）介导的氢膦酰化作用以2：1的比例有利于5'S立体异构体。一旦所有四个非对映异构体都存在，这些化合物的立体化学可根据其光谱数据或从其O-甲基扁桃酸酯衍生物获得。在膦酸酯和各种保护基水解后，测试了四种α-羟基膦酸作为核苷单磷酸激酶底物的能力以及对K562细胞的毒性。