I型聚酮化合物合酶(PKS)是巨大的多域蛋白,可合成许多治疗剂和其他
天然产物。合成通过
硫代模板机理进行,其中中间体共价附于PKS。最终的聚酮化合物的释放是通过末端
硫酯酶(TE)域通过
水解,酯交换或大环化来催化的。PKS 6-脱氧
赤藓醇B合酶(DEBS)产生具有临床意义的抗生素
红霉素的14元大环内酯核心。DEBS的TE结构域(DEBS TE)对天然和修饰底物的
水解或大环化具有公认的,经验确定的特异性。我们目前正在努力了解使用一组新颖的二苯基烷基
膦酸酯在DEBS TE中
硫酯酶反应特异性的结构基础,模拟由DEBS TE专门环化或
水解的底物。我们已经确定了仅在1.7Å处的DEBS TE的新构建体的结构,并且以2.1Å的分辨率与简单的
烯丙基膦酸酯结合的DEBS TE。其他更复杂的二苯基烷基
膦酸酯会抑制DEBS TE,但我们无法可视化这些与DEBS TE配合的忠实环化类似物。这项工作代表着使用与复杂底物类似物复合的DEBS