3'-O-allyl-5-[3-(2,2,2-trifluoroacetamide)-prop-1-ynyl]-2'-deoxycytidine | 666848-15-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 3'-O-allyl-5-[3-(2,2,2-trifluoroacetamide)-prop-1-ynyl]-2'-deoxycytidine
• 英文别名: 3'-O-allyl-5-[3-[(trifluoroacetyl)amino]prop-1-ynyl]-2'-deoxycytidine；3'-O-Allyl-5-{3-[(trifluoroacetyl)amino]prop-1-ynyl}-2'-deoxycytidine；N-[3-[4-amino-1-[(2R,4S,5R)-5-(hydroxymethyl)-4-prop-2-enoxyoxolan-2-yl]-2-oxopyrimidin-5-yl]prop-2-ynyl]-2,2,2-trifluoroacetamide
• CAS: 666848-15-3
• 化学式: C₁₇H₁₉F₃N₄O₅
• 分子量: 416.357
• InChiKey: QTJFVYJFXUHVRH-YNEHKIRRSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.4
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.47
• 拓扑面积：
  127
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3'-O-allyl-5-[3-(2,2,2-trifluoroacetamide)-prop-1-ynyl]-2'-deoxycytidine 在 磷酸三甲酯 、 1,8-双二甲氨基萘 、 三氯氧磷 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 3.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Modified nucleotides for polynucleotide sequencing

  摘要：

  公开号：

  EP2607369B1
• 作为产物：
  描述：

  5-碘-2'-脱氧胞苷 在 咪唑 、 copper(l) iodide 、 四(三苯基膦)钯 、 四丁基氟化铵 、 sodium hydride 、 叔丁基二甲基氯硅烷 、 三乙胺 作用下， 以 四氢呋喃 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 83.0h， 生成 3'-O-allyl-5-[3-(2,2,2-trifluoroacetamide)-prop-1-ynyl]-2'-deoxycytidine
  参考文献：
  名称：

  Modified nucleotides for polynucleotide sequencing

  摘要：

  公开号：

  EP2607369B1

文献信息

• SYNTHESIS OF FOUR COLOR 3'O-ALLYL, MODIFIED PHOTOCLEAVABLE FLUORESCENT NUCLEOTIDES AND RELATED METHODS
  申请人：Ju Jingyue

  公开号：US20100041029A1

  公开（公告）日：2010-02-18

  This invention provides a process for making 3′-O-allyl-dGTP-PC-Biodopy-FL-510, 3′-O-allyl-dATP-PC-ROX, 3′-O-allyl-dCTP-PC- and 3′-O-allyl-dUTP-PC-R6G, and related methods.

  本发明提供了制备3'-O-烯丙基-dGTP-PC-Biodopy-FL-510、3'-O-烯丙基-dATP-PC-ROX、3'-O-烯丙基-dCTP-PC-和3'-O-烯丙基-dUTP-PC-R6G及相关方法的过程。
• FOUR-COLOR DNA SEQUENCING BY SYNTHESIS USING CLEAVABLE FLUORESCENT NUCLEOTIDE REVERSIBLE TERMINATORS
  申请人：The Trustees of Columbia University in the City of

  公开号：US20130280700A1

  公开（公告）日：2013-10-24

  This invention provides a process for sequencing single-stranded DNA employing modified nucleotides.

  本发明提供了一种使用修饰核苷酸测序单链DNA的方法。
• SYNTHESIS OF FOUR-COLOR 3'-O-ALLYL MODIFIED PHOTOCLEAVABLE FLUORESCENT NUCLEOTIDES AND RELATED METHODS
  申请人：Ju Jingyue

  公开号：US20160208313A1

  公开（公告）日：2016-07-21

  This invention provides a process for making 3′-O-allyl-dGTP-PC-Biodopy-FL-510, 3′-O-allyl-dATP-PC-ROX, 3′-O-allyl-dCTP-PC-Bodipy-650 and 3′-O-allyl-dUTP-PC-R6G, and related methods.

  本发明提供一种制备3'-O-烯丙基-dGTP-PC-Biodopy-FL-510、3'-O-烯丙基-dATP-PC-ROX、3'-O-烯丙基-dCTP-PC-Bodipy-650和3'-O-烯丙基-dUTP-PC-R6G及相关方法的过程。
• Four-color DNA sequencing by synthesis using cleavable fluorescent nucleotide reversible terminators
  申请人：The Trustees of Columbia University in the City of New York

  公开号：US10000801B2

  公开（公告）日：2018-06-19

  This invention provides a process for sequencing single-stranded DNA employing modified nucleotides.

  本发明提供了一种利用修饰核苷酸对单链 DNA 进行测序的方法。
• Synthesis of four-color 3′-O-allyl modified photocleavable fluorescent nucleotides and related methods
  申请人：The Trustees of Columbia University in the City of New York

  公开号：US10907194B2

  公开（公告）日：2021-02-02

  This invention provides a process for making 3′-O-allyl-dGTP-PC-Biodopy-FL-510, 3′-O-allyl-dATP-PC-ROX, 3′-O-allyl-dCTP-PC-Bodipy-650 and 3′-O-allyl-dUTP-PC-R6G, and related methods.

  本发明提供了一种制造 3′-O-烯丙基-dGTP-PC-Biodopy-FL-510、3′-O-烯丙基-dATP-PC-ROX、3′-O-烯丙基-dCTP-PC-Bodipy-650 和 3′-O-烯丙基-dUTP-PC-R6G 的工艺及相关方法。