2-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethyl)aminoethanol | 1172048-17-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 咪唑并嘧啶类
• 英文名称: 2-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethyl)aminoethanol
• 英文别名: 2-[[(3aR,4R,6R,6aR)-4-(6-aminopurin-9-yl)-2,2-dimethyl-3a,4,6,6a-tetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-6-yl]methylamino]ethanol
• CAS: 1172048-17-7
• 化学式: C₁₅H₂₂N₆O₄
• 分子量: 350.377
• InChiKey: WVZPPNDNYUUEOR-IDTAVKCVSA-N

物化性质

• 沸点：
  626.0±65.0 °C(Predicted)
• 密度：
  1.69±0.1 g/cm3(Temp: 20 °C; Press: 760 Torr)(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.3
• 重原子数：
  25
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.67
• 拓扑面积：
  130
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethyl)aminoethanol 在 咪唑 、 盐酸 、 碘 、 sodium cyanoborohydride 、 三苯基膦 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 N^δ-(5'-adenosyl)-N^δ-(2-iodoethyl)-(S)-2,5-diaminopentanoic acid hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  组蛋白甲基转移酶 DOT1L 的选择性抑制剂：设计、合成和晶体学研究

  摘要：

  组蛋白 H3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 在正常细胞分化以及急性白血病的发生中起关键作用。我们使用基于结构和机制的设计来发现几种有效的 DOT1L 抑制剂，IC(50) 值低至 38 nM。这些抑制剂对其他四种代表性组蛋白赖氨酸和精氨酸甲基转移酶 G9a、SUV39H1、PRMT1 和 CARM1 仅表现出微弱的活性或没有活性。DOT1L-抑制剂复合物的 X 射线晶体结构表明，抑制剂的 N6-甲基基团有利地位于 DOT1L 的主要疏水腔中，提供了观察到的高选择性。结构分析表明，它将破坏至少一个 H 键和/或对其他组蛋白甲基转移酶具有空间排斥。

  DOI：

  10.1021/ja206312b
• 作为产物：
  描述：

  2',3'-异丙叉腺苷 在 lithium aluminium tetrahydride 、 偶氮二甲酸二异丙酯 、 一水合肼 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醇 为溶剂， 反应 2.5h， 生成 2-((3aR,4R,6R,6aR)-6-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2,2-dimethyltetrahydrofuro[3,4-d][1,3]dioxol-4-ylmethyl)aminoethanol
  参考文献：
  名称：

  组蛋白甲基转移酶 DOT1L 的选择性抑制剂：设计、合成和晶体学研究

  摘要：

  组蛋白 H3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 在正常细胞分化以及急性白血病的发生中起关键作用。我们使用基于结构和机制的设计来发现几种有效的 DOT1L 抑制剂，IC(50) 值低至 38 nM。这些抑制剂对其他四种代表性组蛋白赖氨酸和精氨酸甲基转移酶 G9a、SUV39H1、PRMT1 和 CARM1 仅表现出微弱的活性或没有活性。DOT1L-抑制剂复合物的 X 射线晶体结构表明，抑制剂的 N6-甲基基团有利地位于 DOT1L 的主要疏水腔中，提供了观察到的高选择性。结构分析表明，它将破坏至少一个 H 键和/或对其他组蛋白甲基转移酶具有空间排斥。

  DOI：

  10.1021/ja206312b

文献信息

• SELECTIVE INHIBITORS OF HISTONE METHYLTRANSFERASE DOT1L
  申请人：BAYLOR COLLEGE OF MEDICINE

  公开号：US20140100184A1

  公开（公告）日：2014-04-10

  Structure and mechanism based design was used to design potent ribose containing inhibitors of DOT1L with IC 50 values as low as 38 nM. These ribose containing inhibitors exhibit only weak or no activities against four other representative histone lysine and arginine methyltransferases, G9a, SUV39H1, PRMT1 and CARM1.

  利用基于结构和机制的设计方法，设计出了具有IC50值低至38 nM的强效核糖含量的DOT1L抑制剂。这些核糖含量的抑制剂对其他四种代表性组蛋白赖氨酸和精氨酸甲基转移酶，G9a、SUV39H1、PRMT1和CARM1，仅表现出微弱或无活性。
• New <i>S</i>-Adenosyl-<scp>l</scp>-methionine Analogues: Synthesis and Reactivity Studies
  作者：Andrew P. Townsend、Stefanie Roth、Huw E. L. Williams、Eleni Stylianou、Neil R. Thomas

  DOI：10.1021/ol9009859

  日期：2009.7.16

  Two new and complementary synthetic strategies for 5'-N-chloroethylamino-5'-deoxyadenosines are presented. Additionally, the reaction kinetics of their conversion into aziridines under typical enzyme assay conditions is reported using time-resolved NMR spectroscopy. A stable photocaged derivative of 5'-N-chloroethylamino-5'-deoxyadenosine has also been synthesized, and its stability and activation In aqueous solution at physiological pH have been examined.
• Selective Inhibitors of Histone Methyltransferase DOT1L: Design, Synthesis, and Crystallographic Studies
  作者：Yuan Yao、Pinhong Chen、Jiasheng Diao、Gang Cheng、Lisheng Deng、Justin L. Anglin、B. V. Venkataram Prasad、Yongcheng Song

  DOI：10.1021/ja206312b

  日期：2011.10.26

  Histone H3-lysine79 (H3K79) methyltransferase DOT1L plays critical roles in normal cell differentiation as well as initiation of acute leukemia. We used structure- and mechanism-based design to discover several potent inhibitors of DOT1L with IC(50) values as low as 38 nM. These inhibitors exhibit only weak or no activities against four other representative histone lysine and arginine methyltransferases

  组蛋白 H3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 在正常细胞分化以及急性白血病的发生中起关键作用。我们使用基于结构和机制的设计来发现几种有效的 DOT1L 抑制剂，IC(50) 值低至 38 nM。这些抑制剂对其他四种代表性组蛋白赖氨酸和精氨酸甲基转移酶 G9a、SUV39H1、PRMT1 和 CARM1 仅表现出微弱的活性或没有活性。DOT1L-抑制剂复合物的 X 射线晶体结构表明，抑制剂的 N6-甲基基团有利地位于 DOT1L 的主要疏水腔中，提供了观察到的高选择性。结构分析表明，它将破坏至少一个 H 键和/或对其他组蛋白甲基转移酶具有空间排斥。