N^δ-(5'-adenosyl)-N^δ-(2-iodoethyl)-(S)-2,5-diaminopentanoic acid hydrochloride | 1338595-98-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 5'-脱氧核糖核苷
• 英文名称: N^δ-(5'-adenosyl)-N^δ-(2-iodoethyl)-(S)-2,5-diaminopentanoic acid hydrochloride
• 英文别名: Nδ-(5'-adenosyl)-Nδ-(2-iodoethyl)-(S)-2,5-diaminopentanoic acid hydrochloride；(2S)-2-amino-5-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl-(2-iodoethyl)amino]pentanoic acid;hydrochloride
• CAS: 1338595-98-4
• 化学式: C₁₇H₂₆IN₇O₅*ClH
• 分子量: 571.803
• InChiKey: IKRWHKYRGJXHKB-SXOFXASESA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.62
• 重原子数：
  31
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.65
• 拓扑面积：
  186
• 氢给体数：
  6
• 氢受体数：
  11

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5-氨基-5-脱氧-2,3-O-(1-甲基亚乙基)-腺苷酸 在 咪唑 、 盐酸 、 lithium aluminium tetrahydride 、 碘 、 sodium cyanoborohydride 、 三乙胺 、 三苯基膦 作用下， 以 四氢呋喃 、 1,4-二氧六环 、 甲醇 、 乙醇 、 二氯甲烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成 N^δ-(5'-adenosyl)-N^δ-(2-iodoethyl)-(S)-2,5-diaminopentanoic acid hydrochloride
  参考文献：
  名称：

  组蛋白甲基转移酶 DOT1L 的选择性抑制剂：设计、合成和晶体学研究

  摘要：

  组蛋白 H3-赖氨酸 79 (H3K79) 甲基转移酶 DOT1L 在正常细胞分化以及急性白血病的发生中起关键作用。我们使用基于结构和机制的设计来发现几种有效的 DOT1L 抑制剂，IC(50) 值低至 38 nM。这些抑制剂对其他四种代表性组蛋白赖氨酸和精氨酸甲基转移酶 G9a、SUV39H1、PRMT1 和 CARM1 仅表现出微弱的活性或没有活性。DOT1L-抑制剂复合物的 X 射线晶体结构表明，抑制剂的 N6-甲基基团有利地位于 DOT1L 的主要疏水腔中，提供了观察到的高选择性。结构分析表明，它将破坏至少一个 H 键和/或对其他组蛋白甲基转移酶具有空间排斥。

  DOI：

  10.1021/ja206312b

文献信息

• SELECTIVE INHIBITORS OF HISTONE METHYLTRANSFERASE DOT1L
  申请人：BAYLOR COLLEGE OF MEDICINE

  公开号：US20140100184A1

  公开（公告）日：2014-04-10

  Structure and mechanism based design was used to design potent ribose containing inhibitors of DOT1L with IC 50 values as low as 38 nM. These ribose containing inhibitors exhibit only weak or no activities against four other representative histone lysine and arginine methyltransferases, G9a, SUV39H1, PRMT1 and CARM1.

  利用基于结构和机制的设计方法，设计出了具有IC50值低至38 nM的强效核糖含量的DOT1L抑制剂。这些核糖含量的抑制剂对其他四种代表性组蛋白赖氨酸和精氨酸甲基转移酶，G9a、SUV39H1、PRMT1和CARM1，仅表现出微弱或无活性。