6-(benzylamino)-5-nitropyrimidine-2,4(1H,3H)-dione | 343346-87-2

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机1,3-偶极化合物 - 烯丙基型1,3-偶极有机化合物
• 英文名称: 6-(benzylamino)-5-nitropyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
• 英文别名: 6-(benzylamino)-5-nitro-1H-pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 343346-87-2
• 化学式: C₁₁H₁₀N₄O₄
• 分子量: 262.225
• InChiKey: FJNSYYDHRAFITR-UHFFFAOYSA-N

物化性质

• 密度：
  1.49±0.1 g/cm3(Predicted)

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.3
• 重原子数：
  19
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.09
• 拓扑面积：
  116
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  5-硝基-6-氯嘧啶-2,4(1H,3H)-二酮 、 苄胺 在 三乙胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 为溶剂， 反应 12.0h， 以73%的产率得到6-(benzylamino)-5-nitropyrimidine-2,4(1H,3H)-dione
  参考文献：
  名称：

  Discovery and Development of a Small Molecule Library with Lumazine Synthase Inhibitory Activity

  摘要：

  (E)-5-硝基-6-(2-羟基丙二烯酰胺基)亚二噁嗪-2,4-(1H,3H)-双酮（编号9）通过对10万个化合物semble的高通量筛选，被识别为沙拉科斯角藻（Schizosaccharomyces pombe）亚胺合成都酶的新颖抑制剂。与结核菌（Mycobacterium tuberculosis）亚胺合成都酶的比结合位点（K_i）为95 μM。化合物9是亚胺合成都酶底物5-氨基-6-(D-inals-酰氨基)-2,4-(1H,3H)亚二噁嗪-双酮（编号1）的结构模拟物。这表明底物中的n-酰氨基侧链对酶的结合活性并非必不可少。通过系统修改第9号化合物的结构进行酶抑制活性优化，获得(E)-5-硝基-6-(4-硝基丙二烯酰胺基)亚二噁嗪-2,4-(1H,3H)-双酮（编号26）。其与结核菌亚胺合成都酶的比结合位点（K_i）为3.7 μM。

  DOI：

  10.1021/jo900238q

文献信息

• Discovery and Development of a Small Molecule Library with Lumazine Synthase Inhibitory Activity
  作者：Arindam Talukdar、Meghan Breen、Adelbert Bacher、Boris Illarionov、Markus Fischer、Gunda Georg、Qi-Zhuang Ye、Mark Cushman

  DOI：10.1021/jo900238q

  日期：2009.8.7

  (E)-5-Nitro-6-(2-hydroxystyryl)pyrimdine-2,4(1H,3H)-dione (9) was identified as a novel inhibitor of Schizosaccharomyces pombe lumazine synthase by high-throughput screening of a 100000 compound library. The K-i of 9 vs Mycobacterium tuberculosis lumazine synthase was 95 mu M. Compound 9 is a structural analogue of the lumazine synthase substrate 5-amino-6-(D-ribitylamino)-2,4-(1H,3H)pyrimidinedione (1). This indicates that the ribitylamino side chain of the substrate is not essential for binding to the enzyme. Optimization of the enzyme inhibitory activity through systematic structure modification of the lead compound 9 led to (E)-5-nitro-6-(4-nitrostyryl)pyrimidine-2,4(1H,3H)-dione (26), which has a K-i of 3.7 mu M vs M. tuberculosis lumazine synthase.

  (E)-5-硝基-6-(2-羟基丙二烯酰胺基)亚二噁嗪-2,4-(1H,3H)-双酮（编号9）通过对10万个化合物semble的高通量筛选，被识别为沙拉科斯角藻（Schizosaccharomyces pombe）亚胺合成都酶的新颖抑制剂。与结核菌（Mycobacterium tuberculosis）亚胺合成都酶的比结合位点（K_i）为95 μM。化合物9是亚胺合成都酶底物5-氨基-6-(D-inals-酰氨基)-2,4-(1H,3H)亚二噁嗪-双酮（编号1）的结构模拟物。这表明底物中的n-酰氨基侧链对酶的结合活性并非必不可少。通过系统修改第9号化合物的结构进行酶抑制活性优化，获得(E)-5-硝基-6-(4-硝基丙二烯酰胺基)亚二噁嗪-2,4-(1H,3H)-双酮（编号26）。其与结核菌亚胺合成都酶的比结合位点（K_i）为3.7 μM。