2-{3-[1-(5-carboxypentyl)-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl}-3,3-dimethyl-1-propyl-3H-indolium | 205815-13-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 2-{3-[1-(5-carboxypentyl)-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl}-3,3-dimethyl-1-propyl-3H-indolium
• 英文别名: 6-[2-[(E)-3-(3,3-dimethyl-1-propylindol-1-ium-2-yl)prop-2-enylidene]-3,3-dimethylindol-1-yl]hexanoic acid
• CAS: 205815-13-0；873202-32-5
• 化学式: C₃₂H₄₁N₂O₂
• 分子量: 485.69
• InChiKey: HKYGJNSVSCZOKS-UHFFFAOYSA-O

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  7
• 重原子数：
  36
• 可旋转键数：
  10
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  43.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-{3-[1-(5-carboxypentyl)-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl}-3,3-dimethyl-1-propyl-3H-indolium 、 N,N'-二琥珀酰亚胺基碳酸酯 在 吡啶 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.5h， 以96%的产率得到2-[3-(1,3-dihydro-3,3-dimethyl-1-propyl-2H-indol-2-ylidene)-1-propenyl]-1-[6-[(2,5-dioxo-1-pyrrolidinyl)oxy]-6-oxohexyl]-3,3-dimethyl-3H-indolium
  参考文献：
  名称：

  Practical syntheses of dyes for difference gel electrophoresis

  摘要：

  The three dyes (two indocyanine and one berizoxazolium) useful in difference gel electrophoresis-methyl Cy5 1, propyl Cy3 2, and the benzoxazolium dye Cy2 3-and their NHS esters have been prepared by efficient routes in good overall yield from inexpensive precursors. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2005.07.068
• 作为产物：
  描述：

  6-溴己酸 在 三乙胺 作用下， 以 乙醇 、 邻二氯苯 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 2-{3-[1-(5-carboxypentyl)-1,3-dihydro-3,3-dimethyl-2H-indol-2-ylidene]-1-propenyl}-3,3-dimethyl-1-propyl-3H-indolium
  参考文献：
  名称：

  Practical syntheses of dyes for difference gel electrophoresis

  摘要：

  The three dyes (two indocyanine and one berizoxazolium) useful in difference gel electrophoresis-methyl Cy5 1, propyl Cy3 2, and the benzoxazolium dye Cy2 3-and their NHS esters have been prepared by efficient routes in good overall yield from inexpensive precursors. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.

  DOI：

  10.1016/j.bmc.2005.07.068

文献信息

• Cyanine dyes
  申请人：Nycomed Amersham plc

  公开号：US06348599B1

  公开（公告）日：2002-02-19

  A cyanine dye having the structure has an overall positive charge greater than +1, by virtue of the presence of one to five positively charged N or P or S atoms, and also has a reactive or functional group by which it may be linked to a biomolecule or a solid surface.

  一种靛菁染料具有如下结构，由于存在一个到五个带正电荷的N、P或S原子，其总正电荷大于+1，并且还具有一个反应性或功能基团，可以将其连接到生物分子或固体表面。
• Practical syntheses of dyes for difference gel electrophoresis
  作者：Michael E. Jung、Wan-Joong Kim

  DOI：10.1016/j.bmc.2005.07.068

  日期：2006.1

  The three dyes (two indocyanine and one berizoxazolium) useful in difference gel electrophoresis-methyl Cy5 1, propyl Cy3 2, and the benzoxazolium dye Cy2 3-and their NHS esters have been prepared by efficient routes in good overall yield from inexpensive precursors. (c) 2005 Elsevier Ltd. All rights reserved.