5’-O-（4,4’-二甲氧基三苯甲基）-2’-O-叔丁基二甲基硅基尿苷 | 81246-80-2

分子结构分类

有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物

中文名称

5’-O-（4,4’-二甲氧基三苯甲基）-2’-O-叔丁基二甲基硅基尿苷

中文别名

1-((2R,3r,4r,5r)-5-((双(4-甲氧基苯基)(苯基)甲氧基)甲基)-3-((叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基)-4-羟基四氢呋喃-2-基)嘧啶-2,4(1h,3h)-二酮；2'-O-叔丁基二甲基硅烷-5'-O-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)尿苷

英文名称

5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tert-butyldimethylsilyl uridine

英文别名

5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine；5'-O-DMT-2'-TBDMS-Uridine；1-[(2R,3R,4R,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-hydroxyoxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione

CAS

81246-80-2

化学式

C₃₆H₄₄N₂O₈Si

mdl

——

分子量

660.839

InChiKey

KVHQIELPHWJPSY-WXQJYUTRSA-N

BEILSTEIN

——

EINECS

——

物化性质

密度：

1.24±0.1 g/cm3(Predicted)
溶解度：

DMSO：100 mg/mL（151.32 mM；需要超声波）

计算性质

辛醇/水分配系数(LogP)：

5.21
重原子数：

47
可旋转键数：

12
环数：

5.0
sp3杂化的碳原子比例：

0.39
拓扑面积：

116
氢给体数：

2
氢受体数：

8

安全信息

危险性防范说明：

P261,P305+P351+P338
危险性描述：

H302,H315,H319,H335
储存条件：

存储条件为2-8°C，并需保存在惰性气体中。

SDS

SDS：405b6f996d8122ae6b4ad638a8006bab

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制备方法与用途

5'-O-DMT-2'-TBDMS 尿苷是一种用于寡核苷酸合成的脱氧核苷酸。

上下游信息

上游原料

中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
5-O-(4,4-二甲氧基三苯甲基)-2-O-[(叔丁基)二甲基硅基]尿苷-3-(2-氰基乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺	5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine-3'-[(2-cyanoethyl)-(N,N-diisopropyl)]phosphoramidite	118362-03-1	C₄₅H₆₁N₄O₉PSi	861.06
5’-O-(4,4’-二甲氧基三苯甲基)尿苷	5'-dimethoxytrityluridine	81246-79-9	C₃₀H₃₀N₂O₈	546.577
2'-O-叔丁基二甲基硅烷基尿苷	2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine	54925-71-2	C₁₅H₂₆N₂O₆Si	358.467
尿嘧啶核苷	uridine	58-96-8	C₉H₁₂N₂O₆	244.204

下游产品

中文名称	英文名称	CAS号	化学式	分子量
——	5'-O-dimethoxytrityl-2'-O-tert-butyldimethylsilyluridine 3'-N,N-diisopropylmethyl phosphoramidite	114207-67-9	C₄₃H₆₀N₃O₉PSi	822.023
——	4-S-(2-cyanoethyl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-4-thiouridine	154665-03-9	C₃₉H₄₇N₃O₇SSi	729.97
5-O-(4,4-二甲氧基三苯甲基)-2-O-[(叔丁基)二甲基硅基]尿苷-3-(2-氰基乙基-N,N-二异丙基)亚磷酰胺	5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine-3'-[(2-cyanoethyl)-(N,N-diisopropyl)]phosphoramidite	118362-03-1	C₄₅H₆₁N₄O₉PSi	861.06
——	2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)-5'-O-(p,p'-dimethoxytrityl)uridine 3'-O-(allyl N,N-disopropylphosphoramidite)	185628-22-2	C₄₅H₆₂N₃O₉PSi	848.061
——	1-[(2R,3S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-oxooxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione	179026-52-9	C₃₆H₄₂N₂O₈Si	658.824
——	5′-O-(4,4-dimethoxytrityl)-2′-O-(tert-butyldimethylsilyl)-uridine 3′-N,N-dimethyl-S-(2,4-dichlorobenzyl)phosphorothioamidite	——	C₄₅H₅₄Cl₂N₃O₈PSSi	926.97
——	1-[(2R,3R,5S)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-(difluoromethylidene)oxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione	179026-54-1	C₃₇H₄₂F₂N₂O₇Si	692.832
——	5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridylyl (3'-5') 5'-amino-5'-deoxyuridine	182005-97-6	C₄₅H₅₆N₅O₁₅PSi	966.023
——	(R_p/S_p)-5'-O-(4,4'-dimethoxytrityl)-2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridylyl (3'-5')-5'-amino-5'-deoxyuridine methyl ester	——	C₄₆H₅₈N₅O₁₅PSi	980.05
2'-O-叔丁基二甲基硅烷基尿苷	2'-O-(tert-butyldimethylsilyl)uridine	54925-71-2	C₁₅H₂₆N₂O₆Si	358.467
——	[(2R,3R,4R,5R)-4-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl]oxy-N-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxopyrimidin-1-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methyl]phosphonamidic acid	182006-00-4	C₂₄H₃₈N₅O₁₃PSi	663.651
——	1-[2-O-(tert-butyldimethylsilyl)-β-D-erythro-pentofuran-3-ulosyl]uracil	162611-11-2	C₁₅H₂₄N₂O₆Si	356.451
尿苷酰基-(3',5')-尿苷	uridylyl-3',5'-uridine	2415-43-2	C₁₈H₂₃N₄O₁₄P	550.373
——	uridylyl (3'-5') 5'-amino-5'-deoxyuridine	182005-90-9	C₁₈H₂₄N₅O₁₃P	549.388

反应信息

作为反应物：