1-[(2R,3S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-oxooxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione | 179026-52-9

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 三苯基化合物
• 英文名称: 1-[(2R,3S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-oxooxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
• CAS: 179026-52-9
• 化学式: C₃₆H₄₂N₂O₈Si
• 分子量: 658.824
• InChiKey: FYQOXJGTMUWLJW-KTCJXSDQSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.42
• 重原子数：
  47
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  5.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  113
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-[(2R,3S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-oxooxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione 在 cerium(III) chloride 、 三氯乙酸 作用下， 以 四氢呋喃 、 乙醚 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 2.0h， 生成 1-[(2R,3R,4S,5R)-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)-4-prop-2-enyloxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  Stereoselective Preparation of 3'-C-Allyluridines and 3'-Spiro-gamma-Lactone Uridine Analogues.

  摘要：

  Grignard reactions of 3'-ketouridines 1a-c with allylmagnesium bromide and CeCl3 afforded novel 3'-C-allyluridines 2a-c and 3d-e. The diprotected 3'-keto nucleosides 1a-c afforded xylo-configurated compounds 2a-c and the 5'-unprotected 3'-keto nucleosides 1d-e afforded mixtures of xylo- and ribo-configurated compounds 2d/3d and 2e/3e. The allyluridine 2a was converted into the diol 4 by standard hydroboration and further oxidised to the 3'-spiro-gamma-lactone nucleoside 5. This compound and its deprotected analogue 6 are the first examples of a novel class of 3'-spiro nucleoside analogues.

  DOI：

  10.3891/acta.chem.scand.50-1030
• 作为产物：
  描述：

  5’-O-（4,4’-二甲氧基三苯甲基）-2’-O-叔丁基二甲基硅基尿苷 在 重铬酸吡啶 、 3 A molecular sieve 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 18.0h， 以86%的产率得到1-[(2R,3S,5R)-5-[[bis(4-methoxyphenyl)-phenylmethoxy]methyl]-3-[tert-butyl(dimethyl)silyl]oxy-4-oxooxolan-2-yl]pyrimidine-2,4-dione
  参考文献：
  名称：

  制备2'-和3'-二氟亚甲基尿苷的3'-和2'-亚磷酰胺的新方法

  摘要：

  尿苷2a，2b，7a和7b的2'-和3'-酮衍生物与溴代二氟甲基[三（二甲基氨基）] phosph溴化物（13）和锌的一步反应，得到相应的2'-和3'-二氟亚甲基核苷图3a，3b，8a和8b具有良好的产率。除去甲硅烷基基团得到二氟亚甲基化的尿苷4a，4b，9a和9b。4a和9a的磷酸化提供了用于寡核苷酸合成的目标2'-和3'-亚磷酰胺5和10。

  DOI：

  10.1016/0040-4020(96)00364-x

文献信息

• Direct Strand Scission in Double Stranded RNA via a C5-Pyrimidine Radical
  作者：Marino J. E. Resendiz、Venkata Pottiboyina、Michael D. Sevilla、Marc M. Greenberg

  DOI：10.1021/ja300044e

  日期：2012.2.29

  Nucleobase radicals are the major family of reactive intermediates produced when nucleic acids are exposed to γ-radiolysis. The 5,6-dihydrouridin-5-yl radical (1), the formal product of hydrogen atom addition and a model for hydroxyl radical addition, was independently generated from a ketone precursor via Norrish Type I photocleavage in single and double stranded RNA. Radical 1 produces direct strand

  核碱基自由基是核酸暴露于 γ-辐射分解时产生的反应性中间体的主要家族。5,6-二氢尿苷-5-基自由基 (1) 是氢原子加成的正式产物和羟基自由基加成的模型，是通过单链和双链 RNA 中的 Norrish I 型光裂解从酮前体独立生成的。自由基 1 在 5'-相邻核苷酸处产生直接链断裂，并且在自由基产生的初始位点仅观察到少量的链断裂。链断裂优先发生在双链 RNA 中，并且在没有 O(2) 的情况下发生。断链效率的依赖性来自 5，厌氧条件下二级结构上的 6-dihydrouridin-5-yl 自由基 (1) 表明这种反应性可能有助于从羟基自由基反应中提取额外的 RNA 结构信息。改变 5'-相邻核苷酸的身份对链断裂几乎没有影响。核苷酸间链断裂通过 3'-磷酸的 β-消除发生，随后 C2'-氢原子被 1 提取。随后形成的烯烃阳离子自由基产生含有 3'-磷酸或 3'-脱氧-2'-酮核苷酸末端的 RNA
• Synthesis and NMR Spectra of Some New Carbohydrate Modified Uridine Phosphoramidites
  作者：Pawel J. Serafinowski、Colin L. Barnes

  DOI：10.1080/07328319708006222

  日期：1997.7

  The one step reaction of 2'- and 3'-keto derivatives of uridine with bromodifluoromethyl[tris(dimethylamino)]phosphonium bromide and zinc gives the corresponding 2'- and 3'-difluoromethylene nucleosides in good yield. Desilylation and phosphitylation of the resultant 2'- or 3'-hydroxyls provides the target 2'- and 3'-phosphoramidites 7 and 8 for use in oligonucleotide synthesis(1).