Tert-butyl 2-(5-methoxy-2-methylindol-1-yl)acetate | 1221154-64-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: Tert-butyl 2-(5-methoxy-2-methylindol-1-yl)acetate
• CAS: 1221154-64-8
• 化学式: C₁₆H₂₁NO₃
• 分子量: 275.348
• InChiKey: BHOIZYYVLNRXJF-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.4
• 重原子数：
  20
• 可旋转键数：
  5
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.44
• 拓扑面积：
  40.5
• 氢给体数：
  0
• 氢受体数：
  3

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  Tert-butyl 2-(5-methoxy-2-methylindol-1-yl)acetate 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 0.5h， 以55%的产率得到2-(5-methoxy-2-methyl-1H-indol-1-yl)acetic acid
  参考文献：
  名称：

  片段连接中配体间奥豪泽效应的优化：在结核分枝杆菌泛酸合成酶抑制剂发现中的应用

  摘要：

  基于片段的方法是一种新兴的方法，用于发现作为潜在新治疗剂的蛋白质结合剂。迄今为止，已经探索了几种利用结构信息来指导抑制剂组装的方法。其中一种方法，即配体间 Overhauser 效应 (ILOE) 观察的应用特别令人感兴趣，因为它不需要 3D 蛋白质结构的可用性，并且是一种基于 NMR 的方法，可应用于无法检测到的目标。直接观察，因为它们的大小。片段作为小分子且通常是疏水性分子，存在一些问题，包括水环境中的化合物聚集和非特异性结合贡献，尤其是在适合 ILOE 观察的较高浓度筛选时。在这里，我们报告了如何通过应用逐步迭代程序来克服这个问题，该程序包括应用具有已知结合模式的优化探针分子来阐明片段的未知结合模式。以具有良好结合特征的酶底物为起点，使用来自 ILOE 观察的修饰片段的相对结合模式来指导片段连接，从而产生我们模型系统的有效抑制剂，结核分枝杆菌泛酸合成酶，潜在的药物靶点。我们用晶体结构支持我们的

  DOI：

  10.1021/ja100595u
• 作为产物：
  描述：

  5-甲氧基-2-甲基吲哚 、 溴乙酸叔丁酯 在 potassium carbonate 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 20.0h， 以49%的产率得到Tert-butyl 2-(5-methoxy-2-methylindol-1-yl)acetate
  参考文献：
  名称：

  片段连接中配体间奥豪泽效应的优化：在结核分枝杆菌泛酸合成酶抑制剂发现中的应用

  摘要：

  基于片段的方法是一种新兴的方法，用于发现作为潜在新治疗剂的蛋白质结合剂。迄今为止，已经探索了几种利用结构信息来指导抑制剂组装的方法。其中一种方法，即配体间 Overhauser 效应 (ILOE) 观察的应用特别令人感兴趣，因为它不需要 3D 蛋白质结构的可用性，并且是一种基于 NMR 的方法，可应用于无法检测到的目标。直接观察，因为它们的大小。片段作为小分子且通常是疏水性分子，存在一些问题，包括水环境中的化合物聚集和非特异性结合贡献，尤其是在适合 ILOE 观察的较高浓度筛选时。在这里，我们报告了如何通过应用逐步迭代程序来克服这个问题，该程序包括应用具有已知结合模式的优化探针分子来阐明片段的未知结合模式。以具有良好结合特征的酶底物为起点，使用来自 ILOE 观察的修饰片段的相对结合模式来指导片段连接，从而产生我们模型系统的有效抑制剂，结核分枝杆菌泛酸合成酶，潜在的药物靶点。我们用晶体结构支持我们的

  DOI：

  10.1021/ja100595u

文献信息

• Optimization of the Interligand Overhauser Effect for Fragment Linking: Application to Inhibitor Discovery against <i>Mycobacterium tuberculosis</i> Pantothenate Synthetase
  作者：Pawel Sledz、H. Leonardo Silvestre、Alvin W. Hung、Alessio Ciulli、Tom L. Blundell、Chris Abell

  DOI：10.1021/ja100595u

  日期：2010.4.7

  to elucidate the unknown binding modes of fragments. An enzyme substrate with well-characterized binding was used as a starting point, and the relative binding modes of modified fragments derived from ILOE observations were used to guide the fragment linking, leading to a potent inhibitor of our model system, Mycobacterium tuberculosis pantothenate synthetase, a potential drug target. We have supported

  基于片段的方法是一种新兴的方法，用于发现作为潜在新治疗剂的蛋白质结合剂。迄今为止，已经探索了几种利用结构信息来指导抑制剂组装的方法。其中一种方法，即配体间 Overhauser 效应 (ILOE) 观察的应用特别令人感兴趣，因为它不需要 3D 蛋白质结构的可用性，并且是一种基于 NMR 的方法，可应用于无法检测到的目标。直接观察，因为它们的大小。片段作为小分子且通常是疏水性分子，存在一些问题，包括水环境中的化合物聚集和非特异性结合贡献，尤其是在适合 ILOE 观察的较高浓度筛选时。在这里，我们报告了如何通过应用逐步迭代程序来克服这个问题，该程序包括应用具有已知结合模式的优化探针分子来阐明片段的未知结合模式。以具有良好结合特征的酶底物为起点，使用来自 ILOE 观察的修饰片段的相对结合模式来指导片段连接，从而产生我们模型系统的有效抑制剂，结核分枝杆菌泛酸合成酶，潜在的药物靶点。我们用晶体结构支持我们的