3-dehydrocarnityl CoA(3-)

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: 3-dehydrocarnityl CoA(3-)
• 英文别名: [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-2-[[[[(3R)-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4-oxo-4-[[3-oxo-3-[2-[3-oxo-4-(trimethylazaniumyl)butanoyl]sulfanylethylamino]propyl]amino]butoxy]-oxidophosphoryl]oxy-oxidophosphoryl]oxymethyl]oxolan-3-yl] phosphate
• 化学式: C28H44N8O18P3S-3
• 分子量: 905.7
• InChiKey: QNOIWONXQXNHSB-SVHODSNWSA-K

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -6
• 重原子数：
  58
• 可旋转键数：
  23
• 环数：
  3.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.68
• 拓扑面积：
  417
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  23

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-dehydrocarnityl CoA(3-) 、 coenzyme A 生成 (2R)-N-[3-(2-acetylsulfanylethylimino)-3-oxidopropyl]-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonatooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanimidate 、 N,N,N-trimethylglycyl-CoA(3-)
  参考文献：
  名称：

  铜绿假单胞菌肉碱分解代谢所需基因的鉴定。

  摘要：

  肉碱是一种普遍存在于动物组织中的季胺化合物，是病原体感染过程中潜在的碳、氮和能量来源。铜绿假单胞菌细胞裂解物中的活性表征先前表明，肉碱转化为 3-脱氢肉碱 (3-dhc)，后者又代谢为甘氨酸甜菜碱 (GB)，这是肉碱分解代谢为甘氨酸的中间代谢物。然而，肉碱分解代谢所需的酶的身份尚不清楚。我们使用铜绿假单胞菌 PA14 转座子突变体库的遗传筛选来鉴定肉碱生长所需的基因。我们确定了肉碱分解代谢所需的两个基因组区域及其相邻的转录调节因子。PA5388-PA5384 区域包含预测的 P。铜绿肉碱脱氢酶同系物以及在肉碱上生长所需的其他基因。确定的第二个区域 PA1999-PA2000 编码预测的 3-酮酸 CoA 转移酶的 α 和β 亚基，该酶活性被假设为参与 3-dhc 脱乙酰化的第一步。此外，我们证实在肉碱上生长需要完整的 GB 分解代谢途径。PA5389 和 PA1998 转录因子是在肉碱上生长所必需的。PA5389

  DOI：

  10.1099/mic.0.028787-0
• 作为产物：
  描述：

  3-deshydrocarnitine 、 (2R)-N-[3-(2-acetylsulfanylethylimino)-3-oxidopropyl]-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonatooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanimidate 生成 3-dehydrocarnityl CoA(3-) 、 乙酸盐
  参考文献：
  名称：

  铜绿假单胞菌肉碱分解代谢所需基因的鉴定。

  摘要：

  肉碱是一种普遍存在于动物组织中的季胺化合物，是病原体感染过程中潜在的碳、氮和能量来源。铜绿假单胞菌细胞裂解物中的活性表征先前表明，肉碱转化为 3-脱氢肉碱 (3-dhc)，后者又代谢为甘氨酸甜菜碱 (GB)，这是肉碱分解代谢为甘氨酸的中间代谢物。然而，肉碱分解代谢所需的酶的身份尚不清楚。我们使用铜绿假单胞菌 PA14 转座子突变体库的遗传筛选来鉴定肉碱生长所需的基因。我们确定了肉碱分解代谢所需的两个基因组区域及其相邻的转录调节因子。PA5388-PA5384 区域包含预测的 P。铜绿肉碱脱氢酶同系物以及在肉碱上生长所需的其他基因。确定的第二个区域 PA1999-PA2000 编码预测的 3-酮酸 CoA 转移酶的 α 和β 亚基，该酶活性被假设为参与 3-dhc 脱乙酰化的第一步。此外，我们证实在肉碱上生长需要完整的 GB 分解代谢途径。PA5389 和 PA1998 转录因子是在肉碱上生长所必需的。PA5389

  DOI：

  10.1099/mic.0.028787-0