3-(3-{(R)-2-tert-butoxycarbonylamino-2-[(S)-3-carbamoyl-1-(4-cyano-benzylcarbamoyl)-propylcarbamoyl]-ethyl}-1H-indol-5-yloxymethyl)benzoic acid methyl ester | 446845-88-1

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 3-(3-{(R)-2-tert-butoxycarbonylamino-2-[(S)-3-carbamoyl-1-(4-cyano-benzylcarbamoyl)-propylcarbamoyl]-ethyl}-1H-indol-5-yloxymethyl)benzoic acid methyl ester
• 英文别名: methyl 3-[[3-[(2R)-3-[[(2S)-5-amino-1-[(4-cyanophenyl)methylamino]-1,5-dioxopentan-2-yl]amino]-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonylamino]-3-oxopropyl]-1H-indol-5-yl]oxymethyl]benzoate
• CAS: 446845-88-1
• 化学式: C₃₈H₄₂N₆O₈
• 分子量: 710.787
• InChiKey: CLAKZKJUTGHZHG-AJQTZOPKSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  3.5
• 重原子数：
  52
• 可旋转键数：
  18
• 环数：
  4.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.32
• 拓扑面积：
  215
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  9

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(3-{(R)-2-tert-butoxycarbonylamino-2-[(S)-3-carbamoyl-1-(4-cyano-benzylcarbamoyl)-propylcarbamoyl]-ethyl}-1H-indol-5-yloxymethyl)benzoic acid methyl ester 在 三氟乙酸 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 1.0h， 以93%的产率得到3-(3-{(R)-2-amino-2-[(S)-3-carbamoyl-1-(4-cyano-benzylcarbamoyl)-propylcarbamoyl]-ethyl}-1H-indol-5-yloxymethyl)benzoic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Design and Synthesis of Peptidomimetic Factor VIIa Inhibitors

  摘要：

  选择性因子VIIa-组织因子复合物（FVIIa/TF）抑制被认为是开发新抗凝药物的一个有前景的靶点。在之前的报告中，我们描述了在化合物2的X射线晶体结构中发现的S3亚位点，该亚位点与FVIIa/可溶性组织因子（sTF）结合。基于X射线晶体结构信息，并旨在提高对FVIIa/TF的抑制活性及对其他丝氨酸蛋白酶的选择性，我们通过在化合物2的吲哚环的5位引入取代基合成了衍生物。其中，化合物16对其他丝氨酸蛋白酶显示了较高的选择性。与我们的预期相反，化合物16并未占据S3亚位点；X射线结构分析揭示，化合物16通过与Gln217、Thr99和Asn100形成氢键，提高了选择性。

  DOI：

  10.1248/cpb.58.38
• 作为产物：
  描述：

  [(R)-1-[(S)-3-carbamoyl-1-(4-cyano-benzylcarbamoyl)-propylcarbamoyl]-2-(5-hydroxy-1H-indol-3-yl)-ethyl]-carbamic acid tert-butyl ester 、 3-(溴甲基)苯甲酸甲酯 在 caesium carbonate 作用下， 以 丙酮 为溶剂， 反应 4.0h， 以84%的产率得到3-(3-{(R)-2-tert-butoxycarbonylamino-2-[(S)-3-carbamoyl-1-(4-cyano-benzylcarbamoyl)-propylcarbamoyl]-ethyl}-1H-indol-5-yloxymethyl)benzoic acid methyl ester
  参考文献：
  名称：

  Design and Synthesis of Peptidomimetic Factor VIIa Inhibitors

  摘要：

  选择性因子VIIa-组织因子复合物（FVIIa/TF）抑制被认为是开发新抗凝药物的一个有前景的靶点。在之前的报告中，我们描述了在化合物2的X射线晶体结构中发现的S3亚位点，该亚位点与FVIIa/可溶性组织因子（sTF）结合。基于X射线晶体结构信息，并旨在提高对FVIIa/TF的抑制活性及对其他丝氨酸蛋白酶的选择性，我们通过在化合物2的吲哚环的5位引入取代基合成了衍生物。其中，化合物16对其他丝氨酸蛋白酶显示了较高的选择性。与我们的预期相反，化合物16并未占据S3亚位点；X射线结构分析揭示，化合物16通过与Gln217、Thr99和Asn100形成氢键，提高了选择性。

  DOI：

  10.1248/cpb.58.38