(2R)-2-amino-4-oxopentanoate

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: (2R)-2-amino-4-oxopentanoate
• 英文别名: (2R)-2-azaniumyl-4-oxopentanoate
• 化学式: C5H9NO3
• 分子量: 131.13
• InChiKey: QUCHWTCTBHQQDU-SCSAIBSYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -3.7
• 重原子数：
  9
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  80.4
• 氢给体数：
  2
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  (2R)-N-[3-(2-acetylsulfanylethylimino)-3-oxidopropyl]-4-[[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-3-phosphonatooxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-hydroxyphosphoryl]oxy-2-hydroxy-3,3-dimethylbutanimidate 、 D-丙氨酸 生成 (2R)-2-amino-4-oxopentanoate 、 coenzyme A
  参考文献：
  名称：

  A Conserved Gene Cluster Rules Anaerobic Oxidative Degradation of l -Ornithine

  摘要：

  摘要 对于 70 多年前描述的鸟氨酸发酵途径，遗传和生化信息仍然不完整。在此，我们通过实验确定了这一代谢途径中最后四个缺失的基因。它们编码 l -鸟氨酸消旋酶、（2 R ,4 S )-2,4-二氨基戊酸脱氢酶，以及 2-氨基-4-酮戊酸硫醇酶的两个亚基。虽然只描述了 梭菌属 迄今为止，这种途径被证明更为普遍。

  DOI：

  10.1128/jb.01777-08

文献信息

• Ornithine degradation in Clostridium sticklandii. Pyridoxal phosphate and coenzyme A dependent thiolytic cleavage of 2-amino-4-ketopentanoate to alanine and acetyl coenzyme A
  作者：I. M. Jeng、R. Somack、H. A. Barker

  DOI：10.1021/bi00711a019

  日期：1974.7.1
• Tsuda Y.; Friedmann H.C., J Biol Chem, 1970, 0021-9258, 5914-26
  作者：Tsuda Y.、Friedmann H.C.

  DOI：——

  日期：——
• Somack R.; Costilow R.N., J Biol Chem, 1973, 0021-9258, 385-8
  作者：Somack R.、Costilow R.N.

  DOI：——

  日期：——
• A Conserved Gene Cluster Rules Anaerobic Oxidative Degradation of <scp>l</scp> -Ornithine
  作者：Nuria Fonknechten、Alain Perret、Nadia Perchat、Sabine Tricot、Christophe Lechaplais、David Vallenet、Carine Vergne、Anne Zaparucha、Denis Le Paslier、Jean Weissenbach、Marcel Salanoubat

  DOI：10.1128/jb.01777-08

  日期：2009.5

  For the ornithine fermentation pathway, described more than 70 years ago, genetic and biochemical information are still incomplete. We present here the experimental identification of the last four missing genes of this metabolic pathway. They encode l -ornithine racemase, (2 R ,4 S )-2,4-diaminopentanoate dehydrogenase, and the two subunits of 2-amino-4-ketopentanoate thiolase. While described only for the Clostridiaceae to date, this pathway is shown to be more widespread.

  摘要 对于 70 多年前描述的鸟氨酸发酵途径，遗传和生化信息仍然不完整。在此，我们通过实验确定了这一代谢途径中最后四个缺失的基因。它们编码 l -鸟氨酸消旋酶、（2 R ,4 S )-2,4-二氨基戊酸脱氢酶，以及 2-氨基-4-酮戊酸硫醇酶的两个亚基。虽然只描述了 梭菌属 迄今为止，这种途径被证明更为普遍。