N,N'-bis-(2-aminoethyl)-2-prop-2-ynylmalonamide | 910213-27-3

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: N,N'-bis-(2-aminoethyl)-2-prop-2-ynylmalonamide
• 英文别名: N,N'-bis(2-aminoethyl)-2-prop-2-ynylpropanediamide
• CAS: 910213-27-3
• 化学式: C₁₀H₁₈N₄O₂
• 分子量: 226.279
• InChiKey: NKTZKSZMWITABX-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -2.3
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  7
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.6
• 拓扑面积：
  110
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  4

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  N,N'-bis-(2-aminoethyl)-2-prop-2-ynylmalonamide 、 间苯二甲醛 以 甲醇 、 乙腈 为溶剂， 生成
  参考文献：
  名称：

  在炔烃官能化的聚氨基聚氨基配体中，单和双pH驱动的Cu2 +易位，并带有分子重排。

  摘要：

  一系列新的配体，包含一个（L1H（2）-L4H（2））或两个（L5H（4）-L6H（4））1,4,8,11-tetraaza-5,7-dione单元并进行了功能化已经合成了在C ＝ O部分之间的C原子上具有炔丙基的基团。在水中已经确定了配体的质子化常数及其Cu（2+）配合物的形成常数，并且通过耦合pH值和分光光度滴定法研究了在各种pH值下存在的配合物的配位几何形状。能够简单地吸收Cu（2+）并形成中性，方形平面复合物的配体，该复合物包含-2-电荷的二氨基二亚氨基供体，并且配体还包含能够单和双阳离子易位的配位基团（喹啉或吡啶）已被调查。关于Cu（2+）的络合和易位，已经研究了氨基上取代基的作用和炔丙基所起的结构作用。在双转运配体L6H（4）中，当两个Cu（2+）离子在二氨基二酰胺基供体组内移动时，细长的炔丙基基团可以使整个配体空前折叠，并带有一个吡啶的顶端配位，形成一个五坐标方形金字塔形Cu

  DOI：

  10.1002/chem.200501235
• 作为产物：
  描述：

  2-(2-丙炔-1-基)丙二酸二乙酯 、 乙二胺 反应 168000.0h， 以84%的产率得到N,N'-bis-(2-aminoethyl)-2-prop-2-ynylmalonamide
  参考文献：
  名称：

  在炔烃官能化的聚氨基聚氨基配体中，单和双pH驱动的Cu2 +易位，并带有分子重排。

  摘要：

  一系列新的配体，包含一个（L1H（2）-L4H（2））或两个（L5H（4）-L6H（4））1,4,8,11-tetraaza-5,7-dione单元并进行了功能化已经合成了在C ＝ O部分之间的C原子上具有炔丙基的基团。在水中已经确定了配体的质子化常数及其Cu（2+）配合物的形成常数，并且通过耦合pH值和分光光度滴定法研究了在各种pH值下存在的配合物的配位几何形状。能够简单地吸收Cu（2+）并形成中性，方形平面复合物的配体，该复合物包含-2-电荷的二氨基二亚氨基供体，并且配体还包含能够单和双阳离子易位的配位基团（喹啉或吡啶）已被调查。关于Cu（2+）的络合和易位，已经研究了氨基上取代基的作用和炔丙基所起的结构作用。在双转运配体L6H（4）中，当两个Cu（2+）离子在二氨基二酰胺基供体组内移动时，细长的炔丙基基团可以使整个配体空前折叠，并带有一个吡啶的顶端配位，形成一个五坐标方形金字塔形Cu

  DOI：

  10.1002/chem.200501235

文献信息

• Genome-wide mapping of DNA-DNA proximities in the nucleus
  申请人：University of Southern California

  公开号：US11359227B2

  公开（公告）日：2022-06-14

  Disclosed are methods and systems for determining the three-dimensional structure of chromatin in eukaryotic cells. More specifically, disclosed are methods and systems for obtaining chromatin structural information by surface immobilization that includes tethering crosslinked protein:DNA complexes and/or ligated DNA complexes to media such as beads, gels, and or matrices during the conformation capture assay. In general, the method includes flash freezing a cell such that the structural organization of the chromatin or other protein:DNA complexes is preserved, cryomilling the cell, producing cross-linked protein:DNA complexes by cutting the chromatin using a chemical, physical or enzymatic method, substantially immobilizing the cross-linked protein:DNA complexes, ligating the cross-linked protein:DNA complexes intramolecularly such that the ligated protein:DNA complexes represent structural organization of the chromatin; characterizing the ligated DNA by sequencing or other methods; and identifying any structural organization of the chromatin. The structural organization preferably includes information relating to interacting loci of the chromatin.

  公开了用于确定真核细胞中染色质三维结构的方法和系统。更具体地说，所公开的是通过表面固定化获得染色质结构信息的方法和系统，包括在构象捕获测定过程中将交联的蛋白质：DNA 复合物和/或连接的 DNA 复合物拴系到珠子、凝胶和或基质等介质上。一般来说，该方法包括闪速冷冻细胞，以保留染色质或其他蛋白质：DNA 复合物的结构组织；冷冻细胞；使用化学、物理或酶方法切割染色质，产生交联的蛋白质：DNA 复合物；将交联的蛋白质：DNA 复合物基本固定；将交联的蛋白质：DNA 复合物连接到基质上：DNA复合物，将交联的蛋白质：DNA复合物在分子内连接，使连接的蛋白质：DNA复合物代表染色质的结构组织；通过测序或其他方法对连接的DNA进行表征；以及鉴定染色质的任何结构组织。结构组织最好包括与染色质相互作用位点有关的信息。
• GENOME-WIDE MAPPING OF DNA-DNA PROXIMITIES IN THE NUCLEUS
  申请人：University of Southern California

  公开号：US20200071746A1

  公开（公告）日：2020-03-05

  Disclosed are methods and systems for determining the three-dimensional structure of chromatin in eukaryotic cells. More specifically, disclosed are methods and systems for obtaining chromatin structural information by surface immobilization that includes tethering crosslinked protein:DNA complexes and/or ligated DNA complexes to media such as beads, gels, and or matrices during the conformation capture assay. In general, the method includes flash freezing a cell such that the structural organization of the chromatin or other protein:DNA complexes is preserved, cryomilling the cell, producing cross-linked protein:DNA complexes by cutting the chromatin using a chemical, physical or enzymatic method, substantially immobilizing the cross-linked protein:DNA complexes, ligating the cross-linked protein:DNA complexes intramolecularly such that the ligated protein:DNA complexes represent structural organization of the chromatin; characterizing the ligated DNA by sequencing or other methods; and identifying any structural organization of the chromatin. The structural organization preferably includes information relating to interacting loci of the chromatin.
• Single and Double pH-Driven Cu2+ Translocation with Molecular Rearrangement in Alkyne-Functionalized Polyamino Polyamido Ligands
  作者：Annalisa Aurora、Massimo Boiocchi、Giacomo Dacarro、Francesco Foti、Carlo Mangano、Piersandro Pallavicini、Stefano Patroni、Angelo Taglietti、Robertino Zanoni

  DOI：10.1002/chem.200501235

  日期：2006.7.17

  complex have been determined by X-ray diffraction. Finally, oxidation of Cu(2+) to Cu(3+) has been studied by cyclic voltammetry in water, which revealed that the redox reaction occurs only when the copper cation is within the diamino-diimido compartment. Moreover, both functionalization of the primary amines with bulky substituents and apical coordination of Cu(2+) make access to the 3+ oxidation state

  一系列新的配体，包含一个（L1H（2）-L4H（2））或两个（L5H（4）-L6H（4））1,4,8,11-tetraaza-5,7-dione单元并进行了功能化已经合成了在C ＝ O部分之间的C原子上具有炔丙基的基团。在水中已经确定了配体的质子化常数及其Cu（2+）配合物的形成常数，并且通过耦合pH值和分光光度滴定法研究了在各种pH值下存在的配合物的配位几何形状。能够简单地吸收Cu（2+）并形成中性，方形平面复合物的配体，该复合物包含-2-电荷的二氨基二亚氨基供体，并且配体还包含能够单和双阳离子易位的配位基团（喹啉或吡啶）已被调查。关于Cu（2+）的络合和易位，已经研究了氨基上取代基的作用和炔丙基所起的结构作用。在双转运配体L6H（4）中，当两个Cu（2+）离子在二氨基二酰胺基供体组内移动时，细长的炔丙基基团可以使整个配体空前折叠，并带有一个吡啶的顶端配位，形成一个五坐标方形金字塔形Cu