N-[(2S,7S)-1,8-bis[(2S)-2-[[(2S)-1-(3-aminopropylamino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-7-[(2-ethylquinoline-3-carbonyl)amino]-1,8-dioxooctan-2-yl]-2-ethylquinoline-3-carboxamide | 1100749-13-0

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: N-[(2S,7S)-1,8-bis[(2S)-2-[[(2S)-1-(3-aminopropylamino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-7-[(2-ethylquinoline-3-carbonyl)amino]-1,8-dioxooctan-2-yl]-2-ethylquinoline-3-carboxamide
• CAS: 1100749-13-0
• 化学式: C₆₆H₈₂N₁₂O₈
• 分子量: 1171.45
• InChiKey: MSQQORDVCUQWDZ-BMFARTNFSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  6.2
• 重原子数：
  86
• 可旋转键数：
  29
• 环数：
  8.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.42
• 拓扑面积：
  293
• 氢给体数：
  8
• 氢受体数：
  12

反应信息

• 作为产物：
  描述：

  N-[(2S)-1-[(2S)-2-[[(2S)-1-(3-aminopropylamino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-1-oxopent-4-en-2-yl]-2-ethylquinoline-3-carboxamide 在 RuCl2(1,3-dimesityl-imidazolidin-2-yl)(PCy3)(=CHPh) 、 platinum on activated charcoal 、 氢气 作用下， 以 二氯甲烷 、 1,2-二氯乙烷 为溶剂， 反应 30.0h， 生成 N-[(2S,7S)-1,8-bis[(2S)-2-[[(2S)-1-(3-aminopropylamino)-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-7-[(2-ethylquinoline-3-carbonyl)amino]-1,8-dioxooctan-2-yl]-2-ethylquinoline-3-carboxamide
  参考文献：
  名称：

  Nucleic acid binding compounds and methods of use

  摘要：

  本发明涉及由两个单体之间的二硫键、亚砜硫或烯烃键形成的同源和异源二聚体化合物。还公开了一种制备同源或异源二聚体化合物的方法。本发明还涉及能够形成同源或异源二聚体化合物的单体化合物，以及通过连接一个或多个二聚体形成的寡聚物。还公开了一种抑制目标RNA分子活性的方法，特别是那些具有包括茎或茎环形成的次级结构的RNA分子。公开了能够抑制HIV-I RNA移码茎环和(CUG)n扩展重复茎环活性的二聚体化合物，以及治疗与这些目标RNA分子相关疾病的方法。这些二聚体化合物还可以用于选择性地检测样本中目标RNA分子的存在。

  公开号：

  US09212205B2

文献信息

• Strategies for Recognition of Stem−Loop RNA Structures by Synthetic Ligands: Application to the HIV-1 Frameshift Stimulatory Sequence
  作者：Prakash B. Palde、Leslie O. Ofori、Peter C. Gareiss、Jaclyn Lerea、Benjamin L. Miller

  DOI：10.1021/jm100231t

  日期：2010.8.26

  Production of the Gag-Pol polyprotein in human immunodeficiency virus (HIV) requires a -1 ribosomal frameshift, which is directed by a highly conserved RNA stern-loop. Building on our discovery of a set of disulfide-containing peptides that bind this RNA, we describe medicinal chemistry efforts designed to begin to understand the structure-activity relationships and RNA sequence-selectivity relationships associated with these compounds. Additionally, we have prepared analogues incorporating an olefin or saturated hydrocarbon bioisostere of the disulfide moiety, as a first step toward enhancing biostability. The olefin-containing compounds exhibit affinity comparable to the lead disulfide and, importantly, have no discernible toxicity when incubated with human fibroblasts at concentrations up to 1 mM.