固相肽库筛选,然后延伸前导识别元件以使用溶液相筛选结合到dsDNA序列(IL6的NF结合位点),从而交付了新的DNA结合肽Ac-Arg-Ual-Sar-Chi-Chi- Tal-Arg-CONH2。在本研究中,使用溴化乙锭置换试验研究了不同氨基酸侧链对肽与dsDNA结合强度的贡献。基于这些结果,通过反卷积优化了前导结构。在取代Ual-Sar片段的七肽的两个位置评估了八个新的非天然氨基酸。在这两个位置分别使用([(3-氯苯基)甲基]氨基]乙酸(Cbg)和β-环己基-1-丙氨酸(Cha)观察到最强的dsDNA结合。与Ual-Sar序列相比,亲和力增加了10倍。通过将新开发的肽片段与具有柔性间隔基的an啶衍生物连接的杂合分子,进一步增强了dsDNA的结合。这导致对dsDNA靶标的亲和力在microM范围内(K(d)为2.1 x 10(-6)M)。带有新开发的寡肽基序的DNase I足迹表明存在明
固相肽库筛选,然后延伸前导识别元件以使用溶液相筛选结合到dsDNA序列(IL6的NF结合位点),从而交付了新的DNA结合肽Ac-Arg-Ual-Sar-Chi-Chi- Tal-Arg-CONH2。在本研究中,使用溴化乙锭置换试验研究了不同氨基酸侧链对肽与dsDNA结合强度的贡献。基于这些结果,通过反卷积优化了前导结构。在取代Ual-Sar片段的七肽的两个位置评估了八个新的非天然氨基酸。在这两个位置分别使用([(3-氯苯基)甲基]氨基]乙酸(Cbg)和β-环己基-1-丙氨酸(Cha)观察到最强的dsDNA结合。与Ual-Sar序列相比,亲和力增加了10倍。通过将新开发的肽片段与具有柔性间隔基的an啶衍生物连接的杂合分子,进一步增强了dsDNA的结合。这导致对dsDNA靶标的亲和力在microM范围内(K(d)为2.1 x 10(-6)M)。带有新开发的寡肽基序的DNase I足迹表明存在明