4-(3-Ethoxycarbonyl-propylamino)-butyric acid ethyl ester | 500309-48-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机酸及其衍生物 - 羧酸及其衍生物
• 英文名称: 4-(3-Ethoxycarbonyl-propylamino)-butyric acid ethyl ester
• 英文别名: Ethyl 4-[(4-ethoxy-4-oxobutyl)amino]butanoate
• CAS: 500309-48-8
• 化学式: C₁₂H₂₃NO₄
• 分子量: 245.319
• InChiKey: HBVXGGBUVIAOSY-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  0.9
• 重原子数：
  17
• 可旋转键数：
  12
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.83
• 拓扑面积：
  64.6
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(3-Ethoxycarbonyl-propylamino)-butyric acid ethyl ester 在 sodium hydroxide 、 molecular sieve 、 PL-EDC 、 O-(1H-benzotriazol-1-yl)-N,N,N',N'-tetramethyluronium hexafluorophosphate 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 甲醇 、 氯仿 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 23.0h， 生成 4-[[3-(2,5-Dioxo-pyrrolidin-1-yloxycarbonyl)-propyl]-(3-{2-[2-(2-{2-[5-((3aR,6S,6aS)-2-oxo-hexahydro-thieno[3,4-d]imidazol-6-yl)-pentanoylamino]-ethoxy}-ethoxy)-ethoxy]-ethoxy}-propionyl)-amino]-butyric acid 2,5-dioxo-pyrrolidin-1-yl ester
  参考文献：
  名称：

  一种新型蛋白质交联剂，用于通过质谱（MS3-D）测定中等分辨率的蛋白质结构。

  摘要：

  最近公开了一种确定中等分辨率的蛋白质结构的新方法，称为3维MS3-D-质谱。该方法包括在蛋白质表面的反应性残基之间形成共价交联键，通过质谱法确定这些交联键在一级序列空间中的位置，然后在距离过程中对各个侧链的位置施加距离限制蛋白质结构的几何计算。MS3-D快速，需要少量蛋白质，并且可以在天然生化条件下工作。因此，它提供了以高通量方式确定生物体表达的所有蛋白质的结构的潜力。然而，该方法完全依赖于化学交联的产生，并且可用交联剂的技术局限性已被证明在确定完整蛋白质组结构的方法的一般化和自动化方面存在问题。本文介绍的是新型模块化蛋白质交联剂的设计，合成和校对，旨在提高亲水性，为MS3-D提供更高的有效信噪比，并允许在此过程中对各种侧链进行采样。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2003.10.043
• 作为产物：
  描述：

  4-溴丁酸乙酯 在 palladium on activated charcoal 盐酸 、 氢气 、 potassium carbonate 作用下， 以 甲醇 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 49.5h， 生成 4-(3-Ethoxycarbonyl-propylamino)-butyric acid ethyl ester
  参考文献：
  名称：

  一种新型蛋白质交联剂，用于通过质谱（MS3-D）测定中等分辨率的蛋白质结构。

  摘要：

  最近公开了一种确定中等分辨率的蛋白质结构的新方法，称为3维MS3-D-质谱。该方法包括在蛋白质表面的反应性残基之间形成共价交联键，通过质谱法确定这些交联键在一级序列空间中的位置，然后在距离过程中对各个侧链的位置施加距离限制蛋白质结构的几何计算。MS3-D快速，需要少量蛋白质，并且可以在天然生化条件下工作。因此，它提供了以高通量方式确定生物体表达的所有蛋白质的结构的潜力。然而，该方法完全依赖于化学交联的产生，并且可用交联剂的技术局限性已被证明在确定完整蛋白质组结构的方法的一般化和自动化方面存在问题。本文介绍的是新型模块化蛋白质交联剂的设计，合成和校对，旨在提高亲水性，为MS3-D提供更高的有效信噪比，并允许在此过程中对各种侧链进行采样。

  DOI：

  10.1016/j.bmcl.2003.10.043

文献信息

• US5760221A
  申请人：——

  公开号：US5760221A

  公开（公告）日：1998-06-02
• A novel protein crosslinking reagent for the determination of moderate resolution protein structures by mass spectrometry (MS3-D)
  作者：Naoaki Fujii、Richard B. Jacobsen、Nichole L. Wood、Joseph S. Schoeniger、R.Kiplin Guy

  DOI：10.1016/j.bmcl.2003.10.043

  日期：2004.1

  distance geometry calculations of protein structure. MS3-D is rapid, requires small amounts of protein, and works in native biochemical conditions. Therefore, it offers the potential for determination of the structures of all proteins expressed by an organism in a high throughput manner. However, the methodology is completely dependent upon the production of chemical crosslinks and technical limitations of

  最近公开了一种确定中等分辨率的蛋白质结构的新方法，称为3维MS3-D-质谱。该方法包括在蛋白质表面的反应性残基之间形成共价交联键，通过质谱法确定这些交联键在一级序列空间中的位置，然后在距离过程中对各个侧链的位置施加距离限制蛋白质结构的几何计算。MS3-D快速，需要少量蛋白质，并且可以在天然生化条件下工作。因此，它提供了以高通量方式确定生物体表达的所有蛋白质的结构的潜力。然而，该方法完全依赖于化学交联的产生，并且可用交联剂的技术局限性已被证明在确定完整蛋白质组结构的方法的一般化和自动化方面存在问题。本文介绍的是新型模块化蛋白质交联剂的设计，合成和校对，旨在提高亲水性，为MS3-D提供更高的有效信噪比，并允许在此过程中对各种侧链进行采样。