methyl 3-[(5-{[(1H-indol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-indol-2-yl)carbonyl]-1-(chloromethyl)-5-hydroxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate | 190060-44-7

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: methyl 3-[(5-{[(1H-indol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-indol-2-yl)carbonyl]-1-(chloromethyl)-5-hydroxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate
• 英文别名: methyl (8R)-8-(chloromethyl)-4-hydroxy-6-[5-(1H-indole-2-carbonylamino)-1H-indole-2-carbonyl]-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate
• CAS: 190060-44-7
• 化学式: C₃₁H₂₄ClN₅O₅
• 分子量: 582.015
• InChiKey: MOEGMHDKYLEVOO-KRWDZBQOSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.1
• 重原子数：
  42
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.13
• 拓扑面积：
  143
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  methyl 3-[(5-{[(1H-indol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-indol-2-yl)carbonyl]-1-(chloromethyl)-5-hydroxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate 在 sodium hydride 作用下， 以 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 1.5h， 以85%的产率得到methyl 3-[(5-{[(1H-indol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-indol-2-yl)carbonyl]-4-oxo-1,2,8,8a-tetrahydrocyclopropa[c]pyrrolo[3,2-e]indol-6-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Duocarmycin SA 缩短、简化和扩展的药物：对 DNA 结合亚基作用的系统检查

  摘要：

  描述了对 duocarmycin SA 的缩短、简化和扩展类似物的检查，并构成了对连接的 DNA 结合亚基作用的详细研究。除了通过小沟非共价接触增强 DNA 结合亲和力和选择性外，这些研究与随附文章的研究一起表明，DNA 烷基化反应的催化需要扩展的刚性 N2 酰胺取代基。DNA 烷基化的这种激活与 pH 无关，我们认为它是由结合诱导的试剂构象变化引起的，这增加了它们的固有反应性。底物的基态不稳定是由连接酰胺中的扭曲引起的，该扭曲破坏了烷基化亚基的乙烯基酰胺稳定性并激活了亲核加成试剂。

  DOI：

  10.1021/ja9637208
• 作为产物：
  描述：

  ent-(-)-methyl 2-((tert-butyloxy)carbonyl)-4-oxo-1,2,4,5,8,8a-hexahydrocyclopropapyrrolo<3,2-e>indole-6-carboxylate 在 盐酸 、 盐酸-N-乙基-Nˊ-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺 作用下， 以 乙酸乙酯 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 12.5h， 生成 methyl 3-[(5-{[(1H-indol-2-yl)carbonyl]amino}-1H-indol-2-yl)carbonyl]-1-(chloromethyl)-5-hydroxy-1,2-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-7-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Duocarmycin SA 缩短、简化和扩展的药物：对 DNA 结合亚基作用的系统检查

  摘要：

  描述了对 duocarmycin SA 的缩短、简化和扩展类似物的检查，并构成了对连接的 DNA 结合亚基作用的详细研究。除了通过小沟非共价接触增强 DNA 结合亲和力和选择性外，这些研究与随附文章的研究一起表明，DNA 烷基化反应的催化需要扩展的刚性 N2 酰胺取代基。DNA 烷基化的这种激活与 pH 无关，我们认为它是由结合诱导的试剂构象变化引起的，这增加了它们的固有反应性。底物的基态不稳定是由连接酰胺中的扭曲引起的，该扭曲破坏了烷基化亚基的乙烯基酰胺稳定性并激活了亲核加成试剂。

  DOI：

  10.1021/ja9637208

文献信息

• MINOR GROOVE BINDER PHOSPHORAMIDITES AND METHODS OF USE
  申请人：Vorobiev Alexei

  公开号：US20130030166A1

  公开（公告）日：2013-01-31

  Minor groove binder phosphoramidites having unique structures have been synthesized according to particular methods. These minor groove binder phosphoramidites are useful in the preparation of oligonucleotide conjugates, particularly those for use as probes and primers.

  根据特定方法合成了具有独特结构的小沟结合剂磷酰胺酰胺。这些小沟结合剂磷酰胺酰胺在制备寡核苷酸共轭物中很有用，特别是用作探针和引物的情况。
• US9056887B2
  申请人：——

  公开号：US9056887B2

  公开（公告）日：2015-06-16
• Duocarmycin SA Shortened, Simplified, and Extended Agents:  A Systematic Examination of the Role of the DNA Binding Subunit
  作者：Dale L. Boger、Donald L. Hertzog、Bernd Bollinger、Douglas S. Johnson、Hui Cai、Joel Goldberg、Philip Turnbull

  DOI：10.1021/ja9637208

  日期：1997.5.1

  analogs of duocarmycin SA is described and constitutes a detailed study of the role of linked DNA binding subunit. In addition to enhancing the DNA binding affinity and selectivity through minor groove noncovalent contacts, the studies in conjunction with those of the accompanying article illustrate that an extended rigid N2 amide substituent is required for catalysis of the DNA alkylation reaction. This

  描述了对 duocarmycin SA 的缩短、简化和扩展类似物的检查，并构成了对连接的 DNA 结合亚基作用的详细研究。除了通过小沟非共价接触增强 DNA 结合亲和力和选择性外，这些研究与随附文章的研究一起表明，DNA 烷基化反应的催化需要扩展的刚性 N2 酰胺取代基。DNA 烷基化的这种激活与 pH 无关，我们认为它是由结合诱导的试剂构象变化引起的，这增加了它们的固有反应性。底物的基态不稳定是由连接酰胺中的扭曲引起的，该扭曲破坏了烷基化亚基的乙烯基酰胺稳定性并激活了亲核加成试剂。