3-(1-methyl-1H-indol-5-yl)propanoic acid | 1522217-08-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 3-(1-methyl-1H-indol-5-yl)propanoic acid
• 英文别名: 3-(1-methylindol-5-yl)propanoic acid
• CAS: 1522217-08-8
• 化学式: C₁₂H₁₃NO₂
• 分子量: 203.241
• InChiKey: GKUYQCYUCLRPSP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  1.8
• 重原子数：
  15
• 可旋转键数：
  3
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.25
• 拓扑面积：
  42.2
• 氢给体数：
  1
• 氢受体数：
  2

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  4-(3,5-dimethylisoxazol-4-yl)-N1-(2-morpholinoethyl)benzene-1,2-diamine 、 3-(1-methyl-1H-indol-5-yl)propanoic acid 在 1-丙基磷酸酐 、 N,N-二异丙基乙胺 作用下， 以 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 16.0h， 以56%的产率得到5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-2-[2-(1-methyl-1H-indol-5-yl)ethyl]-1-[2-(morpholin-4-yl)ethyl]-1H-benzimidazole
  参考文献：
  名称：

  CBP/p300 溴结构域小分子配体的发现和优化

  摘要：

  缺乏针对溴结构域和末端外 (BET) 亚家族之外的溴结构域的小分子抑制剂。在这里，我们描述了人类赖氨酸乙酰转移酶 CBP/p300 溴结构域模块的高效和选择性配体，由一系列 5-异恶唑基苯并咪唑开发而成。我们的出发点是片段命中，使用 Suzuki 偶联、苯并咪唑形成反应和还原胺化的平行合成将其优化为更有效和选择性更强的先导化合物。使用热稳定性测定法研究了先导化合物对其他溴结构域家族成员的选择性，结果显示对结构相关的 BET 家族成员有一些抑制作用。为了解决 BET 选择性问题，与 CREB ​​结合蛋白 (CBP) 和 BRD4 的第一个溴结构域 (BRD4(1)) 结合的先导化合物的 X 射线晶体结构用于指导更具选择性的化合物的设计。获得的晶体结构揭示了两种不同的结合模式。通过改变芳基取代模式和开发构象受限的类似物，增加了 CBP 超过 BRD4(1) 的选择性。优化后的化合物具有高效 (Kd

  DOI：

  10.1021/ja412434f

文献信息

• Discovery of an MLLT1/3 YEATS Domain Chemical Probe
  作者：Moses Moustakim、Thomas Christott、Octovia P. Monteiro、James Bennett、Charline Giroud、Jennifer Ward、Catherine M. Rogers、Paul Smith、Ioanna Panagakou、Laura Díaz-Sáez、Suet Ling Felce、Vicki Gamble、Carina Gileadi、Nadia Halidi、David Heidenreich、Apirat Chaikuad、Stefan Knapp、Kilian V. M. Huber、Gillian Farnie、Jag Heer、Nenad Manevski、Gennady Poda、Rima Al-awar、Darren J. Dixon、Paul E. Brennan、Oleg Fedorov

  DOI：10.1002/anie.201810617

  日期：2018.12.10

  YEATS domain (YD) containing proteins are an emerging class of epigenetic targets in drug discovery. Dysregulation of these modified lysine-binding proteins has been linked to the onset and progression of cancers. We herein report the discovery and characterisation of the first small-molecule chemical probe, SGC-iMLLT, for the YD of MLLT1 (ENL/YEATS1) and MLLT3 (AF9/YEATS3). SGC-iMLLT is a potent and

  包含YEATS域（YD）的蛋白质是药物发现中新兴的表观遗传学目标。这些修饰的赖氨酸结合蛋白的失调与癌症的发生和发展有关。我们在此报告了针对MLLT1（ENL / YEATS1）和MLLT3（AF9 / YEATS3）的YD的第一个小分子化学探针SGC-iMLLT的发现和表征。SGC-iMLLT是一种有效且选择性的MLLT1 / 3-组蛋白相互作用抑制剂。观察到对其他人类YD蛋白（YEATS2 / 4）和溴结构域具有出色的选择性。此外，我们的探针显示了MLLT1和MLLT3的细胞靶标接合。还报道了具有MLLT1 YD的第一个小分子X射线共晶体结构。
• US6972296B2
  申请人：——

  公开号：US6972296B2

  公开（公告）日：2005-12-06
• Discovery and Optimization of Small-Molecule Ligands for the CBP/p300 Bromodomains
  作者：Duncan A. Hay、Oleg Fedorov、Sarah Martin、Dean C. Singleton、Cynthia Tallant、Christopher Wells、Sarah Picaud、Martin Philpott、Octovia P. Monteiro、Catherine M. Rogers、Stuart J. Conway、Timothy P. C. Rooney、Anthony Tumber、Clarence Yapp、Panagis Filippakopoulos、Mark E. Bunnage、Susanne Müller、Stefan Knapp、Christopher J. Schofield、Paul E. Brennan

  DOI：10.1021/ja412434f

  日期：2014.7.2

  compound bound to the CREB binding protein (CBP) and the first bromodomain of BRD4 (BRD4(1)) were used to guide the design of more selective compounds. The crystal structures obtained revealed two distinct binding modes. By varying the aryl substitution pattern and developing conformationally constrained analogues, selectivity for CBP over BRD4(1) was increased. The optimized compound is highly potent (Kd

  缺乏针对溴结构域和末端外 (BET) 亚家族之外的溴结构域的小分子抑制剂。在这里，我们描述了人类赖氨酸乙酰转移酶 CBP/p300 溴结构域模块的高效和选择性配体，由一系列 5-异恶唑基苯并咪唑开发而成。我们的出发点是片段命中，使用 Suzuki 偶联、苯并咪唑形成反应和还原胺化的平行合成将其优化为更有效和选择性更强的先导化合物。使用热稳定性测定法研究了先导化合物对其他溴结构域家族成员的选择性，结果显示对结构相关的 BET 家族成员有一些抑制作用。为了解决 BET 选择性问题，与 CREB ​​结合蛋白 (CBP) 和 BRD4 的第一个溴结构域 (BRD4(1)) 结合的先导化合物的 X 射线晶体结构用于指导更具选择性的化合物的设计。获得的晶体结构揭示了两种不同的结合模式。通过改变芳基取代模式和开发构象受限的类似物，增加了 CBP 超过 BRD4(1) 的选择性。优化后的化合物具有高效 (Kd