1-(β-D-ribofuranosyl)hexahydropyrimidin-2-one | 19149-48-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 核苷、核苷酸和类似物 - 嘧啶核苷
• 英文名称: 1-(β-D-ribofuranosyl)hexahydropyrimidin-2-one
• 英文别名: 1-<β-D-Ribofuranosyl>-tetrahydro-pyrimidin-2(1H)-on；Zebularine；4-deoxytetrahydrouridine；NSC153788；1-β-D-ribofuranosyl-tetrahydro-pyrimidin-2-one；1-β-D-ribofuranosyl-tetrahydro-2(1H)pyrimidinone；1-(3,4-Dihydroxy-5-hydroxymethyl-tetrahydro-furan-2-yl)-tetrahydro-pyrimidin-2-one；1-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-1,3-diazinan-2-one
• CAS: 19149-48-5
• 化学式: C₉H₁₆N₂O₅
• 分子量: 232.236
• InChiKey: RUEVGIQZRMULBN-WCTZXXKLSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -1.8
• 重原子数：
  16
• 可旋转键数：
  2
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.89
• 拓扑面积：
  102
• 氢给体数：
  4
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  1-(β-D-ribofuranosyl)hexahydropyrimidin-2-one 在 HCl buffer 作用下， 生成 1-(β-D-ribopyranosyl)hexahydropyrimidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  还原的嘧啶和环状脲核糖苷的呋喃糖-吡喃糖异构化。

  摘要：

  四氢尿苷（THU，2）和其他完全还原的环状脲核呋喃糖基核苷经历了快速的酸催化异构化，形成更稳定的核吡喃糖基形式。这种异构化的特征在于光谱特性的变化，以及对于以核呋喃糖形式充当胞苷脱氨酶的有效抑制剂的那些核苷，其效力下降幅度超过10倍。合成了1-（β-D-核吡喃糖基）六氢嘧啶-2-酮（7），并与其呋喃糖异构体6一起用作模型化合物，用于更广泛的1H和13C NMR，质谱和该异构化的动力学研究。在1H NMR光谱中，吡喃糖异头质子的J1'，2'耦合常数的0.4δ高场位移和J1'，2'耦合常数的4-Hz增大表示吡喃糖β-CI构象，其中糖苷配基和C-2' C-4'羟基是赤道的。三甲基甲硅烷基吡喃糖核苷的质谱图还显示了m / z 204-217丰度的特征性大位移，以及在M-133和M-206出现了两个新的重排离子。对于呋喃糖6，异构化速率取决于pH和温度，其中吡喃糖7占主导地位，平衡系数为6-9。在pH

  DOI：

  10.1021/jm00161a034
• 作为产物：
  描述：

  1-(2,3,5-tri-O-benzoyl-β-D-ribofuranosyl)-1,2-dihydropyrimidin-2-one 在 palladium on activated charcoal 氨 、 氢气 作用下， 以 甲醇 、 乙醇 、 氯仿 为溶剂， 25.0 ℃ 、275.79 kPa 条件下， 反应 29.0h， 生成 1-(β-D-ribofuranosyl)hexahydropyrimidin-2-one
  参考文献：
  名称：

  环状脲核苷。胞苷脱氨酶活性随糖苷酸环大小的变化而变化。

  摘要：

  合成了五种β-D-呋喃呋喃糖基环状脲核苷（14-18），其环大小为五至八元，并被评估为胞苷脱氨酶（CDA）抑制剂。在含有仅提供β-端基异构体的HgO / HgBr2混合物的比催化活性下，通过缩合反应利用前体保护的核苷（9-13），该缩合反应是利用硅烷化的脲与卤代糖。已知的1-（2,3,5-三-O-苯甲酰基-β-呋喃呋喃糖基）-1,2-二氢嘧啶-2-酮（19）的催化加氢提供与通过汞催化的缩合步骤获得的核苷10相同。CDA活性随尿素糖苷配基的环大小变化而显着变化，达到七元类似物16和17的最大水平。核苷17的意想不到的高效能（Ki = 2.5 X 10（-8）M，人肝酶）的报道。该化合物代表尚未发现的最有效的人类肝脏CDA抑制剂。

  DOI：

  10.1021/jm00138a003

文献信息

• Organic compounds and process
  申请人：The Upjohn Company

  公开号：US04017606A1

  公开（公告）日：1977-04-12

  Novel hydrogenated pyrimidine nucleosides and nucleotides are produced by catalytic hydrogenation, particularly in the presence of a rhodium catalyst. The novel compounds are specifically used to inhibit deaminating enzymes, which would inactivate cytosine arabinoside by conversion to uridine arabinoside. Cytosine arabinoside is used for its anti-viral, particularly anti-herpes and anticytotoxic activity in mammals and birds, as well as to destroy phages which interfere with the production of antibiotics. Novel formulations containing cytosine arabinoside and the hydrogenated pyrimidine nucleosides are advantageous to provide prolonged cytosine arabinoside effects.

  新型氢化嘧啶核苷和核苷酸是通过催化氢化制备的，特别是在铑催化剂的存在下。这些新型化合物专门用于抑制脱氨酶，该酶会将胞嘧啶阿拉伯核苷转化为尿嘧啶阿拉伯核苷，从而使得胞嘧啶阿拉伯核苷失活。胞嘧啶阿拉伯核苷用于其抗病毒作用，尤其是对抗疱疹病毒和抗细胞毒作用，在哺乳动物和鸟类中也用于消灭干扰抗生素生产的噬菌体。含有胞嘧啶阿拉伯核苷和氢化嘧啶核苷的新型配方有利于提供持久的胞嘧啶阿拉伯核苷效果。
• US4017606A
  申请人：——

  公开号：US4017606A

  公开（公告）日：1977-04-12
• Cyclic urea nucleosides. Cytidine deaminase activity as a function of aglycon ring size
  作者：Paul S. Liu、Victor E. Marquez、John S. Driscoll、Richard W. Fuller、John J. McCormack

  DOI：10.1021/jm00138a003

  日期：1981.6

  by the mercury-catalyzed condensation procedure. CDA activity varies significantly with the ring size of the urea aglycon the reaches its maximum level for the seven-membered analogues 16 and 17. The unexpected high potency of nucleoside 17 (Ki = 2.5 X 10(-8) M, human liver enzyme) is reported. This compound represents the most potent inhibitor of human liver CDA yet discovered.

  合成了五种β-D-呋喃呋喃糖基环状脲核苷（14-18），其环大小为五至八元，并被评估为胞苷脱氨酶（CDA）抑制剂。在含有仅提供β-端基异构体的HgO / HgBr2混合物的比催化活性下，通过缩合反应利用前体保护的核苷（9-13），该缩合反应是利用硅烷化的脲与卤代糖。已知的1-（2,3,5-三-O-苯甲酰基-β-呋喃呋喃糖基）-1,2-二氢嘧啶-2-酮（19）的催化加氢提供与通过汞催化的缩合步骤获得的核苷10相同。CDA活性随尿素糖苷配基的环大小变化而显着变化，达到七元类似物16和17的最大水平。核苷17的意想不到的高效能（Ki = 2.5 X 10（-8）M，人肝酶）的报道。该化合物代表尚未发现的最有效的人类肝脏CDA抑制剂。
• Furanose-pyranose isomerization of reduced pyrimidine and cyclic urea ribosides
  作者：James A. Kelley、John S. Driscoll、John J. McCormack、Jeri S. Roth、Victor E. Marquez

  DOI：10.1021/jm00161a034

  日期：1986.11

  synthesized and used in conjunction with its furanose isomer 6 as a model compound for more extensive 1H and 13C NMR, mass spectral, and kinetic studies of this isomerization. The 0.4 delta upfield shift and 4-Hz increase in the J1',2' coupling constant for the pyranose anomeric proton in the 1H NMR spectrum is indicative of a pyranose beta-CI conformation in which the aglycon and C-2' and C-4' hydroxyls

  四氢尿苷（THU，2）和其他完全还原的环状脲核呋喃糖基核苷经历了快速的酸催化异构化，形成更稳定的核吡喃糖基形式。这种异构化的特征在于光谱特性的变化，以及对于以核呋喃糖形式充当胞苷脱氨酶的有效抑制剂的那些核苷，其效力下降幅度超过10倍。合成了1-（β-D-核吡喃糖基）六氢嘧啶-2-酮（7），并与其呋喃糖异构体6一起用作模型化合物，用于更广泛的1H和13C NMR，质谱和该异构化的动力学研究。在1H NMR光谱中，吡喃糖异头质子的J1'，2'耦合常数的0.4δ高场位移和J1'，2'耦合常数的4-Hz增大表示吡喃糖β-CI构象，其中糖苷配基和C-2' C-4'羟基是赤道的。三甲基甲硅烷基吡喃糖核苷的质谱图还显示了m / z 204-217丰度的特征性大位移，以及在M-133和M-206出现了两个新的重排离子。对于呋喃糖6，异构化速率取决于pH和温度，其中吡喃糖7占主导地位，平衡系数为6-9。在pH