3-(N-hydroxy-2-phenylacetamido)propyl phosphonic acid | 1116412-20-4

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯和取代衍生物
• 英文名称: 3-(N-hydroxy-2-phenylacetamido)propyl phosphonic acid
• 英文别名: 3-[Hydroxy-(2-phenylacetyl)amino]propylphosphonic acid；3-[hydroxy-(2-phenylacetyl)amino]propylphosphonic acid
• CAS: 1116412-20-4
• 化学式: C₁₁H₁₆NO₅P
• 分子量: 273.226
• InChiKey: XFWAXDKPSOXCDG-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -0.6
• 重原子数：
  18
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  1.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.36
• 拓扑面积：
  98.1
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  5

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  3-(N-hydroxy-2-phenylacetamido)propyl phosphonic acid 在 sodium hydroxide 作用下， 以 水 为溶剂， 生成 sodium hydrogen 3-(N-hydroxy-2-phenylacetamido)propylphosphonate
  参考文献：
  名称：

  Design of potential bisubstrate inhibitors against Mycobacterium tuberculosis (Mtb) 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate reductoisomerase (Dxr)—evidence of a novel binding mode

  摘要：

  在大多数细菌中，非梅瓦隆酸途径用于合成异构烯单位。该途径的第二步是Dxr，它催化NADPH依赖的1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸（DXP）转化为2-C-甲基-D-赤藓糖-4-磷酸（MEP）的还原异构化反应。Dxr受到天然产品fosmidomycin和FR900098的抑制，这些化合物与DXP结合位点结合。这些化合物虽然是Dxr的强效抑制剂，但由于其极性，缺乏对结核分枝杆菌（Mtb）的全细胞活性。我们的目标是利用Mtb Dxr-fosmidomycin共晶结构设计双底物配体，以同时结合DXP和NADPH位点。这类化合物预计由于其增强的疏水性而表现出更好的全细胞活性。设计并合成了两系列化合物。两系列中的化合物均抑制Mtb Dxr。最强效的化合物（8）的IC50为17.8 µM。分析表明，化合物8通过一种新颖的非双底物机制与Mtb Dxr结合。此外，化合物8的二乙酯抑制了Mtb的生长，这使得这一类化合物成为寻找新抗结核药物的有趣领先分子。

  DOI：

  10.1039/c3md00085k
• 作为产物：
  描述：

  diethyl 3-(N-hydroxy-2-phenylacetamido)propylphosphonate 在 三甲基溴硅烷 作用下， 以 二氯甲烷 为溶剂， 反应 9.0h， 以63%的产率得到3-(N-hydroxy-2-phenylacetamido)propyl phosphonic acid
  参考文献：
  名称：

  强大的单取代和双取代的磷霉素类似物对DXR的抑制作用

  摘要：

  抗疟药磷酰胺霉素靶向DXR，该酶催化MEP途径中第一个关键步骤，产生必需的类异戊二烯前体，异戊烯基二磷酸酯和二甲基烯丙基二磷酸酯。MEP途径被多种病原体所利用，包括结核分枝杆菌和apicomplexan寄生虫，并且不同于人类必需的经典甲羟戊酸途径。使用基于结构的方法，我们设计了许多磷酰胺霉素类似物，包括在Cα和异羟肟酸酯位置上均被取代的一系列类似物。事实证明，后者是设计抑制剂的稳定框架，该抑制剂从极性和局促的（因此不易药物化）底物结合位点延伸，并且可以首次桥接底物和辅因子结合位点。就在体外试验中杀死恶性疟原虫而言，许多这类化合物比磷霉素更有效。最好的IC 50为40 nM。

  DOI：

  10.1021/jm4006498

文献信息

• COMPOUNDS FOR INHIBITING 1-DEOXY-D-XYLULOSE-5-PHOSPHATE REDUCTOISOMERASE
  申请人：Boshoff Helena I.

  公开号：US20140378418A1

  公开（公告）日：2014-12-25

  In particular, the compound is effective to inhibit Dxr in Mycobacterium tuberculosis (Mtb). The present invention relates to compounds having general formula (I) or (II) where X is an acidic group, such as carboxylate, phosphonate, sulfate, and tetrazole; Ar is a substituted or unsubstituted aromatic or heteroaromatic group; and n is 0, 1, 2, 3, or 4, preferably 2, 3, or 4. The compounds inhibits 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase (Dxr), particularly Dxr in Mycobacterium tuberculosis (Mtb).

  特别地，该化合物对于抑制结核分枝杆菌（Mtb）中的Dxr具有有效性。本发明涉及具有通式（I）或（II）的化合物，其中X是酸性基团，如羧酸盐、膦酸盐、硫酸盐和四唑基；Ar是取代或未取代的芳香或杂环芳香基团；n为0、1、2、3或4，优选为2、3或4。该化合物抑制1-脱氧-D-木糖-5-磷酸还原异构酶（Dxr），特别是在结核分枝杆菌（Mtb）中的Dxr。
• US9593136B2
  申请人：——

  公开号：US9593136B2

  公开（公告）日：2017-03-14
• Design of potential bisubstrate inhibitors against Mycobacterium tuberculosis (Mtb) 1-deoxy-d-xylulose 5-phosphate reductoisomerase (Dxr)—evidence of a novel binding mode
  作者：Géraldine San Jose、Emily R. Jackson、Eugene Uh、Chinchu Johny、Amanda Haymond、Lindsay Lundberg、Chelsea Pinkham、Kylene Kehn-Hall、Helena I. Boshoff、Robin D. Couch、Cynthia S. Dowd

  DOI：10.1039/c3md00085k

  日期：——

  In most bacteria, the nonmevalonate pathway is used to synthesize isoprene units. Dxr, the second step in the pathway, catalyzes the NADPH-dependent reductive isomerization of 1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate (DXP) to 2-C-methyl-D-erythritol-4-phosphate (MEP). Dxr is inhibited by natural products fosmidomycin and FR900098, which bind in the DXP binding site. These compounds, while potent inhibitors of Dxr, lack whole cell activity against Mycobacterium tuberculosis (Mtb) due to their polarity. Our goal was to use the Mtb Dxr-fosmidomycin co-crystal structure to design bisubstrate ligands to bind to both the DXP and NADPH sites. Such compounds would be expected to demonstrate improved whole cell activity due to increased lipophilicity. Two series of compounds were designed and synthesized. Compounds from both series inhibited Mtb Dxr. The most potent compound (8) has an IC50 of 17.8 μM. Analysis shows 8 binds to Mtb Dxr via a novel, non-bisubstrate mechanism. Further, the diethyl ester of 8 inhibits Mtb growth making this class of compounds interesting lead molecules in the search for new antitubercular agents.

  在大多数细菌中，非梅瓦隆酸途径用于合成异构烯单位。该途径的第二步是Dxr，它催化NADPH依赖的1-脱氧-D-木酮糖-5-磷酸（DXP）转化为2-C-甲基-D-赤藓糖-4-磷酸（MEP）的还原异构化反应。Dxr受到天然产品fosmidomycin和FR900098的抑制，这些化合物与DXP结合位点结合。这些化合物虽然是Dxr的强效抑制剂，但由于其极性，缺乏对结核分枝杆菌（Mtb）的全细胞活性。我们的目标是利用Mtb Dxr-fosmidomycin共晶结构设计双底物配体，以同时结合DXP和NADPH位点。这类化合物预计由于其增强的疏水性而表现出更好的全细胞活性。设计并合成了两系列化合物。两系列中的化合物均抑制Mtb Dxr。最强效的化合物（8）的IC50为17.8 µM。分析表明，化合物8通过一种新颖的非双底物机制与Mtb Dxr结合。此外，化合物8的二乙酯抑制了Mtb的生长，这使得这一类化合物成为寻找新抗结核药物的有趣领先分子。
• DXR Inhibition by Potent Mono- and Disubstituted Fosmidomycin Analogues
  作者：Anna M. Jansson、Anna Więckowska、Christofer Björkelid、Samir Yahiaoui、Sanjeewani Sooriyaarachchi、Martin Lindh、Terese Bergfors、Shyamraj Dharavath、Matthieu Desroses、Surisetti Suresh、Mounir Andaloussi、Rautela Nikhil、Sharma Sreevalli、Bachally R. Srinivasa、Mats Larhed、T. Alwyn Jones、Anders Karlén、Sherry L. Mowbray

  DOI：10.1021/jm4006498

  日期：2013.8.8

  including Mycobacterium tuberculosis and apicomplexan parasites, and differs from the classical mevalonate pathway that is essential in humans. Using a structure-based approach, we designed a number of analogues of fosmidomycin, including a series that are substituted in both the Cα and the hydroxamate positions. The latter proved to be a stable framework for the design of inhibitors that extend from the

  抗疟药磷酰胺霉素靶向DXR，该酶催化MEP途径中第一个关键步骤，产生必需的类异戊二烯前体，异戊烯基二磷酸酯和二甲基烯丙基二磷酸酯。MEP途径被多种病原体所利用，包括结核分枝杆菌和apicomplexan寄生虫，并且不同于人类必需的经典甲羟戊酸途径。使用基于结构的方法，我们设计了许多磷酰胺霉素类似物，包括在Cα和异羟肟酸酯位置上均被取代的一系列类似物。事实证明，后者是设计抑制剂的稳定框架，该抑制剂从极性和局促的（因此不易药物化）底物结合位点延伸，并且可以首次桥接底物和辅因子结合位点。就在体外试验中杀死恶性疟原虫而言，许多这类化合物比磷霉素更有效。最好的IC 50为40 nM。