2-(4-nitrophenyl)ethyl 3-(pyrrolo[4,5-e]indolin-7-ylcarbonyl)pyrrolo[4,5-e]indoline-7-carboxylate | 344436-41-5

• 分子结构分类: 有机化合物 - 有机杂环化合物 - 吲哚及其衍生物
• 英文名称: 2-(4-nitrophenyl)ethyl 3-(pyrrolo[4,5-e]indolin-7-ylcarbonyl)pyrrolo[4,5-e]indoline-7-carboxylate
• 英文别名: 2-(4-nitrophenyl)ethyl 6-(3,6,7,8-tetrahydropyrrolo[3,2-e]indole-2-carbonyl)-7,8-dihydro-3H-pyrrolo[3,2-e]indole-2-carboxylate
• CAS: 344436-41-5
• 化学式: C₃₀H₂₅N₅O₅
• 分子量: 535.559
• InChiKey: DSRFQSQFKIAVHP-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  5.6
• 重原子数：
  40
• 可旋转键数：
  6
• 环数：
  7.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.2
• 拓扑面积：
  136
• 氢给体数：
  3
• 氢受体数：
  6

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  2-(4-nitrophenyl)ethyl 3-(pyrrolo[4,5-e]indolin-7-ylcarbonyl)pyrrolo[4,5-e]indoline-7-carboxylate 、 2,3,4,5,6-pentafluorophenyl 3-[4-({3-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxy]-propyl}{4-[(2-chloro-4-nitrophenyl)diazenyl]phenyl}amino)butanoyl]-pyrrolo[4,5-e]indoline-7-carboxylate 在 三乙胺 作用下， 以 DMF (N,N-dimethyl-formamide) 为溶剂， 以90%的产率得到2-(4-Nitrophenyl)ethyl 3-{[3-({3-[4-({3-[bis(4-methoxyphenyl)phenylmethoxy ]propyl}{4-[(2-chloro-4-nitrophenyl)diazenyl]phenyl}amino)butanoyl]pyrrolo[4,5-e]indolin-7-yl}carbonyl)pyrrolo[4,5-e]indolin-7-yl]carbonyl}pyrrolo[4,5-e]indoline-7-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Fluorescent quenching detection reagents and methods

  摘要：

  寡核苷酸-荧光素-猝灭剂共轭物，其中荧光素部分的发射波长在大约300到800纳米范围内，或者猝灭剂包括取代的4-(苯基重氮基)苯胺结构，在杂交和相关测定中提供了改善的信噪比和其他有利特性。这些寡核苷酸-荧光素-猝灭剂共轭物可以通过利用基于取代的4-(苯基重氮基)苯胺结构的新型磷酸酰胺试剂合成，或者利用基于取代香豆素、取代7-羟基-3H-苯并噁唑-3-酮或取代5,10-二氢-10-[苯基]吡啶[2,3-d;6,5-d']二嘧啶-2,4,6,8-(1H,3H,7H,9H,10H)-四酮结构的新型磷酸酰胺试剂合成。包括吡咯并[4,5-e]吲哚-7-基)吡咯并[4,5-e]吲哚-7-基)吡咯并[4,5-e]吲哚-7-羧酸酯(DPI3)部分作为次生沟结合剂和取代的4-(苯基重氮基)苯胺部分作为猝灭剂的寡核苷酸-荧光素-猝灭剂-次生沟结合剂共轭物已经合成，并具有显着改善的杂交和信噪比特性。

  公开号：

  US06699975B2
• 作为产物：
  描述：

  2-(4-nitrophenyl)ethyl 3-({3-[(tert-butyl)oxycarbonyl]pyrrolo[4,5-e]indolin-7-yl}carbonyl)pyrrolo[4,5-e]indoline-7-carboxylate 在 三氟乙酸 作用下， 反应 1.5h， 以100%的产率得到2-(4-nitrophenyl)ethyl 3-(pyrrolo[4,5-e]indolin-7-ylcarbonyl)pyrrolo[4,5-e]indoline-7-carboxylate
  参考文献：
  名称：

  Fluorescent quenching detection reagents and methods

  摘要：

  寡核苷酸-荧光素-猝灭剂共轭物，其中荧光素部分的发射波长在大约300到800纳米范围内，或者猝灭剂包括取代的4-(苯基重氮基)苯胺结构，在杂交和相关测定中提供了改善的信噪比和其他有利特性。这些寡核苷酸-荧光素-猝灭剂共轭物可以通过利用基于取代的4-(苯基重氮基)苯胺结构的新型磷酸酰胺试剂合成，或者利用基于取代香豆素、取代7-羟基-3H-苯并噁唑-3-酮或取代5,10-二氢-10-[苯基]吡啶[2,3-d;6,5-d']二嘧啶-2,4,6,8-(1H,3H,7H,9H,10H)-四酮结构的新型磷酸酰胺试剂合成。包括吡咯并[4,5-e]吲哚-7-基)吡咯并[4,5-e]吲哚-7-基)吡咯并[4,5-e]吲哚-7-羧酸酯(DPI3)部分作为次生沟结合剂和取代的4-(苯基重氮基)苯胺部分作为猝灭剂的寡核苷酸-荧光素-猝灭剂-次生沟结合剂共轭物已经合成，并具有显着改善的杂交和信噪比特性。

  公开号：

  US06699975B2

文献信息

• FLUORESCENT PROBES FOR DNA DETECTION BY HYBRIDIZATION WITH IMPROVED SENSITIVITY AND LOW BACKGROUND
  申请人：Lokhov Sergey

  公开号：US20080293586A1

  公开（公告）日：2008-11-27

  Minor groove binder-oligonucleotide probes are provided along with methods for their use wherein the probes have an attached fluorophore which, in an unhybridized form exhibits very low background signal.

  提供了微小沟结合剂寡核苷酸探针以及其使用方法，其中探针具有附加的荧光物质，未杂交形式的荧光物质信号非常低。
• FLUORESCENT QUENCHING DETECTING REAGENTS AND METHODS
  申请人：Reed Michael W.

  公开号：US20100174058A1

  公开（公告）日：2010-07-08

  Oligonucleotide probes containing two labels are provided and are useful in hybridization assays. The probes can also contain a minor groove binding group.

  提供了含有两个标签的寡核苷酸探针，适用于杂交检测。这些探针还可以包含一个次级沟结合基团。
• FLUORESCENT QUENCHING DETECTION REAGENTS AND METHODS
  申请人：Epoch Biosciences, Inc.

  公开号：EP1235938A2

  公开（公告）日：2002-09-04
• EP1430147A4
  申请人：——

  公开号：EP1430147A4

  公开（公告）日：2008-06-25
• US6653473B2
  申请人：——

  公开号：US6653473B2

  公开（公告）日：2003-11-25