pentafluorophenyl 1-[3-[N-(tert-butyloxycarbonyl)amino]propyl]-4-nitro-2-pyrrolecarboxylate | 427877-51-8

• 分子结构分类: 有机化合物 - 苯类化合物 - 苯酚酯
• 英文名称: pentafluorophenyl 1-[3-[N-(tert-butyloxycarbonyl)amino]propyl]-4-nitro-2-pyrrolecarboxylate
• CAS: 427877-51-8
• 化学式: C₁₉H₁₈F₅N₃O₆
• 分子量: 479.36
• InChiKey: PJFBUBKHQAVUCH-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  4.23
• 重原子数：
  33.0
• 可旋转键数：
  7.0
• 环数：
  2.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.37
• 拓扑面积：
  112.7
• 氢给体数：
  1.0
• 氢受体数：
  7.0

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  pentafluorophenyl 1-[3-[N-(tert-butyloxycarbonyl)amino]propyl]-4-nitro-2-pyrrolecarboxylate 在 palladium on activated charcoal 氢气 、 碳酸氢钠 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 乙醇 、 乙酸乙酯 为溶剂， 反应 24.0h， 生成 4-Amino-1-(3-tert-butoxycarbonylamino-propyl)-1H-pyrrole-2-carboxylic acid pentafluorophenyl ester
  参考文献：
  名称：

  通过新型的微型鹅口疮识别亚皮摩尔浓度的DNA小沟中的九个碱基对序列。

  摘要：

  通过分光光度滴定法和热熔研究研究了新型microgonotropen L1的dsDNA相互作用。微小角戊二烯由连接至基本侧链的DNA小沟结合部分组成，该部分能够伸出小沟并抓住酸性DNA磷酸二酯主链。使用固相化学合成L1。L1显示出将九个富含A / T碱基对的结合位点与具有少于九个连续的A / T碱基对的位点区分开。此外，L1以亚皮摩尔浓度结合其优选的dsDNA序列。L1的9个碱基对富含A / T的dsDNA结合位点的络合（K（1））的平衡常数约为10（13）M（-1）。单碱基对A / T-> L1的九个碱基对富含A / T的结合位点内的G / C取代使DNA结合的平衡常数降低1-2个数量级。L1的三个丙胺侧链将试剂的结合自由能提高了5 kcal以上。分子建模表明，L1呈“螺旋状”构象，几乎适合整个DNA螺旋结构。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(01)00272-3
• 作为产物：
  描述：

  1-(3-tert-butoxycarbonylaminopropyl)-4-nitro-1H-pyrrole-2-carboxylic acid ethyl ester 在 sodium hydroxide 、 N,N'-二环己基碳二亚胺 作用下， 以 1,4-二氧六环 、 水 、 N,N-二甲基甲酰胺 为溶剂， 反应 0.5h， 生成 pentafluorophenyl 1-[3-[N-(tert-butyloxycarbonyl)amino]propyl]-4-nitro-2-pyrrolecarboxylate
  参考文献：
  名称：

  通过新型的微型鹅口疮识别亚皮摩尔浓度的DNA小沟中的九个碱基对序列。

  摘要：

  通过分光光度滴定法和热熔研究研究了新型microgonotropen L1的dsDNA相互作用。微小角戊二烯由连接至基本侧链的DNA小沟结合部分组成，该部分能够伸出小沟并抓住酸性DNA磷酸二酯主链。使用固相化学合成L1。L1显示出将九个富含A / T碱基对的结合位点与具有少于九个连续的A / T碱基对的位点区分开。此外，L1以亚皮摩尔浓度结合其优选的dsDNA序列。L1的9个碱基对富含A / T的dsDNA结合位点的络合（K（1））的平衡常数约为10（13）M（-1）。单碱基对A / T-> L1的九个碱基对富含A / T的结合位点内的G / C取代使DNA结合的平衡常数降低1-2个数量级。L1的三个丙胺侧链将试剂的结合自由能提高了5 kcal以上。分子建模表明，L1呈“螺旋状”构象，几乎适合整个DNA螺旋结构。

  DOI：

  10.1016/s0968-0896(01)00272-3