bisucaberin B

• 分子结构分类: 有机化合物 - 脂质和类脂质分子 - 脂肪酰基
• 英文名称: bisucaberin B
• 英文别名: 4-[5-[[4-(5-Aminopentylamino)-4-oxobutanoyl]-hydroxyamino]pentyl-hydroxyamino]-4-oxobutanoic acid；4-[5-[[4-(5-aminopentylamino)-4-oxobutanoyl]-hydroxyamino]pentyl-hydroxyamino]-4-oxobutanoic acid
• 化学式: C₁₈H₃₄N₄O₇
• 分子量: 418.491
• InChiKey: WYJBRAYCUYLRLL-UHFFFAOYSA-N

计算性质

• 辛醇/水分配系数(LogP)：
  -4.2
• 重原子数：
  29
• 可旋转键数：
  17
• 环数：
  0.0
• sp3杂化的碳原子比例：
  0.78
• 拓扑面积：
  174
• 氢给体数：
  5
• 氢受体数：
  8

反应信息

• 作为反应物：
  描述：

  bisucaberin B 、 三甲基硅烷化重氮甲烷 以 甲醇 、 正己烷 为溶剂， 反应 3.0h， 生成
  参考文献：
  名称：

  Bisucaberin B, a Linear Hydroxamate Class Siderophore from the Marine Bacterium Tenacibaculum mesophilum

  摘要：

  从帕劳共和国采集的海洋海绵中分离出的嗜中性天牛细菌（Tenacibaculum mesophilum）中分离出了一种苷元，命名为双琥珀苷 B。通过光谱和化学方法，明确确定了双琥珀酰 B（1）的结构，它是一种线性二聚羟酰胺类苷酸盐。尽管化合物 1 是已知大环二聚体双葫芦巴苷（2）的开放形式，而且以前曾被描述为去铁胺 B 的细菌降解产物（4），但本报告首次描述了 1 的全新生物合成过程。据我们所知，化合物 1 是第一个从属于类杆菌门的细菌中分离出来的具有化学特征的苷元。

  DOI：

  10.3390/molecules18043917

文献信息

• Bisucaberin B, a Linear Hydroxamate Class Siderophore from the Marine Bacterium Tenacibaculum mesophilum
  作者：Masaki Fujita、Koji Nakano、Ryuichi Sakai

  DOI：10.3390/molecules18043917

  日期：——

  A siderophore, named bisucaberin B, was isolated from Tenacibaculum mesophilum bacteria separated from a marine sponge collected in the Republic of Palau. Using spectroscopic and chemical methods, the structure of bisucaberin B (1) was clearly determined to be a linear dimeric hydroxamate class siderophore. Although compound 1 is an open form of the known macrocyclic dimer bisucaberin (2), and was previously described as a bacterial degradation product of desferrioxamine B (4), the present report is the first description of the de novo biosynthesis of 1. To the best of our knowledge, compound 1 is the first chemically characterized siderophore isolated from a bacterium belonging to the phylum Bacteroidetes.

  从帕劳共和国采集的海洋海绵中分离出的嗜中性天牛细菌（Tenacibaculum mesophilum）中分离出了一种苷元，命名为双琥珀苷 B。通过光谱和化学方法，明确确定了双琥珀酰 B（1）的结构，它是一种线性二聚羟酰胺类苷酸盐。尽管化合物 1 是已知大环二聚体双葫芦巴苷（2）的开放形式，而且以前曾被描述为去铁胺 B 的细菌降解产物（4），但本报告首次描述了 1 的全新生物合成过程。据我们所知，化合物 1 是第一个从属于类杆菌门的细菌中分离出来的具有化学特征的苷元。